MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp54

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013130	CTTTT	2	10	9236	9245	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013130	ATTTT	2	10	9355	9364	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013130	TATAA	2	10	9397	9406	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013130	TACTT	2	10	11710	11719	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013130	TTTGA	2	10	15065	15074	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013130	ATAAA	3	15	17360	17374	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013130	TTTTA	2	10	17437	17446	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013130	ATTTT	2	10	17464	17473	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013130	AATTA	2	10	18100	18109	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013130	TAATT	2	10	20424	20433	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013130	TATTT	2	10	23389	23398	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013130	TTAAT	2	10	25220	25229	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013130	ATTTT	2	10	39477	39486	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013130	TATTT	2	10	40193	40202	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013130	TAATA	2	10	42240	42249	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013130	ATTAA	2	10	42549	42558	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013130	ATATA	2	10	52732	52741	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013130	TAAAT	2	10	53742	53751	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.