MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 4050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013156	AAAC	2	8	1464550	1464557	75 %	0 %	0 %	25 %	256811493
4002	NC_013156	GGTT	2	8	1464790	1464797	0 %	50 %	50 %	0 %	256811494
4003	NC_013156	ACAT	2	8	1465118	1465125	50 %	25 %	0 %	25 %	256811494
4004	NC_013156	ATGT	2	8	1465844	1465851	25 %	50 %	25 %	0 %	256811494
4005	NC_013156	AAAG	2	8	1465863	1465870	75 %	0 %	25 %	0 %	256811494
4006	NC_013156	CCTG	2	8	1465903	1465910	0 %	25 %	25 %	50 %	256811494
4007	NC_013156	TGTT	2	8	1465911	1465918	0 %	75 %	25 %	0 %	256811494
4008	NC_013156	TTAC	2	8	1465946	1465953	25 %	50 %	0 %	25 %	256811494
4009	NC_013156	AAAC	2	8	1466231	1466238	75 %	0 %	0 %	25 %	256811494
4010	NC_013156	AAAG	2	8	1466695	1466702	75 %	0 %	25 %	0 %	256811494
4011	NC_013156	AGAA	2	8	1466786	1466793	75 %	0 %	25 %	0 %	256811494
4012	NC_013156	TATC	2	8	1467007	1467014	25 %	50 %	0 %	25 %	256811494
4013	NC_013156	TAAA	2	8	1467021	1467028	75 %	25 %	0 %	0 %	256811494
4014	NC_013156	ATTT	2	8	1467641	1467648	25 %	75 %	0 %	0 %	256811496
4015	NC_013156	CCCT	2	8	1467762	1467769	0 %	25 %	0 %	75 %	256811497
4016	NC_013156	GTTG	2	8	1467975	1467982	0 %	50 %	50 %	0 %	256811497
4017	NC_013156	TTTC	2	8	1468254	1468261	0 %	75 %	0 %	25 %	256811497
4018	NC_013156	CTTT	2	8	1468429	1468436	0 %	75 %	0 %	25 %	256811497
4019	NC_013156	TCCC	2	8	1468913	1468920	0 %	25 %	0 %	75 %	256811499
4020	NC_013156	TCAA	2	8	1469144	1469151	50 %	25 %	0 %	25 %	256811500
4021	NC_013156	TCCT	2	8	1469211	1469218	0 %	50 %	0 %	50 %	256811500
4022	NC_013156	CATT	2	8	1469229	1469236	25 %	50 %	0 %	25 %	256811500
4023	NC_013156	TATT	2	8	1470116	1470123	25 %	75 %	0 %	0 %	256811502
4024	NC_013156	CAAT	2	8	1470266	1470273	50 %	25 %	0 %	25 %	256811503
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4027	NC_013156	TCCC	2	8	1473648	1473655	0 %	25 %	0 %	75 %	256811509
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4031	NC_013156	TAAA	2	8	1474197	1474204	75 %	25 %	0 %	0 %	256811509
4032	NC_013156	TTTC	2	8	1474328	1474335	0 %	75 %	0 %	25 %	256811509
4033	NC_013156	TCTG	2	8	1475096	1475103	0 %	50 %	25 %	25 %	256811510
4034	NC_013156	TACT	2	8	1475204	1475211	25 %	50 %	0 %	25 %	256811510
4035	NC_013156	TACT	2	8	1475859	1475866	25 %	50 %	0 %	25 %	256811511
4036	NC_013156	AACA	2	8	1476427	1476434	75 %	0 %	0 %	25 %	256811513
4037	NC_013156	CAGG	2	8	1476949	1476956	25 %	0 %	50 %	25 %	256811513
4038	NC_013156	TAAA	2	8	1477745	1477752	75 %	25 %	0 %	0 %	256811513
4039	NC_013156	AAAT	2	8	1478015	1478022	75 %	25 %	0 %	0 %	256811513
4040	NC_013156	ACAT	2	8	1478113	1478120	50 %	25 %	0 %	25 %	256811513
4041	NC_013156	AAAG	2	8	1478550	1478557	75 %	0 %	25 %	0 %	256811513
4042	NC_013156	AAGA	2	8	1479454	1479461	75 %	0 %	25 %	0 %	256811516
4043	NC_013156	ATTA	2	8	1479592	1479599	50 %	50 %	0 %	0 %	256811516
4044	NC_013156	CCAA	2	8	1481215	1481222	50 %	0 %	0 %	50 %	256811517
4045	NC_013156	ATGG	2	8	1481556	1481563	25 %	25 %	50 %	0 %	256811517
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4047	NC_013156	AAGT	2	8	1483705	1483712	50 %	25 %	25 %	0 %	256811519
4048	NC_013156	TATC	2	8	1483982	1483989	25 %	50 %	0 %	25 %	256811519
4049	NC_013156	ATTT	2	8	1484417	1484424	25 %	75 %	0 %	0 %	256811519
4050	NC_013156	CTTT	2	8	1484656	1484663	0 %	75 %	0 %	25 %	256811519

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.