MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 plasmid pMEFER01

Total Repeats: 333

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013157	CAT	2	6	130	135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811521
2	NC_013157	TCA	2	6	140	145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811521
3	NC_013157	CAA	2	6	207	212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811521
4	NC_013157	TGC	2	6	325	330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256811521
5	NC_013157	TCA	2	6	365	370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811521
6	NC_013157	GAA	2	6	373	378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256811521
7	NC_013157	CAA	2	6	423	428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811521
8	NC_013157	TCT	2	6	449	454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811521
9	NC_013157	TCT	2	6	575	580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811521
10	NC_013157	CTG	2	6	755	760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256811521
11	NC_013157	TCT	2	6	826	831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811521
12	NC_013157	TTG	2	6	994	999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811521
13	NC_013157	ATA	2	6	1081	1086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811521
14	NC_013157	AAC	2	6	1238	1243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811521
15	NC_013157	CTT	2	6	1254	1259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811521
16	NC_013157	TCA	2	6	1353	1358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811521
17	NC_013157	GAA	2	6	1469	1474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013157	TCT	2	6	1524	1529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811522
19	NC_013157	ATC	2	6	1534	1539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811522
20	NC_013157	CAC	2	6	1557	1562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256811522
21	NC_013157	TTC	2	6	1629	1634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811522
22	NC_013157	TTC	2	6	1759	1764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811522
23	NC_013157	CAT	2	6	1901	1906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811522
24	NC_013157	ATG	2	6	1933	1938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811522
25	NC_013157	TAT	2	6	1947	1952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811522
26	NC_013157	TCT	2	6	1963	1968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811522
27	NC_013157	GTA	2	6	1995	2000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811522
28	NC_013157	ACT	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811522
29	NC_013157	CCA	2	6	2161	2166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256811523
30	NC_013157	CAG	2	6	2231	2236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256811523
31	NC_013157	GGT	2	6	2425	2430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256811523
32	NC_013157	AGG	2	6	2496	2501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256811523
33	NC_013157	TAT	2	6	2529	2534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811523
34	NC_013157	CTC	2	6	2535	2540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256811523
35	NC_013157	TGT	2	6	2630	2635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811524
36	NC_013157	TGT	2	6	2638	2643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811524
37	NC_013157	CAA	2	6	2737	2742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811524
38	NC_013157	CTT	2	6	2767	2772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811524
39	NC_013157	ATT	2	6	2792	2797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811524
40	NC_013157	ATG	2	6	2800	2805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811524
41	NC_013157	TTG	2	6	2869	2874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811524
42	NC_013157	TTG	2	6	2971	2976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811524
43	NC_013157	GTA	2	6	2991	2996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811524
44	NC_013157	TCA	2	6	3127	3132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811525
45	NC_013157	TAA	2	6	3181	3186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811525
46	NC_013157	ATT	2	6	3266	3271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811525
47	NC_013157	TCA	2	6	3290	3295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811525
48	NC_013157	CTT	3	9	3336	3344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811525
49	NC_013157	CTC	2	6	3388	3393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256811526
50	NC_013157	GAT	2	6	3406	3411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811526
51	NC_013157	ACC	2	6	3541	3546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256811527
52	NC_013157	TTG	2	6	3579	3584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811527
53	NC_013157	TGT	3	9	3782	3790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811527
54	NC_013157	ATC	2	6	3833	3838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811528
55	NC_013157	TCC	2	6	3910	3915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256811528
56	NC_013157	ATT	2	6	3939	3944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811528
57	NC_013157	TAA	2	6	4024	4029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811528
58	NC_013157	TTA	2	6	4059	4064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811528
59	NC_013157	TGT	2	6	4146	4151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811528
60	NC_013157	CAC	2	6	4154	4159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256811528
61	NC_013157	ACC	2	6	4165	4170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_013157	TGT	2	6	4178	4183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811529
63	NC_013157	TCA	2	6	4266	4271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811529
64	NC_013157	TAA	2	6	4304	4309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811529
65	NC_013157	TGC	2	6	4310	4315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256811529
66	NC_013157	AAC	2	6	4316	4321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811529
67	NC_013157	CCA	2	6	4446	4451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256811529
68	NC_013157	ACA	2	6	4512	4517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811529
69	NC_013157	ACT	2	6	4554	4559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811529
70	NC_013157	ATA	2	6	4589	4594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811529
71	NC_013157	AGT	2	6	4736	4741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811530
72	NC_013157	CAA	2	6	4764	4769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811530
73	NC_013157	AAC	2	6	4777	4782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811530
74	NC_013157	TTG	2	6	4837	4842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811530
75	NC_013157	CTG	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256811530
76	NC_013157	CTG	2	6	5052	5057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256811530
77	NC_013157	AGT	2	6	5076	5081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811530
78	NC_013157	AAC	2	6	5097	5102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811530
79	NC_013157	ATC	2	6	5198	5203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811530
80	NC_013157	ACA	2	6	5388	5393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811530
81	NC_013157	ATT	2	6	5779	5784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811530
82	NC_013157	GTA	2	6	5861	5866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811530
83	NC_013157	TCC	2	6	5903	5908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256811530
84	NC_013157	CTT	2	6	5956	5961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811530
85	NC_013157	TCA	2	6	5973	5978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811530
86	NC_013157	CTG	2	6	6000	6005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256811530
87	NC_013157	TCA	2	6	6122	6127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811530
88	NC_013157	CCA	2	6	6522	6527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256811530
89	NC_013157	AAT	2	6	6573	6578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811530
90	NC_013157	ATT	2	6	6596	6601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811530
91	NC_013157	CCA	2	6	6609	6614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256811530
92	NC_013157	GCA	2	6	6617	6622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256811530
93	NC_013157	TCT	2	6	6657	6662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811530
94	NC_013157	ACC	2	6	6686	6691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_013157	ATT	2	6	6723	6728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811531
96	NC_013157	TTA	2	6	6732	6737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811531
97	NC_013157	CCA	2	6	6752	6757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256811531
98	NC_013157	CTA	2	6	6800	6805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811531
99	NC_013157	ATA	2	6	7033	7038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811531
100	NC_013157	CTT	2	6	7110	7115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811531
101	NC_013157	TTA	2	6	7119	7124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811531
102	NC_013157	CTG	2	6	7227	7232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256811531
103	NC_013157	TGT	2	6	7321	7326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811531
104	NC_013157	TGT	2	6	7344	7349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811531
105	NC_013157	TAA	2	6	7375	7380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811531
106	NC_013157	CAT	2	6	7554	7559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811531
107	NC_013157	TAA	2	6	7596	7601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811531
108	NC_013157	TCT	2	6	7697	7702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811531
109	NC_013157	TTG	2	6	7779	7784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811531
110	NC_013157	ATT	2	6	8002	8007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811531
111	NC_013157	GGC	2	6	8047	8052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256811531
112	NC_013157	CAT	2	6	8142	8147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811531
113	NC_013157	CAA	2	6	8153	8158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811531
114	NC_013157	TCA	2	6	8258	8263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811531
115	NC_013157	CAA	2	6	8268	8273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811531
116	NC_013157	TAC	2	6	8343	8348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811531
117	NC_013157	CAT	2	6	8349	8354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811531
118	NC_013157	ACA	2	6	8534	8539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811531
119	NC_013157	AAT	2	6	8549	8554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811531
120	NC_013157	TTC	2	6	8567	8572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811531
121	NC_013157	CAA	2	6	8588	8593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811532
122	NC_013157	CAT	2	6	8696	8701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811532
123	NC_013157	AAT	2	6	8880	8885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811532
124	NC_013157	TCA	2	6	9015	9020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811533
125	NC_013157	ATC	2	6	9042	9047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811533
126	NC_013157	TTG	2	6	9065	9070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811533
127	NC_013157	ATG	2	6	9082	9087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811533
128	NC_013157	AGT	2	6	9172	9177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811533
129	NC_013157	TAC	2	6	9191	9196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811533
130	NC_013157	AGG	2	6	9320	9325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013157	AGT	2	6	9359	9364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013157	TAA	2	6	9466	9471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013157	CAA	2	6	9581	9586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811534
134	NC_013157	TTA	2	6	9591	9596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811534
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164	NC_013157	CTC	2	6	11175	11180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256811540
165	NC_013157	CTT	2	6	11198	11203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811540
166	NC_013157	TTC	2	6	11220	11225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811540
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174	NC_013157	CAT	2	6	12188	12193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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257	NC_013157	AAG	2	6	17189	17194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_013157	ATT	3	9	17246	17254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.