MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 plasmid pMEFER01

Total Repeats: 15

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013157	ATCAA	2	10	2817	2826	60 %	20 %	0 %	20 %	256811524
2	NC_013157	AATCA	2	10	3592	3601	60 %	20 %	0 %	20 %	256811527
3	NC_013157	TTTAA	2	10	4641	4650	40 %	60 %	0 %	0 %	256811529
4	NC_013157	CATGG	2	10	5640	5649	20 %	20 %	40 %	20 %	256811530
5	NC_013157	ATTCA	2	10	6064	6073	40 %	40 %	0 %	20 %	256811530
6	NC_013157	CAACT	2	10	7513	7522	40 %	20 %	0 %	40 %	256811531
7	NC_013157	AACTT	2	10	7662	7671	40 %	40 %	0 %	20 %	256811531
8	NC_013157	CCTCT	2	10	9509	9518	0 %	40 %	0 %	60 %	256811534
9	NC_013157	CATGC	2	10	11228	11237	20 %	20 %	20 %	40 %	256811540
10	NC_013157	GAAGA	2	10	14254	14263	60 %	0 %	40 %	0 %	256811545
11	NC_013157	AAAAG	2	10	14545	14554	80 %	0 %	20 %	0 %	256811545
12	NC_013157	GATTT	2	10	15098	15107	20 %	60 %	20 %	0 %	256811545
13	NC_013157	AGGAT	2	10	18684	18693	40 %	20 %	40 %	0 %	256811549
14	NC_013157	AGAGT	2	10	20884	20893	40 %	20 %	40 %	0 %	256811553
15	NC_013157	GTTCT	2	10	22112	22121	0 %	60 %	20 %	20 %	256811555

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.