MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 plasmid pMEFER01

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013157	ATAA	2	8	58	65	75 %	25 %	0 %	0 %	256811521
2	NC_013157	CATG	2	8	219	226	25 %	25 %	25 %	25 %	256811521
3	NC_013157	TCAA	2	8	233	240	50 %	25 %	0 %	25 %	256811521
4	NC_013157	ATGT	2	8	587	594	25 %	50 %	25 %	0 %	256811521
5	NC_013157	TTTC	2	8	1124	1131	0 %	75 %	0 %	25 %	256811521
6	NC_013157	ATTC	2	8	1488	1495	25 %	50 %	0 %	25 %	256811522
7	NC_013157	CTAA	2	8	2203	2210	50 %	25 %	0 %	25 %	256811523
8	NC_013157	TTCT	2	8	2352	2359	0 %	75 %	0 %	25 %	256811523
9	NC_013157	AAAG	2	8	3025	3032	75 %	0 %	25 %	0 %	256811524
10	NC_013157	TTTA	2	8	3163	3170	25 %	75 %	0 %	0 %	256811525
11	NC_013157	AGAA	2	8	3950	3957	75 %	0 %	25 %	0 %	256811528
12	NC_013157	TGCT	2	8	3994	4001	0 %	50 %	25 %	25 %	256811528
13	NC_013157	ACTG	2	8	4572	4579	25 %	25 %	25 %	25 %	256811529
14	NC_013157	CTGC	2	8	4920	4927	0 %	25 %	25 %	50 %	256811530
15	NC_013157	GCTT	2	8	5158	5165	0 %	50 %	25 %	25 %	256811530
16	NC_013157	CTTT	2	8	5175	5182	0 %	75 %	0 %	25 %	256811530
17	NC_013157	AAGC	2	8	5260	5267	50 %	0 %	25 %	25 %	256811530
18	NC_013157	TTTC	2	8	5274	5281	0 %	75 %	0 %	25 %	256811530
19	NC_013157	TAAC	2	8	5340	5347	50 %	25 %	0 %	25 %	256811530
20	NC_013157	TCCT	2	8	5459	5466	0 %	50 %	0 %	50 %	256811530
21	NC_013157	TAAG	2	8	6034	6041	50 %	25 %	25 %	0 %	256811530
22	NC_013157	ATTT	2	8	6223	6230	25 %	75 %	0 %	0 %	256811530
23	NC_013157	TTCA	2	8	6409	6416	25 %	50 %	0 %	25 %	256811530
24	NC_013157	TTTA	2	8	6991	6998	25 %	75 %	0 %	0 %	256811531
25	NC_013157	AATG	2	8	7469	7476	50 %	25 %	25 %	0 %	256811531
26	NC_013157	GTAA	2	8	7708	7715	50 %	25 %	25 %	0 %	256811531
27	NC_013157	AATC	2	8	8607	8614	50 %	25 %	0 %	25 %	256811532
28	NC_013157	TTGT	2	8	8761	8768	0 %	75 %	25 %	0 %	256811532
29	NC_013157	CAAT	2	8	9604	9611	50 %	25 %	0 %	25 %	256811534
30	NC_013157	ATCA	2	8	9623	9630	50 %	25 %	0 %	25 %	256811534
31	NC_013157	TTTA	2	8	9774	9781	25 %	75 %	0 %	0 %	256811535
32	NC_013157	ATAA	2	8	10099	10106	75 %	25 %	0 %	0 %	256811536
33	NC_013157	AACT	2	8	10323	10330	50 %	25 %	0 %	25 %	256811537
34	NC_013157	TATC	2	8	10408	10415	25 %	50 %	0 %	25 %	256811537
35	NC_013157	ATCT	2	8	10424	10431	25 %	50 %	0 %	25 %	256811537
36	NC_013157	CATC	2	8	11536	11543	25 %	25 %	0 %	50 %	256811541
37	NC_013157	GAAT	2	8	12225	12232	50 %	25 %	25 %	0 %	256811543
38	NC_013157	TTGA	2	8	13645	13652	25 %	50 %	25 %	0 %	256811545
39	NC_013157	GGAA	2	8	13653	13660	50 %	0 %	50 %	0 %	256811545
40	NC_013157	TTAA	2	8	13702	13709	50 %	50 %	0 %	0 %	256811545
41	NC_013157	ACAT	2	8	13811	13818	50 %	25 %	0 %	25 %	256811545
42	NC_013157	AGAT	2	8	15254	15261	50 %	25 %	25 %	0 %	256811545
43	NC_013157	GAAA	2	8	15498	15505	75 %	0 %	25 %	0 %	256811545
44	NC_013157	AAGA	2	8	15562	15569	75 %	0 %	25 %	0 %	256811545
45	NC_013157	GGTA	2	8	15745	15752	25 %	25 %	50 %	0 %	256811545
46	NC_013157	TGGA	2	8	16143	16150	25 %	25 %	50 %	0 %	256811546
47	NC_013157	GTTG	2	8	16407	16414	0 %	50 %	50 %	0 %	256811546
48	NC_013157	AATA	2	8	16614	16621	75 %	25 %	0 %	0 %	256811546
49	NC_013157	TTAA	2	8	16698	16705	50 %	50 %	0 %	0 %	256811546
50	NC_013157	TGGA	2	8	16927	16934	25 %	25 %	50 %	0 %	256811546
51	NC_013157	ACAA	2	8	16979	16986	75 %	0 %	0 %	25 %	256811546
52	NC_013157	TTAA	2	8	17147	17154	50 %	50 %	0 %	0 %	256811546
53	NC_013157	TTGC	2	8	17550	17557	0 %	50 %	25 %	25 %	256811547
54	NC_013157	GGAA	2	8	18417	18424	50 %	0 %	50 %	0 %	256811549
55	NC_013157	TACA	2	8	19214	19221	50 %	25 %	0 %	25 %	256811550
56	NC_013157	TTTC	2	8	19675	19682	0 %	75 %	0 %	25 %	256811550
57	NC_013157	ATGC	2	8	19800	19807	25 %	25 %	25 %	25 %	256811551
58	NC_013157	AATT	2	8	19808	19815	50 %	50 %	0 %	0 %	256811551
59	NC_013157	AGTG	2	8	19863	19870	25 %	25 %	50 %	0 %	256811551
60	NC_013157	TTCT	2	8	20817	20824	0 %	75 %	0 %	25 %	256811553
61	NC_013157	CTGG	2	8	21000	21007	0 %	25 %	50 %	25 %	256811553
62	NC_013157	GTTG	2	8	21305	21312	0 %	50 %	50 %	0 %	256811554
63	NC_013157	ACTA	2	8	21362	21369	50 %	25 %	0 %	25 %	256811554
64	NC_013157	ACAT	2	8	21874	21881	50 %	25 %	0 %	25 %	256811555
65	NC_013157	TTTC	2	8	22007	22014	0 %	75 %	0 %	25 %	256811555

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.