MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp54

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013130	AAAT	2	8	308	315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013130	AATT	2	8	408	415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013130	GCAA	2	8	530	537	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013130	TTGC	2	8	560	567	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013130	TAAT	2	8	1415	1422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013130	TAAT	2	8	1985	1992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013130	TCTA	2	8	2916	2923	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013130	TAAA	2	8	4282	4289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013130	TACA	2	8	4304	4311	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013130	ATGT	2	8	4316	4323	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013130	TAAA	2	8	4413	4420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013130	TAAA	2	8	5184	5191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013130	ATAA	2	8	8240	8247	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013130	TTAA	2	8	9321	9328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013130	TGAA	2	8	11493	11500	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013130	ATAA	3	12	11503	11514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013130	TAAA	2	8	11568	11575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013130	ACTT	2	8	11641	11648	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013130	ATTA	2	8	11737	11744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013130	ATTT	2	8	14921	14928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013130	TTGG	2	8	15992	15999	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013130	TTAG	2	8	17375	17382	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013130	TTAA	2	8	18154	18161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013130	TAAT	2	8	20159	20166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013130	ATTT	2	8	20692	20699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013130	AAAT	2	8	21075	21082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013130	CCTT	2	8	23304	23311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013130	GATT	2	8	23724	23731	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013130	AGTA	2	8	25281	25288	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013130	TAAT	2	8	25319	25326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013130	TTTG	2	8	27335	27342	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013130	AGAA	2	8	30670	30677	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013130	AGAA	2	8	30680	30687	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013130	ATTA	2	8	34962	34969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013130	AATC	2	8	36585	36592	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013130	TAAT	2	8	40175	40182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013130	ATTA	2	8	41157	41164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013130	ATTT	2	8	42050	42057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013130	TACA	2	8	42088	42095	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013130	ATTT	2	8	42121	42128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013130	CTTG	2	8	42488	42495	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013130	AATT	2	8	42498	42505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013130	TATT	2	8	42525	42532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013130	ATTA	2	8	43578	43585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013130	ATTA	2	8	46013	46020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013130	ATTA	2	8	46030	46037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013130	TTAA	2	8	46038	46045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013130	AATA	2	8	46076	46083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013130	TAAA	2	8	46084	46091	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013130	ATTT	2	8	46397	46404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013130	ATTA	2	8	47332	47339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013130	ATTT	2	8	47444	47451	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013130	ATTT	2	8	47454	47461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013130	ATTA	2	8	48334	48341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013130	ATTT	2	8	48446	48453	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013130	ATTT	2	8	48456	48463	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013130	ATTA	2	8	49373	49380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013130	ATTT	2	8	49455	49462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013130	ATTT	2	8	49465	49472	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013130	TTTG	2	8	49545	49552	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013130	TGAT	2	8	50245	50252	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013130	TTAA	2	8	51727	51734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013130	TTTA	2	8	51753	51760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013130	AAAT	2	8	51803	51810	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013130	AAGG	2	8	52814	52821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013130	AATT	2	8	52824	52831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.