MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Catenulispora acidiphila DSM 44928 chromosome

Total Repeats: 218368

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013131	TAT	2	6	143	148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013131	CCG	2	6	204	209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_013131	CCG	2	6	245	250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_013131	ACG	2	6	283	288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013131	ACC	2	6	386	391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256389233
6	NC_013131	TGA	2	6	557	562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256389233
7	NC_013131	GAC	2	6	613	618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389233
8	NC_013131	AGC	2	6	638	643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389233
9	NC_013131	ACC	2	6	661	666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256389233
10	NC_013131	TCG	2	6	710	715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389233
11	NC_013131	CGC	2	6	764	769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389233
12	NC_013131	CAG	2	6	784	789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389233
13	NC_013131	CGC	3	9	815	823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389233
14	NC_013131	CGG	2	6	857	862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389233
15	NC_013131	CCG	2	6	877	882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389233
16	NC_013131	CGG	2	6	915	920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389233
17	NC_013131	CGC	2	6	935	940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389233
18	NC_013131	GAG	2	6	961	966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389233
19	NC_013131	CTC	2	6	1020	1025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256389233
20	NC_013131	CGA	2	6	1032	1037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389233
21	NC_013131	CAG	2	6	1051	1056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389233
22	NC_013131	CGC	2	6	1122	1127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389233
23	NC_013131	GAG	2	6	1279	1284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389233
24	NC_013131	TCA	2	6	1298	1303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256389233
25	NC_013131	ACC	2	6	1328	1333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256389233
26	NC_013131	CGA	2	6	1371	1376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389233
27	NC_013131	AGG	2	6	1397	1402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389233
28	NC_013131	AGG	2	6	1409	1414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389233
29	NC_013131	TTC	2	6	1417	1422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256389233
30	NC_013131	GCC	2	6	1479	1484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389233
31	NC_013131	AGC	2	6	1487	1492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389233
32	NC_013131	GGA	2	6	1503	1508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389233
33	NC_013131	GCC	2	6	1554	1559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389233
34	NC_013131	AAG	2	6	1591	1596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256389233
35	NC_013131	GCA	2	6	1599	1604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389233
36	NC_013131	CGC	2	6	1619	1624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389233
37	NC_013131	CCA	2	6	1658	1663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256389233
38	NC_013131	GAA	2	6	1758	1763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256389233
39	NC_013131	CGA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389233
40	NC_013131	GGA	2	6	1845	1850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389233
41	NC_013131	CGG	2	6	1959	1964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389233
42	NC_013131	CAC	2	6	1974	1979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256389233
43	NC_013131	CCG	2	6	2113	2118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_013131	CTA	4	12	2534	2545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013131	TCG	2	6	2616	2621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013131	CGA	2	6	2634	2639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013131	GCC	2	6	2744	2749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_013131	ATG	2	6	2778	2783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013131	CGA	2	6	2796	2801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013131	GCC	2	6	2901	2906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389234
51	NC_013131	CGG	2	6	2907	2912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389234
52	NC_013131	GGC	2	6	2957	2962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389234
53	NC_013131	TCC	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256389234
54	NC_013131	GCT	2	6	3070	3075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389234
55	NC_013131	GGA	2	6	3187	3192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389234
56	NC_013131	CGC	2	6	3277	3282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389234
57	NC_013131	CGA	2	6	3289	3294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389234
58	NC_013131	GAC	2	6	3410	3415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389234
59	NC_013131	CGG	2	6	3475	3480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389234
60	NC_013131	CGG	2	6	3505	3510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389234
61	NC_013131	CGG	2	6	3578	3583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389234
62	NC_013131	CTG	2	6	3596	3601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389234
63	NC_013131	ACA	2	6	3645	3650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256389234
64	NC_013131	GCC	2	6	3686	3691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389234
65	NC_013131	TGG	2	6	3705	3710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256389234
66	NC_013131	CGA	2	6	3778	3783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389234
67	NC_013131	GCC	2	6	3939	3944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389234
68	NC_013131	AGG	2	6	3966	3971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389234
69	NC_013131	TGA	2	6	3984	3989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256389234
70	NC_013131	GAA	2	6	4090	4095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013131	GGC	2	6	4143	4148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389235
72	NC_013131	CGT	2	6	4184	4189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389235
73	NC_013131	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389235
74	NC_013131	CCG	2	6	4285	4290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389235
75	NC_013131	CTG	2	6	4329	4334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389235
76	NC_013131	CGG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389235
77	NC_013131	CTC	2	6	4401	4406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256389235
78	NC_013131	TCG	2	6	4426	4431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389235
79	NC_013131	GCG	2	6	4447	4452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389235
80	NC_013131	CGG	2	6	4487	4492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389235
81	NC_013131	CGA	2	6	4493	4498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389235
82	NC_013131	CGG	2	6	4571	4576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389235
83	NC_013131	CAT	2	6	4628	4633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256389235
84	NC_013131	GCT	2	6	4658	4663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389235
85	NC_013131	AGG	2	6	4714	4719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389235
86	NC_013131	GCT	2	6	4739	4744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389235
87	NC_013131	CTG	2	6	4749	4754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389235
88	NC_013131	GAC	3	9	4767	4775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389235
89	NC_013131	CGA	2	6	4805	4810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389235
90	NC_013131	AGG	2	6	4909	4914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389235
91	NC_013131	CGC	2	6	4937	4942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389235
92	NC_013131	CGG	2	6	4958	4963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389235
93	NC_013131	GAA	2	6	4973	4978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256389235
94	NC_013131	TCG	2	6	5080	5085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389236
95	NC_013131	TGC	2	6	5329	5334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389236
96	NC_013131	AGA	2	6	5354	5359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256389236
97	NC_013131	GCC	2	6	5392	5397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389236
98	NC_013131	TCG	2	6	5416	5421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389236
99	NC_013131	AGC	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389236
100	NC_013131	TGC	2	6	5488	5493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389236
101	NC_013131	GCG	2	6	5510	5515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389236
102	NC_013131	ACC	3	9	5560	5568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256389236
103	NC_013131	CGC	2	6	5594	5599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389236
104	NC_013131	GGC	2	6	5664	5669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389236
105	NC_013131	CGA	2	6	5692	5697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389236
106	NC_013131	CCG	2	6	5701	5706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389236
107	NC_013131	CCG	2	6	5719	5724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389236
108	NC_013131	CGA	2	6	5813	5818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389236
109	NC_013131	CCT	2	6	5836	5841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256389236
110	NC_013131	ACA	2	6	5851	5856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256389236
111	NC_013131	CTG	2	6	5931	5936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389236
112	NC_013131	CGG	2	6	5954	5959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389236
113	NC_013131	CGA	2	6	5978	5983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389236
114	NC_013131	GCC	3	9	6010	6018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389236
115	NC_013131	TCA	2	6	6055	6060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256389236
116	NC_013131	AGC	2	6	6088	6093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389236
117	NC_013131	GCG	2	6	6135	6140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389236
118	NC_013131	CGC	2	6	6217	6222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389237
119	NC_013131	GCC	2	6	6227	6232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389237
120	NC_013131	CCG	2	6	6277	6282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389237
121	NC_013131	CGA	2	6	6322	6327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389237
122	NC_013131	GCT	2	6	6340	6345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389237
123	NC_013131	GAT	2	6	6364	6369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256389237
124	NC_013131	CGG	3	9	6393	6401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389237
125	NC_013131	CGG	2	6	6403	6408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389237
126	NC_013131	ACG	2	6	6477	6482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389237
127	NC_013131	GCT	2	6	6547	6552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389237
128	NC_013131	CGG	2	6	6595	6600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389237
129	NC_013131	CGC	2	6	6607	6612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389237
130	NC_013131	CGG	2	6	6646	6651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389237
131	NC_013131	CGC	2	6	6730	6735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_013131	GGC	2	6	6739	6744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013131	TCA	2	6	6878	6883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013131	GCT	2	6	6916	6921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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259	NC_013131	GCC	3	9	12723	12731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
260	NC_013131	GCC	2	6	12756	12761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
261	NC_013131	CGG	2	6	12809	12814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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386	NC_013131	GTG	2	6	18635	18640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256389248
387	NC_013131	CCG	2	6	18668	18673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389248
388	NC_013131	CCG	2	6	18686	18691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389248
389	NC_013131	CCG	2	6	18704	18709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389248
390	NC_013131	CCG	2	6	18713	18718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389248
391	NC_013131	CGG	2	6	18760	18765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389248
392	NC_013131	GGC	2	6	18790	18795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389248
393	NC_013131	CGG	2	6	18826	18831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389248
394	NC_013131	GCT	2	6	18915	18920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389248
395	NC_013131	CGA	2	6	18972	18977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
396	NC_013131	GAA	2	6	19011	19016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
397	NC_013131	ATC	3	9	19080	19088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
398	NC_013131	TCG	2	6	19215	19220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389249
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401	NC_013131	GCG	2	6	19478	19483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389249
402	NC_013131	CGA	2	6	19507	19512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389249
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404	NC_013131	GCT	2	6	19627	19632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389249
405	NC_013131	GCC	2	6	19679	19684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389249
406	NC_013131	ACG	2	6	19689	19694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389249
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409	NC_013131	CCG	2	6	19860	19865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
410	NC_013131	GCC	2	6	19890	19895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389250
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416	NC_013131	CCG	2	6	20149	20154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389250
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418	NC_013131	TCT	2	6	20182	20187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256389250
419	NC_013131	CGT	2	6	20215	20220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389250
420	NC_013131	GCT	2	6	20230	20235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389250
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423	NC_013131	GGA	2	6	20447	20452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389250
424	NC_013131	TAT	2	6	20538	20543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
425	NC_013131	GCC	2	6	20584	20589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
426	NC_013131	GGC	2	6	20719	20724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389251
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430	NC_013131	GCC	2	6	20923	20928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389251
431	NC_013131	CGC	2	6	20949	20954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389251
432	NC_013131	CGT	2	6	21132	21137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389251
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435	NC_013131	ACC	2	6	21254	21259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256389251
436	NC_013131	GAG	2	6	21380	21385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_013131	CGG	2	6	22390	22395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
453	NC_013131	CGA	2	6	22425	22430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
454	NC_013131	GCG	2	6	22458	22463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_013131	CGG	2	6	22466	22471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
456	NC_013131	CCG	2	6	22475	22480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
457	NC_013131	GCG	2	6	22630	22635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389253
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462	NC_013131	GCA	2	6	23000	23005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389253
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489	NC_013131	GGC	2	6	24104	24109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389254
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494	NC_013131	CCT	2	6	24606	24611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256389255
495	NC_013131	TCA	2	6	24657	24662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256389255
496	NC_013131	GTG	2	6	24737	24742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256389255
497	NC_013131	CAG	2	6	24760	24765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389255
498	NC_013131	CTT	2	6	24769	24774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256389255
499	NC_013131	GAG	2	6	24784	24789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389255
500	NC_013131	GTC	2	6	24790	24795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389255

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