MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013156	TGATTT	2	12	21471	21482	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013156	ATTTTT	2	12	38818	38829	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013156	TAAATA	2	12	65467	65478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013156	ATAAAA	2	12	67857	67868	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013156	AAATTT	2	12	73141	73152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013156	TAAATT	2	12	80197	80208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013156	TATGTT	2	12	101736	101747	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013156	AAATAC	2	12	115628	115639	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_013156	ATTTTC	2	12	123315	123326	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013156	ATAACC	2	12	124561	124572	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013156	TAATGA	2	12	124604	124615	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013156	CTTTAT	2	12	129679	129690	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013156	ATTTTT	2	12	134305	134316	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013156	TTAAAT	2	12	136070	136081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013156	TTATAG	2	12	157697	157708	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013156	ATTTTT	2	12	167531	167542	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013156	TAAAAA	2	12	186001	186012	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013156	TTTATT	2	12	196268	196279	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013156	TTTATT	2	12	203753	203764	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013156	ATTTTT	2	12	221284	221295	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013156	TATTTT	2	12	254065	254076	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013156	AAAAAT	2	12	266034	266045	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013156	AAAAAC	2	12	267340	267351	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_013156	TAAAAA	2	12	280177	280188	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013156	CTTAAA	2	12	291248	291259	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_013156	TAATTA	2	12	291301	291312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013156	AAAGAT	2	12	325974	325985	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013156	TTCTAA	2	12	326098	326109	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_013156	TTAAAA	2	12	328259	328270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013156	CAATAA	2	12	334774	334785	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_013156	TAAAAT	2	12	342576	342587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013156	AAAATT	2	12	347261	347272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013156	TTTTAA	2	12	358545	358556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013156	ATGTTG	2	12	358662	358673	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013156	AACCTC	2	12	359310	359321	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013156	GTAAAG	2	12	374379	374390	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013156	ATTTTA	2	12	391312	391323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013156	CTAACT	2	12	394285	394296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013156	TGCAGC	2	12	394707	394718	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013156	ACCAAC	2	12	395896	395907	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013156	AAATTT	2	12	400405	400416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013156	TTAATT	2	12	414064	414075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013156	ATAAAA	2	12	439223	439234	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013156	ATTAAA	3	18	453278	453295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013156	CTTTAT	2	12	464252	464263	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_013156	TAAAAT	2	12	513445	513456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013156	AAAAAG	2	12	523974	523985	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013156	TTAAAT	2	12	528247	528258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013156	ATATTT	2	12	532087	532098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013156	TTTTAA	2	12	549661	549672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013156	TTTTTG	2	12	569755	569766	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013156	ATTTTT	2	12	582798	582809	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013156	ATAAAA	2	12	591308	591319	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013156	CTAATA	2	12	591764	591775	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013156	ATTTTT	2	12	614395	614406	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013156	ATTTTC	2	12	639037	639048	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_013156	TAAAAA	2	12	639118	639129	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013156	ATTTAA	2	12	642893	642904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013156	ACGGGG	2	12	646530	646541	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_013156	CTTTAT	2	12	647884	647895	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_013156	AAAACA	2	12	648531	648542	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013156	ACATCA	2	12	652674	652685	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013156	ATTTAA	2	12	676634	676645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013156	AAGAAT	2	12	676655	676666	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013156	ATTTTT	2	12	689697	689708	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013156	CAAAAA	2	12	700750	700761	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_013156	TTAATG	2	12	717187	717198	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013156	ATAAAT	2	12	717226	717237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013156	TAACTA	2	12	721383	721394	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_013156	AATTTT	2	12	740374	740385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013156	ATAAAA	2	12	743848	743859	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013156	TAAATT	2	12	745288	745299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013156	ATATTT	2	12	747979	747990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013156	AAAATT	2	12	756743	756754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013156	TAAAAA	2	12	768666	768677	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013156	ATTTTT	2	12	782574	782585	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013156	AAATAA	2	12	785453	785464	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013156	CTTATT	2	12	815665	815676	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_013156	TAAAAA	2	12	823312	823323	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013156	ATTATC	2	12	834113	834124	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_013156	ATTTTG	2	12	842565	842576	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013156	AATTTA	2	12	857335	857346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013156	AAATTT	2	12	859332	859343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013156	ATTTTT	2	12	885577	885588	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013156	ATTAAA	2	12	924124	924135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013156	ATAAAT	2	12	955767	955778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013156	ACTTTA	2	12	966231	966242	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_013156	AATAAA	2	12	970310	970321	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013156	TTAATT	2	12	970354	970365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013156	ATGTTT	2	12	971648	971659	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013156	CTCATA	2	12	982919	982930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013156	TCTTTT	2	12	985615	985626	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_013156	CTTAAA	2	12	986624	986635	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_013156	AAATTA	2	12	1001912	1001923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013156	CCGGGA	2	12	1015142	1015153	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013156	GCAGGG	2	12	1015227	1015238	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_013156	TAAAAT	2	12	1029213	1029224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013156	CAATAA	2	12	1054878	1054889	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_013156	TTAGAG	2	12	1057628	1057639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013156	TTTTAT	2	12	1059508	1059519	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013156	AAAATT	2	12	1059562	1059573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013156	ATTTGG	2	12	1095503	1095514	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013156	CTTTAA	2	12	1095939	1095950	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_013156	AATTTA	2	12	1095968	1095979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013156	AAAAAT	2	12	1165738	1165749	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013156	TTTTTA	2	12	1177081	1177092	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013156	TAAATA	2	12	1184923	1184934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013156	ATTTTT	2	12	1187926	1187937	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013156	ATAAAA	2	12	1189764	1189775	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013156	TATATG	2	12	1196822	1196833	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013156	ATTTTT	2	12	1201753	1201764	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013156	AAATTT	2	12	1205330	1205341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013156	ATTTTT	2	12	1207260	1207271	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013156	TAAATT	2	12	1207323	1207334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013156	TTAAAG	2	12	1230963	1230974	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013156	ATTTTT	2	12	1261530	1261541	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013156	ATTTTT	2	12	1268366	1268377	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013156	TAAAAT	2	12	1272902	1272913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013156	TTAAAA	2	12	1274148	1274159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013156	TAAAAA	2	12	1278091	1278102	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013156	TTTTTA	2	12	1283598	1283609	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013156	AAATTT	2	12	1304425	1304436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013156	AAAAAT	2	12	1306458	1306469	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013156	ATTTTT	2	12	1326131	1326142	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013156	CTAAAG	2	12	1329017	1329028	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_013156	ACCTTT	2	12	1340029	1340040	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013156	ATATTT	2	12	1375224	1375235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013156	AAACAA	2	12	1384113	1384124	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_013156	TATAAA	2	12	1384330	1384341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013156	ATTTTT	2	12	1401813	1401824	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013156	AACAAA	2	12	1444532	1444543	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_013156	AATATA	2	12	1469853	1469864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013156	ACTTTA	2	12	1472160	1472171	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_013156	ACAATA	2	12	1474659	1474670	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_013156	TATAAT	2	12	1476173	1476184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.