MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp54

Total Repeats: 592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013130	TGG	2	6	846	851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256055274
2	NC_013130	ATT	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055274
3	NC_013130	TTA	2	6	995	1000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055274
4	NC_013130	TTA	2	6	1125	1130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055274
5	NC_013130	ATT	2	6	1466	1471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055275
6	NC_013130	ATG	2	6	1518	1523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055275
7	NC_013130	AAC	2	6	1532	1537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055275
8	NC_013130	TGA	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055275
9	NC_013130	TTA	2	6	1682	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055275
10	NC_013130	TAG	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055275
11	NC_013130	AGA	2	6	1756	1761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055275
12	NC_013130	AGA	2	6	1792	1797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055275
13	NC_013130	AGA	2	6	1858	1863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055275
14	NC_013130	TAA	2	6	1939	1944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055275
15	NC_013130	ATT	2	6	2097	2102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055276
16	NC_013130	ATT	2	6	2219	2224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055276
17	NC_013130	TTA	2	6	2380	2385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055276
18	NC_013130	AGT	2	6	2426	2431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055276
19	NC_013130	TAT	2	6	2441	2446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055276
20	NC_013130	TAA	2	6	2521	2526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055276
21	NC_013130	TAA	2	6	2791	2796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055276
22	NC_013130	TTA	2	6	2799	2804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055276
23	NC_013130	ATC	2	6	2831	2836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055276
24	NC_013130	TTG	2	6	3076	3081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256055277
25	NC_013130	TAA	2	6	3082	3087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055277
26	NC_013130	ACT	2	6	3130	3135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055277
27	NC_013130	TCT	2	6	3238	3243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055277
28	NC_013130	CAA	2	6	3327	3332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055277
29	NC_013130	TCT	3	9	3355	3363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055277
30	NC_013130	GTA	2	6	3415	3420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055277
31	NC_013130	AAG	2	6	3441	3446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055277
32	NC_013130	TTG	2	6	3468	3473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256055277
33	NC_013130	CAA	2	6	3494	3499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055277
34	NC_013130	ACC	2	6	3516	3521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256055277
35	NC_013130	TTG	2	6	3546	3551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256055277
36	NC_013130	AGA	2	6	3568	3573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055277
37	NC_013130	TCT	2	6	3583	3588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055277
38	NC_013130	AAT	2	6	3605	3610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055277
39	NC_013130	AGA	2	6	3642	3647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055277
40	NC_013130	TCA	2	6	3730	3735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055277
41	NC_013130	TCT	2	6	3814	3819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055277
42	NC_013130	GAA	2	6	3907	3912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055277
43	NC_013130	CTT	2	6	3914	3919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055277
44	NC_013130	TTA	2	6	4133	4138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055277
45	NC_013130	GTG	2	6	4159	4164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256055277
46	NC_013130	TCT	3	9	4174	4182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055277
47	NC_013130	TAA	3	9	4220	4228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055277
48	NC_013130	CAT	2	6	4678	4683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055278
49	NC_013130	TAG	2	6	4720	4725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055278
50	NC_013130	TGC	2	6	4779	4784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256055278
51	NC_013130	AAC	2	6	4859	4864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055278
52	NC_013130	ACC	2	6	4941	4946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256055278
53	NC_013130	CTT	2	6	4966	4971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055278
54	NC_013130	TCA	2	6	4977	4982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055278
55	NC_013130	AAT	2	6	5074	5079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055278
56	NC_013130	TAA	2	6	5102	5107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055278
57	NC_013130	ATA	2	6	5116	5121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055278
58	NC_013130	TGA	2	6	5322	5327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055279
59	NC_013130	AAC	2	6	5347	5352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055279
60	NC_013130	GAA	2	6	5377	5382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055279
61	NC_013130	AGA	2	6	5687	5692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055280
62	NC_013130	ATA	2	6	5766	5771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055280
63	NC_013130	AGA	2	6	5870	5875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055280
64	NC_013130	TAC	2	6	5992	5997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055280
65	NC_013130	CTA	2	6	6071	6076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055280
66	NC_013130	AAG	2	6	6171	6176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055280
67	NC_013130	AGT	2	6	6194	6199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055280
68	NC_013130	ACA	2	6	6262	6267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055280
69	NC_013130	ATT	2	6	6339	6344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055280
70	NC_013130	ATG	2	6	6385	6390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055280
71	NC_013130	TAA	2	6	6434	6439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055280
72	NC_013130	ATT	3	9	6465	6473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055280
73	NC_013130	CTT	2	6	6492	6497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055280
74	NC_013130	GCT	2	6	6616	6621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256055281
75	NC_013130	TAT	2	6	6754	6759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055281
76	NC_013130	ATA	3	9	6866	6874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055281
77	NC_013130	GCA	2	6	6917	6922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256055281
78	NC_013130	TTA	2	6	7029	7034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055281
79	NC_013130	GAA	2	6	7053	7058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055281
80	NC_013130	CAG	2	6	7122	7127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256055281
81	NC_013130	TGA	2	6	7289	7294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055282
82	NC_013130	TAG	2	6	7297	7302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055282
83	NC_013130	AAC	2	6	7365	7370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055282
84	NC_013130	CAC	2	6	7489	7494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256055282
85	NC_013130	AAC	2	6	7798	7803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055282
86	NC_013130	GCT	2	6	7810	7815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256055282
87	NC_013130	TGG	2	6	7854	7859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256055282
88	NC_013130	TGA	2	6	7901	7906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055282
89	NC_013130	AAT	2	6	7913	7918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055282
90	NC_013130	TAA	2	6	7984	7989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055282
91	NC_013130	AGA	2	6	8057	8062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055282
92	NC_013130	TCT	2	6	8127	8132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055282
93	NC_013130	TAC	2	6	8175	8180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055282
94	NC_013130	GAA	2	6	8208	8213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055282
95	NC_013130	CAA	2	6	8285	8290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055283
96	NC_013130	AGG	2	6	8316	8321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256055283
97	NC_013130	TAA	2	6	8336	8341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055283
98	NC_013130	GAT	2	6	8346	8351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055283
99	NC_013130	AAT	2	6	8478	8483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055284
100	NC_013130	TAA	2	6	8569	8574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055284
101	NC_013130	AGA	2	6	8612	8617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055284
102	NC_013130	TAA	3	9	8651	8659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055284
103	NC_013130	ATG	2	6	8686	8691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055284
104	NC_013130	CAT	2	6	8705	8710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055284
105	NC_013130	TTA	2	6	8881	8886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055285
106	NC_013130	AGA	2	6	8931	8936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055285
107	NC_013130	CAT	2	6	8939	8944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055285
108	NC_013130	TAT	2	6	9003	9008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055285
109	NC_013130	TGC	2	6	9135	9140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256055285
110	NC_013130	AGC	2	6	9514	9519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256055286
111	NC_013130	AGA	2	6	9759	9764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055286
112	NC_013130	TCA	2	6	9808	9813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055286
113	NC_013130	AGA	2	6	9816	9821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055286
114	NC_013130	TAA	2	6	9857	9862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055286
115	NC_013130	CTG	2	6	9965	9970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256055286
116	NC_013130	TGG	2	6	9983	9988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256055286
117	NC_013130	AAG	2	6	9992	9997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055286
118	NC_013130	AGT	2	6	10066	10071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055286
119	NC_013130	GCT	2	6	10072	10077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256055286
120	NC_013130	ACA	2	6	10185	10190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055286
121	NC_013130	CAG	2	6	10223	10228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256055286
122	NC_013130	TGA	2	6	10245	10250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055286
123	NC_013130	ATT	2	6	10287	10292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055287
124	NC_013130	AGA	2	6	10440	10445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055287
125	NC_013130	TAA	2	6	10467	10472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055287
126	NC_013130	CAA	2	6	10523	10528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055287
127	NC_013130	CTG	2	6	10628	10633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256055287
128	NC_013130	TAA	2	6	10737	10742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055287
129	NC_013130	ACA	2	6	10882	10887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055287
130	NC_013130	AAG	2	6	10898	10903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055287
131	NC_013130	ACA	2	6	11085	11090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055287
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258	NC_013130	CAT	2	6	22606	22611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055300
259	NC_013130	TTC	2	6	22640	22645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055300
260	NC_013130	CTT	2	6	22656	22661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055300
261	NC_013130	GTC	2	6	23003	23008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256055300
262	NC_013130	ATC	2	6	23210	23215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055300
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264	NC_013130	GAA	2	6	23959	23964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055301
265	NC_013130	AGA	2	6	24024	24029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055301
266	NC_013130	CAA	2	6	24190	24195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055301
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274	NC_013130	TTG	2	6	24804	24809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256055302
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277	NC_013130	TTA	2	6	25002	25007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055302
278	NC_013130	TAA	2	6	25035	25040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055302
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287	NC_013130	TTG	2	6	26117	26122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256055303
288	NC_013130	AGA	2	6	26142	26147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055303
289	NC_013130	ATG	2	6	26291	26296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055303
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300	NC_013130	TAA	2	6	27308	27313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055304
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383	NC_013130	TTC	2	6	33880	33885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055315
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387	NC_013130	GTA	2	6	34258	34263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055315
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399	NC_013130	ACT	2	6	35300	35305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055317
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