MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chitinophaga pinensis DSM 2588 chromosome

Total Repeats: 115363

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013132	GAA	2	6	291	296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419058
2	NC_013132	AAG	2	6	438	443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419058
3	NC_013132	GGT	2	6	627	632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419058
4	NC_013132	TCA	2	6	763	768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419058
5	NC_013132	GAA	2	6	788	793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419058
6	NC_013132	ATC	2	6	798	803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419058
7	NC_013132	GAT	2	6	849	854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419058
8	NC_013132	ACC	2	6	910	915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419058
9	NC_013132	ACC	2	6	956	961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419058
10	NC_013132	AGT	2	6	1106	1111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419058
11	NC_013132	TCT	2	6	1185	1190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419058
12	NC_013132	TCA	2	6	1254	1259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419058
13	NC_013132	GCT	2	6	1325	1330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419058
14	NC_013132	AAG	2	6	1705	1710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419059
15	NC_013132	GAA	2	6	1773	1778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419059
16	NC_013132	TGA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419059
17	NC_013132	GTC	2	6	2001	2006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419059
18	NC_013132	CTT	2	6	2020	2025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419059
19	NC_013132	AAC	2	6	2056	2061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419059
20	NC_013132	GTT	2	6	2063	2068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256419059
21	NC_013132	TCT	2	6	2107	2112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419059
22	NC_013132	AGA	2	6	2126	2131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419059
23	NC_013132	AAC	2	6	2219	2224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419059
24	NC_013132	ATT	4	12	2728	2739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419060
25	NC_013132	GAA	2	6	2774	2779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419060
26	NC_013132	CTG	2	6	2786	2791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419060
27	NC_013132	AGA	2	6	2818	2823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419060
28	NC_013132	CTG	2	6	2841	2846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419060
29	NC_013132	GCC	2	6	2942	2947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256419060
30	NC_013132	CTG	2	6	3018	3023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419060
31	NC_013132	TAC	2	6	3075	3080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419060
32	NC_013132	TGA	2	6	3142	3147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419060
33	NC_013132	CTT	2	6	3181	3186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419060
34	NC_013132	CGT	2	6	3190	3195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419060
35	NC_013132	AGA	2	6	3220	3225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419060
36	NC_013132	CAC	2	6	3241	3246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419060
37	NC_013132	CCT	2	6	3258	3263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256419060
38	NC_013132	CCT	2	6	3427	3432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256419060
39	NC_013132	TTA	2	6	3482	3487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419060
40	NC_013132	TCC	2	6	4034	4039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256419061
41	NC_013132	AAC	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419061
42	NC_013132	TCC	2	6	4187	4192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256419061
43	NC_013132	GAA	2	6	4225	4230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419061
44	NC_013132	ATA	2	6	4235	4240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419061
45	NC_013132	GCA	2	6	4285	4290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419061
46	NC_013132	CAG	2	6	4291	4296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419061
47	NC_013132	GTT	2	6	4492	4497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256419061
48	NC_013132	GTA	3	9	4558	4566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419061
49	NC_013132	AAC	2	6	4699	4704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419061
50	NC_013132	GGT	2	6	4705	4710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419061
51	NC_013132	GGT	2	6	4750	4755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419061
52	NC_013132	GGT	2	6	4888	4893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419061
53	NC_013132	TCA	2	6	4901	4906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419061
54	NC_013132	CTA	2	6	4907	4912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419061
55	NC_013132	TGC	2	6	4929	4934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419061
56	NC_013132	TGC	3	9	5034	5042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419061
57	NC_013132	CTA	2	6	5072	5077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419061
58	NC_013132	GGT	2	6	5167	5172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419061
59	NC_013132	CGT	2	6	5209	5214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419061
60	NC_013132	TCC	2	6	5225	5230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256419061
61	NC_013132	ACC	2	6	5347	5352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419061
62	NC_013132	CTG	2	6	5701	5706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419061
63	NC_013132	GAT	2	6	5788	5793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419061
64	NC_013132	TGA	2	6	5829	5834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419061
65	NC_013132	CGT	2	6	5974	5979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419061
66	NC_013132	ACT	3	9	6020	6028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419061
67	NC_013132	GGT	2	6	6037	6042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419061
68	NC_013132	TTC	2	6	6295	6300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419061
69	NC_013132	ACT	2	6	6326	6331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419061
70	NC_013132	TCA	2	6	6332	6337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419061
71	NC_013132	CTG	2	6	6523	6528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419061
72	NC_013132	AGT	2	6	6552	6557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419061
73	NC_013132	TCT	3	9	6559	6567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419061
74	NC_013132	TCG	2	6	6743	6748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419061
75	NC_013132	CAA	3	9	6771	6779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419061
76	NC_013132	CTT	2	6	6809	6814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419061
77	NC_013132	TGC	2	6	6837	6842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419061
78	NC_013132	CAA	2	6	6888	6893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419061
79	NC_013132	ATC	2	6	7012	7017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419061
80	NC_013132	GCT	2	6	7122	7127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419061
81	NC_013132	CTG	2	6	7373	7378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419062
82	NC_013132	TGG	2	6	7523	7528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419062
83	NC_013132	GAT	2	6	7544	7549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419062
84	NC_013132	GGT	2	6	7613	7618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419062
85	NC_013132	TAC	2	6	7763	7768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419062
86	NC_013132	TGC	2	6	7917	7922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419062
87	NC_013132	CTG	2	6	7941	7946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419062
88	NC_013132	GCT	2	6	7973	7978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419062
89	NC_013132	CTG	2	6	8072	8077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419062
90	NC_013132	AAC	2	6	8108	8113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419062
91	NC_013132	GCA	2	6	8172	8177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419062
92	NC_013132	GAA	2	6	8270	8275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419062
93	NC_013132	AGA	2	6	8285	8290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419062
94	NC_013132	TTC	2	6	8350	8355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419062
95	NC_013132	CTA	2	6	8448	8453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419062
96	NC_013132	CTG	2	6	8471	8476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419062
97	NC_013132	CGT	2	6	8618	8623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419062
98	NC_013132	GCC	2	6	8687	8692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256419062
99	NC_013132	AAG	2	6	8782	8787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419062
100	NC_013132	AGT	2	6	8809	8814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419062
101	NC_013132	GGC	2	6	8825	8830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256419062
102	NC_013132	CTA	2	6	9057	9062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419063
103	NC_013132	GAA	2	6	9231	9236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419063
104	NC_013132	TGA	2	6	9346	9351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419063
105	NC_013132	ACC	2	6	9363	9368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419063
106	NC_013132	AGT	2	6	9437	9442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419063
107	NC_013132	AGA	2	6	9620	9625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419063
108	NC_013132	CTC	2	6	9823	9828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256419063
109	NC_013132	AAT	2	6	9855	9860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419063
110	NC_013132	GAA	2	6	9974	9979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419063
111	NC_013132	GCA	2	6	10029	10034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419063
112	NC_013132	ATC	2	6	10125	10130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419063
113	NC_013132	AAG	2	6	10217	10222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419063
114	NC_013132	GGT	2	6	10281	10286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419063
115	NC_013132	CTT	2	6	10511	10516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419063
116	NC_013132	TAT	2	6	10517	10522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419063
117	NC_013132	ATG	2	6	10587	10592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419063
118	NC_013132	TGC	2	6	10613	10618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419063
119	NC_013132	GGT	2	6	10680	10685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419063
120	NC_013132	ATT	2	6	10839	10844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419063
121	NC_013132	CTG	2	6	10848	10853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419063
122	NC_013132	TTC	2	6	11000	11005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419064
123	NC_013132	CAA	2	6	11095	11100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419064
124	NC_013132	CTC	2	6	11195	11200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256419064
125	NC_013132	GTC	2	6	11282	11287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419064
126	NC_013132	CGT	2	6	11339	11344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419064
127	NC_013132	TAT	2	6	11405	11410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419064
128	NC_013132	TAA	2	6	11471	11476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419064
129	NC_013132	AAT	2	6	11486	11491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419064
130	NC_013132	AAT	2	6	11502	11507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419064
131	NC_013132	AGA	2	6	11592	11597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419064
132	NC_013132	CAT	2	6	11611	11616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419064
133	NC_013132	GGT	2	6	11857	11862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419065
134	NC_013132	TTA	2	6	11978	11983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419065
135	NC_013132	ATA	2	6	12010	12015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419065
136	NC_013132	CTC	2	6	12062	12067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256419065
137	NC_013132	TGA	2	6	12209	12214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419065
138	NC_013132	TTC	2	6	12216	12221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419065
139	NC_013132	TAA	2	6	12267	12272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419065
140	NC_013132	GCA	2	6	12301	12306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419065
141	NC_013132	CAA	2	6	12360	12365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419065
142	NC_013132	ACA	2	6	12400	12405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419065
143	NC_013132	TAG	2	6	12552	12557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419065
144	NC_013132	TTA	2	6	12568	12573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419065
145	NC_013132	TTA	2	6	12668	12673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419065
146	NC_013132	AAG	2	6	12707	12712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419065
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148	NC_013132	CAT	2	6	13114	13119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419066
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150	NC_013132	CTT	2	6	13201	13206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419066
151	NC_013132	TCC	2	6	13230	13235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256419066
152	NC_013132	CCA	2	6	13255	13260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419066
153	NC_013132	ATT	2	6	13286	13291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419066
154	NC_013132	ATG	2	6	13334	13339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419066
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156	NC_013132	AAT	2	6	13446	13451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419066
157	NC_013132	ATT	2	6	13515	13520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419066
158	NC_013132	GCT	2	6	13546	13551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419066
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160	NC_013132	GGA	2	6	13778	13783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256419066
161	NC_013132	TAA	2	6	13811	13816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419066
162	NC_013132	TCA	2	6	13930	13935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419066
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245	NC_013132	TAC	2	6	19085	19090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419072
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247	NC_013132	AGA	2	6	19207	19212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419072
248	NC_013132	GCT	2	6	19295	19300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419072
249	NC_013132	GTA	2	6	19334	19339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419072
250	NC_013132	GGA	2	6	19369	19374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256419072
251	NC_013132	TTA	2	6	19388	19393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419072
252	NC_013132	CTG	2	6	19415	19420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419072
253	NC_013132	GTA	2	6	19493	19498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419072
254	NC_013132	GAA	2	6	19594	19599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419072
255	NC_013132	AAG	2	6	19783	19788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419073
256	NC_013132	GCA	2	6	19808	19813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419073
257	NC_013132	TGA	2	6	19858	19863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419073
258	NC_013132	CAA	2	6	19898	19903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419073
259	NC_013132	AAC	2	6	19914	19919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419073
260	NC_013132	TGA	2	6	19940	19945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419073
261	NC_013132	GAC	2	6	19977	19982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419073
262	NC_013132	TAA	2	6	20084	20089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419073
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266	NC_013132	CCA	2	6	20669	20674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419074
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270	NC_013132	GAA	2	6	20979	20984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419074
271	NC_013132	ATA	2	6	21048	21053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419074
272	NC_013132	TTC	2	6	21075	21080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419074
273	NC_013132	AAT	2	6	21097	21102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419074
274	NC_013132	AGG	2	6	21114	21119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256419074
275	NC_013132	GCA	2	6	21152	21157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419074
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278	NC_013132	GCA	2	6	21287	21292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419074
279	NC_013132	CGC	2	6	21471	21476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256419074
280	NC_013132	TTA	2	6	21487	21492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419074
281	NC_013132	CAT	2	6	21569	21574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419074
282	NC_013132	AAT	2	6	21576	21581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419074
283	NC_013132	CGG	2	6	21590	21595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256419074
284	NC_013132	CTT	2	6	21611	21616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419074
285	NC_013132	TAG	2	6	21640	21645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419074
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