MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp54

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013130	ATTT	2	8	797	804	25 %	75 %	0 %	0 %	256055274
2	NC_013130	AGCA	2	8	960	967	50 %	0 %	25 %	25 %	256055274
3	NC_013130	TTAA	2	8	2043	2050	50 %	50 %	0 %	0 %	256055276
4	NC_013130	CAAA	2	8	2542	2549	75 %	0 %	0 %	25 %	256055276
5	NC_013130	ATTT	2	8	2650	2657	25 %	75 %	0 %	0 %	256055276
6	NC_013130	CAAT	2	8	3614	3621	50 %	25 %	0 %	25 %	256055277
7	NC_013130	CCAC	2	8	3747	3754	25 %	0 %	0 %	75 %	256055277
8	NC_013130	AACA	2	8	4203	4210	75 %	0 %	0 %	25 %	256055277
9	NC_013130	CTTT	2	8	4835	4842	0 %	75 %	0 %	25 %	256055278
10	NC_013130	AGCA	2	8	4868	4875	50 %	0 %	25 %	25 %	256055278
11	NC_013130	ACAA	2	8	5794	5801	75 %	0 %	0 %	25 %	256055280
12	NC_013130	GCAA	2	8	6062	6069	50 %	0 %	25 %	25 %	256055280
13	NC_013130	ACAA	2	8	6480	6487	75 %	0 %	0 %	25 %	256055280
14	NC_013130	CAAA	2	8	7582	7589	75 %	0 %	0 %	25 %	256055282
15	NC_013130	TTGA	2	8	7644	7651	25 %	50 %	25 %	0 %	256055282
16	NC_013130	AAAT	2	8	7684	7691	75 %	25 %	0 %	0 %	256055282
17	NC_013130	ATTT	2	8	8013	8020	25 %	75 %	0 %	0 %	256055282
18	NC_013130	TAAA	2	8	8417	8424	75 %	25 %	0 %	0 %	256055283
19	NC_013130	TCAA	2	8	8745	8752	50 %	25 %	0 %	25 %	256055284
20	NC_013130	ATCA	2	8	9117	9124	50 %	25 %	0 %	25 %	256055285
21	NC_013130	TATT	2	8	9460	9467	25 %	75 %	0 %	0 %	256055286
22	NC_013130	GAAG	2	8	10858	10865	50 %	0 %	50 %	0 %	256055287
23	NC_013130	TTTA	2	8	11930	11937	25 %	75 %	0 %	0 %	256055288
24	NC_013130	TAAA	2	8	11939	11946	75 %	25 %	0 %	0 %	256055288
25	NC_013130	GAAA	2	8	11953	11960	75 %	0 %	25 %	0 %	256055288
26	NC_013130	AAAT	2	8	12194	12201	75 %	25 %	0 %	0 %	256055288
27	NC_013130	GAAA	2	8	13373	13380	75 %	0 %	25 %	0 %	256055289
28	NC_013130	TCAA	2	8	13682	13689	50 %	25 %	0 %	25 %	256055290
29	NC_013130	ATTT	2	8	14079	14086	25 %	75 %	0 %	0 %	256055290
30	NC_013130	TAAT	2	8	14130	14137	50 %	50 %	0 %	0 %	256055290
31	NC_013130	TAAA	2	8	14316	14323	75 %	25 %	0 %	0 %	256055290
32	NC_013130	AAAG	2	8	14714	14721	75 %	0 %	25 %	0 %	256055291
33	NC_013130	CTTT	2	8	14827	14834	0 %	75 %	0 %	25 %	256055291
34	NC_013130	GAAA	2	8	15786	15793	75 %	0 %	25 %	0 %	256055293
35	NC_013130	ATGA	2	8	16378	16385	50 %	25 %	25 %	0 %	256055294
36	NC_013130	TATT	2	8	16469	16476	25 %	75 %	0 %	0 %	256055294
37	NC_013130	ATTT	2	8	16737	16744	25 %	75 %	0 %	0 %	256055295
38	NC_013130	GCAA	2	8	16842	16849	50 %	0 %	25 %	25 %	256055295
39	NC_013130	TTCT	2	8	17218	17225	0 %	75 %	0 %	25 %	256055295
40	NC_013130	AAAT	2	8	18284	18291	75 %	25 %	0 %	0 %	256055296
41	NC_013130	ACCA	2	8	18860	18867	50 %	0 %	0 %	50 %	256055297
42	NC_013130	AAAT	2	8	18890	18897	75 %	25 %	0 %	0 %	256055297
43	NC_013130	TCAA	2	8	19579	19586	50 %	25 %	0 %	25 %	256055297
44	NC_013130	GTGG	2	8	19635	19642	0 %	25 %	75 %	0 %	256055297
45	NC_013130	TGCT	2	8	19735	19742	0 %	50 %	25 %	25 %	256055297
46	NC_013130	TTTG	2	8	19931	19938	0 %	75 %	25 %	0 %	256055297
47	NC_013130	GAAA	2	8	21181	21188	75 %	0 %	25 %	0 %	256055299
48	NC_013130	CTTT	2	8	21224	21231	0 %	75 %	0 %	25 %	256055299
49	NC_013130	TGAC	2	8	21282	21289	25 %	25 %	25 %	25 %	256055299
50	NC_013130	TAAA	2	8	21375	21382	75 %	25 %	0 %	0 %	256055299
51	NC_013130	TAAG	2	8	21438	21445	50 %	25 %	25 %	0 %	256055299
52	NC_013130	TTGT	2	8	21750	21757	0 %	75 %	25 %	0 %	256055300
53	NC_013130	TGCT	2	8	22966	22973	0 %	50 %	25 %	25 %	256055300
54	NC_013130	GCAA	2	8	24163	24170	50 %	0 %	25 %	25 %	256055301
55	NC_013130	GATT	2	8	24895	24902	25 %	50 %	25 %	0 %	256055302
56	NC_013130	CAGA	2	8	25023	25030	50 %	0 %	25 %	25 %	256055302
57	NC_013130	AATC	2	8	25542	25549	50 %	25 %	0 %	25 %	256055303
58	NC_013130	AATT	2	8	25626	25633	50 %	50 %	0 %	0 %	256055303
59	NC_013130	CTTG	2	8	25652	25659	0 %	50 %	25 %	25 %	256055303
60	NC_013130	AAAG	2	8	25660	25667	75 %	0 %	25 %	0 %	256055303
61	NC_013130	ATTT	2	8	26044	26051	25 %	75 %	0 %	0 %	256055303
62	NC_013130	CAAA	2	8	26210	26217	75 %	0 %	0 %	25 %	256055303
63	NC_013130	ATAA	2	8	26919	26926	75 %	25 %	0 %	0 %	256055304
64	NC_013130	GAAT	2	8	27293	27300	50 %	25 %	25 %	0 %	256055304
65	NC_013130	TACT	2	8	28306	28313	25 %	50 %	0 %	25 %	256055306
66	NC_013130	AATT	2	8	28591	28598	50 %	50 %	0 %	0 %	256055306
67	NC_013130	TGTT	2	8	29181	29188	0 %	75 %	25 %	0 %	256055307
68	NC_013130	TTAA	2	8	29569	29576	50 %	50 %	0 %	0 %	256055308
69	NC_013130	CAAA	2	8	29914	29921	75 %	0 %	0 %	25 %	256055309
70	NC_013130	GCAA	2	8	31225	31232	50 %	0 %	25 %	25 %	256055311
71	NC_013130	CAAG	2	8	31269	31276	50 %	0 %	25 %	25 %	256055311
72	NC_013130	AGCA	2	8	31894	31901	50 %	0 %	25 %	25 %	256055312
73	NC_013130	CAAT	2	8	32181	32188	50 %	25 %	0 %	25 %	256055312
74	NC_013130	ACAT	2	8	32309	32316	50 %	25 %	0 %	25 %	256055313
75	NC_013130	GGTT	2	8	32584	32591	0 %	50 %	50 %	0 %	256055313
76	NC_013130	TACA	2	8	32850	32857	50 %	25 %	0 %	25 %	256055314
77	NC_013130	AGCA	2	8	34454	34461	50 %	0 %	25 %	25 %	256055316
78	NC_013130	GTAT	2	8	35117	35124	25 %	50 %	25 %	0 %	256055317
79	NC_013130	TTTA	2	8	35835	35842	25 %	75 %	0 %	0 %	256055317
80	NC_013130	AATT	2	8	35971	35978	50 %	50 %	0 %	0 %	256055318
81	NC_013130	TAAT	2	8	36136	36143	50 %	50 %	0 %	0 %	256055318
82	NC_013130	ATGA	2	8	37115	37122	50 %	25 %	25 %	0 %	256055320
83	NC_013130	ATTT	2	8	37261	37268	25 %	75 %	0 %	0 %	256055320
84	NC_013130	TTTG	2	8	37327	37334	0 %	75 %	25 %	0 %	256055320
85	NC_013130	AGAC	2	8	37438	37445	50 %	0 %	25 %	25 %	256055320
86	NC_013130	GTTG	2	8	38258	38265	0 %	50 %	50 %	0 %	256055322
87	NC_013130	AGTG	2	8	38770	38777	25 %	25 %	50 %	0 %	256055322
88	NC_013130	AATA	2	8	40080	40087	75 %	25 %	0 %	0 %	256055323
89	NC_013130	AAAT	2	8	40097	40104	75 %	25 %	0 %	0 %	256055323
90	NC_013130	GCTT	2	8	40801	40808	0 %	50 %	25 %	25 %	256055324
91	NC_013130	TTTA	2	8	40986	40993	25 %	75 %	0 %	0 %	256055324
92	NC_013130	ATTT	2	8	41053	41060	25 %	75 %	0 %	0 %	256055324
93	NC_013130	ACTT	2	8	41471	41478	25 %	50 %	0 %	25 %	256055325
94	NC_013130	TTGC	2	8	42322	42329	0 %	50 %	25 %	25 %	256055326
95	NC_013130	GTTT	2	8	42872	42879	0 %	75 %	25 %	0 %	256055327
96	NC_013130	AATT	2	8	43521	43528	50 %	50 %	0 %	0 %	256055327
97	NC_013130	GTTT	2	8	44080	44087	0 %	75 %	25 %	0 %	256055328
98	NC_013130	TTTG	2	8	44363	44370	0 %	75 %	25 %	0 %	256055328
99	NC_013130	ATTT	2	8	45009	45016	25 %	75 %	0 %	0 %	256055329
100	NC_013130	GAAA	2	8	45033	45040	75 %	0 %	25 %	0 %	256055329
101	NC_013130	ATTT	2	8	45170	45177	25 %	75 %	0 %	0 %	256055329
102	NC_013130	TTTG	2	8	45430	45437	0 %	75 %	25 %	0 %	256055329
103	NC_013130	ATAG	2	8	46500	46507	50 %	25 %	25 %	0 %	256055330
104	NC_013130	ATTG	2	8	46717	46724	25 %	50 %	25 %	0 %	256055330
105	NC_013130	AATC	2	8	47817	47824	50 %	25 %	0 %	25 %	256055331
106	NC_013130	GATT	2	8	49248	49255	25 %	50 %	25 %	0 %	256055332
107	NC_013130	CTTT	2	8	50092	50099	0 %	75 %	0 %	25 %	256055334
108	NC_013130	TATT	2	8	50937	50944	25 %	75 %	0 %	0 %	256055335
109	NC_013130	TAAA	2	8	52326	52333	75 %	25 %	0 %	0 %	256055336
110	NC_013130	ATTG	3	12	53622	53633	25 %	50 %	25 %	0 %	256055337

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.