MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 plasmid pMEFER01

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013157	TC	3	6	37	42	0 %	50 %	0 %	50 %	256811521
2	NC_013157	CT	3	6	304	309	0 %	50 %	0 %	50 %	256811521
3	NC_013157	AT	3	6	1333	1338	50 %	50 %	0 %	0 %	256811521
4	NC_013157	TA	3	6	1447	1452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013157	TA	3	6	1518	1523	50 %	50 %	0 %	0 %	256811522
6	NC_013157	TA	3	6	2069	2074	50 %	50 %	0 %	0 %	256811522
7	NC_013157	AT	3	6	3356	3361	50 %	50 %	0 %	0 %	256811525
8	NC_013157	TA	3	6	3512	3517	50 %	50 %	0 %	0 %	256811526
9	NC_013157	TC	3	6	3521	3526	0 %	50 %	0 %	50 %	256811526
10	NC_013157	TG	3	6	3924	3929	0 %	50 %	50 %	0 %	256811528
11	NC_013157	AT	4	8	4291	4298	50 %	50 %	0 %	0 %	256811529
12	NC_013157	TC	3	6	5284	5289	0 %	50 %	0 %	50 %	256811530
13	NC_013157	TA	3	6	7584	7589	50 %	50 %	0 %	0 %	256811531
14	NC_013157	AT	3	6	8146	8151	50 %	50 %	0 %	0 %	256811531
15	NC_013157	TA	3	6	8250	8255	50 %	50 %	0 %	0 %	256811531
16	NC_013157	AT	3	6	8498	8503	50 %	50 %	0 %	0 %	256811531
17	NC_013157	GA	3	6	8725	8730	50 %	0 %	50 %	0 %	256811532
18	NC_013157	TA	3	6	9096	9101	50 %	50 %	0 %	0 %	256811533
19	NC_013157	TA	3	6	9429	9434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013157	TA	3	6	9441	9446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013157	TC	3	6	9548	9553	0 %	50 %	0 %	50 %	256811534
22	NC_013157	CT	3	6	9939	9944	0 %	50 %	0 %	50 %	256811536
23	NC_013157	TC	4	8	10112	10119	0 %	50 %	0 %	50 %	256811536
24	NC_013157	TA	3	6	11252	11257	50 %	50 %	0 %	0 %	256811540
25	NC_013157	TC	4	8	11867	11874	0 %	50 %	0 %	50 %	256811541
26	NC_013157	TC	3	6	12256	12261	0 %	50 %	0 %	50 %	256811543
27	NC_013157	CT	3	6	12430	12435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013157	AT	3	6	12609	12614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013157	TA	3	6	12632	12637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013157	TA	3	6	13419	13424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013157	AT	3	6	13624	13629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013157	AG	3	6	13920	13925	50 %	0 %	50 %	0 %	256811545
33	NC_013157	AT	3	6	14498	14503	50 %	50 %	0 %	0 %	256811545
34	NC_013157	TA	3	6	14756	14761	50 %	50 %	0 %	0 %	256811545
35	NC_013157	TA	3	6	15220	15225	50 %	50 %	0 %	0 %	256811545
36	NC_013157	AG	3	6	15665	15670	50 %	0 %	50 %	0 %	256811545
37	NC_013157	TG	3	6	16368	16373	0 %	50 %	50 %	0 %	256811546
38	NC_013157	AT	3	6	16798	16803	50 %	50 %	0 %	0 %	256811546
39	NC_013157	GA	4	8	16861	16868	50 %	0 %	50 %	0 %	256811546
40	NC_013157	GA	3	6	17052	17057	50 %	0 %	50 %	0 %	256811546
41	NC_013157	AT	3	6	18093	18098	50 %	50 %	0 %	0 %	256811548
42	NC_013157	TA	4	8	18255	18262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013157	AG	3	6	18811	18816	50 %	0 %	50 %	0 %	256811549
44	NC_013157	CT	3	6	19528	19533	0 %	50 %	0 %	50 %	256811550
45	NC_013157	TA	3	6	19609	19614	50 %	50 %	0 %	0 %	256811550
46	NC_013157	CT	3	6	20056	20061	0 %	50 %	0 %	50 %	256811551
47	NC_013157	AT	3	6	20709	20714	50 %	50 %	0 %	0 %	256811553
48	NC_013157	TG	3	6	21719	21724	0 %	50 %	50 %	0 %	256811555
49	NC_013157	CT	3	6	22000	22005	0 %	50 %	0 %	50 %	256811555

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.