MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 2361

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013156	TAT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013156	ATT	2	6	74	79	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013156	ATT	2	6	84	89	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013156	TCA	2	6	445	450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013156	TAA	2	6	1749	1754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013156	CTT	2	6	1775	1780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013156	TGA	2	6	3055	3060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013156	AAT	2	6	3097	3102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013156	ATT	2	6	3187	3192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013156	TCA	2	6	3218	3223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013156	TCA	2	6	3269	3274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013156	ATC	3	9	3283	3291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013156	TAA	2	6	3305	3310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013156	CCA	2	6	6672	6677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_013156	ATA	2	6	6796	6801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013156	ATT	2	6	9308	9313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013156	TAT	2	6	11386	11391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013156	TAT	2	6	11614	11619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013156	TAA	4	12	11625	11636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013156	ATT	2	6	11673	11678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013156	TCA	2	6	14436	14441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013156	GAT	2	6	14471	14476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013156	TAT	2	6	17739	17744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013156	GTT	2	6	21009	21014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013156	ATT	2	6	21483	21488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013156	TTA	2	6	21489	21494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013156	TAT	2	6	21506	21511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013156	TTC	2	6	21560	21565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013156	TAA	2	6	21616	21621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013156	TAT	2	6	21638	21643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013156	ATA	2	6	24034	24039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013156	TAA	2	6	24100	24105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013156	AAT	2	6	24174	24179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013156	ATA	2	6	24200	24205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013156	TAA	2	6	24671	24676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013156	GGT	2	6	32429	32434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013156	TAA	2	6	32665	32670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013156	TAA	2	6	32700	32705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013156	ATT	2	6	33686	33691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013156	ATG	2	6	33804	33809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013156	ATA	2	6	33904	33909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013156	AGG	2	6	33911	33916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013156	TAG	2	6	33917	33922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013156	AGG	2	6	36846	36851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013156	TAT	2	6	38839	38844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013156	ATT	2	6	40093	40098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013156	ATT	2	6	40661	40666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013156	CAA	2	6	42515	42520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013156	AAT	2	6	42686	42691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013156	ATT	2	6	42726	42731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013156	TGT	2	6	42744	42749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013156	TGT	2	6	42753	42758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013156	CAC	2	6	44132	44137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_013156	TAT	2	6	44166	44171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013156	TAA	2	6	45996	46001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013156	AAT	2	6	46047	46052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013156	GTT	2	6	46100	46105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013156	TAA	2	6	46209	46214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013156	AGA	2	6	46355	46360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013156	CCA	2	6	46384	46389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_013156	TAT	2	6	47493	47498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013156	AGT	2	6	47508	47513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013156	TTA	2	6	47534	47539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013156	ATT	3	9	51991	51999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013156	TTC	2	6	56881	56886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013156	ATC	2	6	56915	56920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013156	ACC	2	6	57198	57203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_013156	CCA	2	6	60145	60150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_013156	ATT	3	9	60161	60169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013156	ATC	2	6	63290	63295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013156	TAT	2	6	65458	65463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013156	GGA	2	6	66544	66549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013156	TTG	2	6	66568	66573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013156	TAA	2	6	67017	67022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013156	TAT	2	6	67851	67856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013156	ATG	2	6	69850	69855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013156	ATT	2	6	69885	69890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013156	TAA	2	6	70447	70452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013156	ATA	2	6	72605	72610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013156	ATA	2	6	72613	72618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013156	AAT	2	6	72627	72632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013156	TGA	2	6	76879	76884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013156	AAC	2	6	77343	77348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013156	TGA	2	6	78670	78675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013156	ATT	2	6	78787	78792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013156	ATT	2	6	78808	78813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013156	ATT	2	6	78823	78828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013156	TTA	2	6	78829	78834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013156	ATA	2	6	78846	78851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013156	TAA	2	6	78861	78866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013156	ATA	2	6	78937	78942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013156	TAA	3	9	78955	78963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013156	ATT	2	6	78973	78978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013156	ATA	2	6	78997	79002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013156	TTC	2	6	80266	80271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013156	AAT	2	6	80319	80324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013156	AAC	2	6	80366	80371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013156	TAA	2	6	80389	80394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013156	TGA	2	6	80418	80423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013156	ATA	2	6	81561	81566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013156	CCA	2	6	82355	82360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_013156	TAT	2	6	90147	90152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013156	TAT	2	6	90166	90171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013156	TTA	2	6	90290	90295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013156	ATA	2	6	90296	90301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013156	TAT	2	6	90313	90318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013156	ATT	2	6	94320	94325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013156	ATC	2	6	97278	97283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013156	CCT	2	6	98758	98763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_013156	ATA	2	6	99453	99458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013156	TAA	2	6	101213	101218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013156	TGG	2	6	101225	101230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013156	GTT	2	6	101243	101248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013156	AAT	2	6	101341	101346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013156	ATA	2	6	101373	101378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013156	CTT	2	6	101437	101442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013156	AAT	2	6	101539	101544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013156	ATT	2	6	101649	101654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013156	AAT	2	6	101706	101711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013156	AGT	2	6	101750	101755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013156	ATT	2	6	101782	101787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013156	ATA	2	6	103149	103154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013156	ATA	2	6	103172	103177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013156	GGT	2	6	103740	103745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013156	ACC	2	6	106141	106146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_013156	TAT	2	6	106666	106671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013156	TAA	2	6	108521	108526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013156	TAA	2	6	108539	108544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013156	TAA	2	6	108583	108588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013156	ATT	3	9	111739	111747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013156	AAT	3	9	111777	111785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013156	TAT	2	6	111792	111797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013156	TAA	2	6	114413	114418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013156	AAT	2	6	114752	114757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013156	ATA	2	6	115295	115300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013156	TTA	2	6	115321	115326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013156	CAA	2	6	115379	115384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013156	GTA	2	6	115411	115416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013156	CTT	2	6	115438	115443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013156	TTA	2	6	115541	115546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013156	ATA	2	6	115610	115615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013156	ATA	2	6	115621	115626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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412	NC_013156	TAA	2	6	267247	267252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
413	NC_013156	TAT	2	6	267260	267265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
414	NC_013156	ATA	2	6	268604	268609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_013156	ATT	2	6	286008	286013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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