MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp54

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013130	ATTTA	2	10	867	876	40 %	60 %	0 %	0 %	256055274
2	NC_013130	GAATT	2	10	1587	1596	40 %	40 %	20 %	0 %	256055275
3	NC_013130	AGCAA	2	10	1598	1607	60 %	0 %	20 %	20 %	256055275
4	NC_013130	TTTTA	2	10	2075	2084	20 %	80 %	0 %	0 %	256055276
5	NC_013130	GGCAT	2	10	2448	2457	20 %	20 %	40 %	20 %	256055276
6	NC_013130	TAAAT	2	10	4250	4259	60 %	40 %	0 %	0 %	256055277
7	NC_013130	TTAAA	2	10	4897	4906	60 %	40 %	0 %	0 %	256055278
8	NC_013130	AAGAA	2	10	5092	5101	80 %	0 %	20 %	0 %	256055278
9	NC_013130	CAATT	2	10	5750	5759	40 %	40 %	0 %	20 %	256055280
10	NC_013130	TAAAA	2	10	5831	5840	80 %	20 %	0 %	0 %	256055280
11	NC_013130	CATTG	2	10	6670	6679	20 %	40 %	20 %	20 %	256055281
12	NC_013130	AATTT	2	10	8380	8389	40 %	60 %	0 %	0 %	256055283
13	NC_013130	AAGAG	2	10	8720	8729	60 %	0 %	40 %	0 %	256055284
14	NC_013130	AGTAA	2	10	9700	9709	60 %	20 %	20 %	0 %	256055286
15	NC_013130	AGTAA	2	10	10606	10615	60 %	20 %	20 %	0 %	256055287
16	NC_013130	ATAAA	2	10	12551	12560	80 %	20 %	0 %	0 %	256055288
17	NC_013130	ATTCA	2	10	13888	13897	40 %	40 %	0 %	20 %	256055290
18	NC_013130	TTAAA	2	10	13920	13929	60 %	40 %	0 %	0 %	256055290
19	NC_013130	GATTT	2	10	14259	14268	20 %	60 %	20 %	0 %	256055290
20	NC_013130	AATAA	2	10	18162	18171	80 %	20 %	0 %	0 %	256055296
21	NC_013130	AAAAG	2	10	19156	19165	80 %	0 %	20 %	0 %	256055297
22	NC_013130	TTCTT	2	10	19837	19846	0 %	80 %	0 %	20 %	256055297
23	NC_013130	CAAAA	2	10	20015	20024	80 %	0 %	0 %	20 %	256055297
24	NC_013130	TGATT	2	10	21598	21607	20 %	60 %	20 %	0 %	256055299
25	NC_013130	AATTA	2	10	23129	23138	60 %	40 %	0 %	0 %	256055300
26	NC_013130	ATTTT	2	10	25106	25115	20 %	80 %	0 %	0 %	256055302
27	NC_013130	CAAAT	2	10	28515	28524	60 %	20 %	0 %	20 %	256055306
28	NC_013130	TTTAA	2	10	29243	29252	40 %	60 %	0 %	0 %	256055307
29	NC_013130	GTTTT	2	10	30379	30388	0 %	80 %	20 %	0 %	256055310
30	NC_013130	TAATG	2	10	31879	31888	40 %	40 %	20 %	0 %	256055312
31	NC_013130	TAGAT	2	10	33536	33545	40 %	40 %	20 %	0 %	256055315
32	NC_013130	AAATA	2	10	33806	33815	80 %	20 %	0 %	0 %	256055315
33	NC_013130	AAATC	2	10	34436	34445	60 %	20 %	0 %	20 %	256055316
34	NC_013130	CCAAG	2	10	35667	35676	40 %	0 %	20 %	40 %	256055317
35	NC_013130	AGCAT	2	10	36175	36184	40 %	20 %	20 %	20 %	256055318
36	NC_013130	TATTT	2	10	36301	36310	20 %	80 %	0 %	0 %	256055319
37	NC_013130	CAAAT	2	10	36526	36535	60 %	20 %	0 %	20 %	256055319
38	NC_013130	TGCTC	2	10	39887	39896	0 %	40 %	20 %	40 %	256055323
39	NC_013130	AGAAT	2	10	40033	40042	60 %	20 %	20 %	0 %	256055323
40	NC_013130	ATTTG	2	10	40834	40843	20 %	60 %	20 %	0 %	256055324
41	NC_013130	CAAGA	2	10	41005	41014	60 %	0 %	20 %	20 %	256055324
42	NC_013130	AGATG	2	10	42347	42356	40 %	20 %	40 %	0 %	256055326
43	NC_013130	TCCTT	2	10	43413	43422	0 %	60 %	0 %	40 %	256055327
44	NC_013130	TGTAT	2	10	43823	43832	20 %	60 %	20 %	0 %	256055328
45	NC_013130	ATTTT	2	10	44539	44548	20 %	80 %	0 %	0 %	256055328
46	NC_013130	TTCTT	2	10	44889	44898	0 %	80 %	0 %	20 %	256055329
47	NC_013130	TTTGT	2	10	45554	45563	0 %	80 %	20 %	0 %	256055329
48	NC_013130	TATAT	2	10	46974	46983	40 %	60 %	0 %	0 %	256055330
49	NC_013130	CTTTT	2	10	49793	49802	0 %	80 %	0 %	20 %	256055333
50	NC_013130	ATTTT	2	10	50831	50840	20 %	80 %	0 %	0 %	256055335
51	NC_013130	AAAAG	2	10	52947	52956	80 %	0 %	20 %	0 %	256055337

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.