MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp54

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013130	ATTTA	2	10	867	876	40 %	60 %	0 %	0 %	256055274
2	NC_013130	GAATT	2	10	1587	1596	40 %	40 %	20 %	0 %	256055275
3	NC_013130	AGCAA	2	10	1598	1607	60 %	0 %	20 %	20 %	256055275
4	NC_013130	TTTTA	2	10	2075	2084	20 %	80 %	0 %	0 %	256055276
5	NC_013130	GGCAT	2	10	2448	2457	20 %	20 %	40 %	20 %	256055276
6	NC_013130	TAAAT	2	10	4250	4259	60 %	40 %	0 %	0 %	256055277
7	NC_013130	TTAAA	2	10	4897	4906	60 %	40 %	0 %	0 %	256055278
8	NC_013130	AAGAA	2	10	5092	5101	80 %	0 %	20 %	0 %	256055278
9	NC_013130	CAATT	2	10	5750	5759	40 %	40 %	0 %	20 %	256055280
10	NC_013130	TAAAA	2	10	5831	5840	80 %	20 %	0 %	0 %	256055280
11	NC_013130	CATTG	2	10	6670	6679	20 %	40 %	20 %	20 %	256055281
12	NC_013130	AATTT	2	10	8380	8389	40 %	60 %	0 %	0 %	256055283
13	NC_013130	AAGAG	2	10	8720	8729	60 %	0 %	40 %	0 %	256055284
14	NC_013130	CTTTT	2	10	9236	9245	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013130	ATTTT	2	10	9355	9364	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013130	TATAA	2	10	9397	9406	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013130	AGTAA	2	10	9700	9709	60 %	20 %	20 %	0 %	256055286
18	NC_013130	AGTAA	2	10	10606	10615	60 %	20 %	20 %	0 %	256055287
19	NC_013130	TACTT	2	10	11710	11719	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013130	ATAAA	2	10	12551	12560	80 %	20 %	0 %	0 %	256055288
21	NC_013130	ATTCA	2	10	13888	13897	40 %	40 %	0 %	20 %	256055290
22	NC_013130	TTAAA	2	10	13920	13929	60 %	40 %	0 %	0 %	256055290
23	NC_013130	GATTT	2	10	14259	14268	20 %	60 %	20 %	0 %	256055290
24	NC_013130	TTTGA	2	10	15065	15074	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013130	ATAAA	3	15	17360	17374	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013130	TTTTA	2	10	17437	17446	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013130	ATTTT	2	10	17464	17473	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013130	AATTA	2	10	18100	18109	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013130	AATAA	2	10	18162	18171	80 %	20 %	0 %	0 %	256055296
30	NC_013130	AAAAG	2	10	19156	19165	80 %	0 %	20 %	0 %	256055297
31	NC_013130	TTCTT	2	10	19837	19846	0 %	80 %	0 %	20 %	256055297
32	NC_013130	CAAAA	2	10	20015	20024	80 %	0 %	0 %	20 %	256055297
33	NC_013130	TAATT	2	10	20424	20433	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013130	TGATT	2	10	21598	21607	20 %	60 %	20 %	0 %	256055299
35	NC_013130	AATTA	2	10	23129	23138	60 %	40 %	0 %	0 %	256055300
36	NC_013130	TATTT	2	10	23389	23398	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013130	ATTTT	2	10	25106	25115	20 %	80 %	0 %	0 %	256055302
38	NC_013130	TTAAT	2	10	25220	25229	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013130	CAAAT	2	10	28515	28524	60 %	20 %	0 %	20 %	256055306
40	NC_013130	TTTAA	2	10	29243	29252	40 %	60 %	0 %	0 %	256055307
41	NC_013130	GTTTT	2	10	30379	30388	0 %	80 %	20 %	0 %	256055310
42	NC_013130	TAATG	2	10	31879	31888	40 %	40 %	20 %	0 %	256055312
43	NC_013130	TAGAT	2	10	33536	33545	40 %	40 %	20 %	0 %	256055315
44	NC_013130	AAATA	2	10	33806	33815	80 %	20 %	0 %	0 %	256055315
45	NC_013130	AAATC	2	10	34436	34445	60 %	20 %	0 %	20 %	256055316
46	NC_013130	CCAAG	2	10	35667	35676	40 %	0 %	20 %	40 %	256055317
47	NC_013130	AGCAT	2	10	36175	36184	40 %	20 %	20 %	20 %	256055318
48	NC_013130	TATTT	2	10	36301	36310	20 %	80 %	0 %	0 %	256055319
49	NC_013130	CAAAT	2	10	36526	36535	60 %	20 %	0 %	20 %	256055319
50	NC_013130	ATTTT	2	10	39477	39486	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013130	TGCTC	2	10	39887	39896	0 %	40 %	20 %	40 %	256055323
52	NC_013130	AGAAT	2	10	40033	40042	60 %	20 %	20 %	0 %	256055323
53	NC_013130	TATTT	2	10	40193	40202	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013130	ATTTG	2	10	40834	40843	20 %	60 %	20 %	0 %	256055324
55	NC_013130	CAAGA	2	10	41005	41014	60 %	0 %	20 %	20 %	256055324
56	NC_013130	TAATA	2	10	42240	42249	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013130	AGATG	2	10	42347	42356	40 %	20 %	40 %	0 %	256055326
58	NC_013130	ATTAA	2	10	42549	42558	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013130	TCCTT	2	10	43413	43422	0 %	60 %	0 %	40 %	256055327
60	NC_013130	TGTAT	2	10	43823	43832	20 %	60 %	20 %	0 %	256055328
61	NC_013130	ATTTT	2	10	44539	44548	20 %	80 %	0 %	0 %	256055328
62	NC_013130	TTCTT	2	10	44889	44898	0 %	80 %	0 %	20 %	256055329
63	NC_013130	TTTGT	2	10	45554	45563	0 %	80 %	20 %	0 %	256055329
64	NC_013130	TATAT	2	10	46974	46983	40 %	60 %	0 %	0 %	256055330
65	NC_013130	CTTTT	2	10	49793	49802	0 %	80 %	0 %	20 %	256055333
66	NC_013130	ATTTT	2	10	50831	50840	20 %	80 %	0 %	0 %	256055335
67	NC_013130	ATATA	2	10	52732	52741	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013130	AAAAG	2	10	52947	52956	80 %	0 %	20 %	0 %	256055337
69	NC_013130	TAAAT	2	10	53742	53751	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.