MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp54

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013130	ATTTTT	2	12	85	96	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013130	TAAAAA	2	12	101	112	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013130	ATTAAT	2	12	573	584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013130	AATTAA	2	12	1162	1173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013130	AAATTT	2	12	4544	4555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013130	CTTAAG	2	12	4616	4627	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013130	TAAAAA	2	12	4647	4658	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013130	TAACTT	2	12	15883	15894	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_013130	TTAAAT	2	12	17328	17339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013130	TCTTTT	2	12	24483	24494	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_013130	CTTTTT	2	12	38138	38149	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_013130	AAAATT	2	12	39574	39585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013130	ATTAAT	2	12	41091	41102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013130	GTTTAA	2	12	41380	41391	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013130	ATTGAT	2	12	42210	42221	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013130	ATTAAA	2	12	42560	42571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013130	TTTAAA	2	12	46344	46355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013130	AATATA	2	12	51368	51379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013130	TTGTTT	2	12	51579	51590	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.