MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp54

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013130	TA	3	6	181	186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013130	AC	3	6	710	715	50 %	0 %	0 %	50 %	256055274
3	NC_013130	TA	3	6	1957	1962	50 %	50 %	0 %	0 %	256055275
4	NC_013130	CT	4	8	2418	2425	0 %	50 %	0 %	50 %	256055276
5	NC_013130	TC	3	6	2813	2818	0 %	50 %	0 %	50 %	256055276
6	NC_013130	TA	3	6	3042	3047	50 %	50 %	0 %	0 %	256055277
7	NC_013130	CA	4	8	5143	5150	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013130	AT	3	6	5218	5223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013130	CA	3	6	6404	6409	50 %	0 %	0 %	50 %	256055280
10	NC_013130	AG	3	6	6602	6607	50 %	0 %	50 %	0 %	256055281
11	NC_013130	AT	3	6	7436	7441	50 %	50 %	0 %	0 %	256055282
12	NC_013130	CA	3	6	7560	7565	50 %	0 %	0 %	50 %	256055282
13	NC_013130	AC	3	6	7889	7894	50 %	0 %	0 %	50 %	256055282
14	NC_013130	AT	3	6	8541	8546	50 %	50 %	0 %	0 %	256055284
15	NC_013130	AG	3	6	8692	8697	50 %	0 %	50 %	0 %	256055284
16	NC_013130	AT	3	6	9444	9449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013130	TA	3	6	11173	11178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013130	TA	3	6	11244	11249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013130	AC	3	6	11912	11917	50 %	0 %	0 %	50 %	256055288
20	NC_013130	TA	4	8	12240	12247	50 %	50 %	0 %	0 %	256055288
21	NC_013130	AT	4	8	13788	13795	50 %	50 %	0 %	0 %	256055290
22	NC_013130	TA	3	6	13964	13969	50 %	50 %	0 %	0 %	256055290
23	NC_013130	TG	3	6	14017	14022	0 %	50 %	50 %	0 %	256055290
24	NC_013130	GA	4	8	14219	14226	50 %	0 %	50 %	0 %	256055290
25	NC_013130	AG	3	6	15677	15682	50 %	0 %	50 %	0 %	256055293
26	NC_013130	AT	3	6	18018	18023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013130	AT	3	6	18197	18202	50 %	50 %	0 %	0 %	256055296
28	NC_013130	AG	3	6	18630	18635	50 %	0 %	50 %	0 %	256055296
29	NC_013130	AG	3	6	18655	18660	50 %	0 %	50 %	0 %	256055296
30	NC_013130	GA	3	6	18695	18700	50 %	0 %	50 %	0 %	256055296
31	NC_013130	AT	3	6	19694	19699	50 %	50 %	0 %	0 %	256055297
32	NC_013130	AG	3	6	19795	19800	50 %	0 %	50 %	0 %	256055297
33	NC_013130	GC	3	6	19918	19923	0 %	0 %	50 %	50 %	256055297
34	NC_013130	AG	3	6	20592	20597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013130	AG	3	6	20855	20860	50 %	0 %	50 %	0 %	256055298
36	NC_013130	AG	3	6	20900	20905	50 %	0 %	50 %	0 %	256055298
37	NC_013130	AT	3	6	21115	21120	50 %	50 %	0 %	0 %	256055299
38	NC_013130	TA	3	6	21126	21131	50 %	50 %	0 %	0 %	256055299
39	NC_013130	AG	3	6	21616	21621	50 %	0 %	50 %	0 %	256055299
40	NC_013130	AT	3	6	21976	21981	50 %	50 %	0 %	0 %	256055300
41	NC_013130	GT	3	6	22760	22765	0 %	50 %	50 %	0 %	256055300
42	NC_013130	GA	4	8	22795	22802	50 %	0 %	50 %	0 %	256055300
43	NC_013130	AT	4	8	23568	23575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013130	CA	3	6	24857	24862	50 %	0 %	0 %	50 %	256055302
45	NC_013130	CT	3	6	25180	25185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013130	GA	3	6	25915	25920	50 %	0 %	50 %	0 %	256055303
47	NC_013130	AG	3	6	26257	26262	50 %	0 %	50 %	0 %	256055303
48	NC_013130	GA	3	6	28363	28368	50 %	0 %	50 %	0 %	256055306
49	NC_013130	GA	3	6	28607	28612	50 %	0 %	50 %	0 %	256055306
50	NC_013130	AT	3	6	28784	28789	50 %	50 %	0 %	0 %	256055306
51	NC_013130	CT	3	6	29383	29388	0 %	50 %	0 %	50 %	256055307
52	NC_013130	TA	3	6	29451	29456	50 %	50 %	0 %	0 %	256055308
53	NC_013130	AG	3	6	30644	30649	50 %	0 %	50 %	0 %	256055310
54	NC_013130	TC	3	6	31436	31441	0 %	50 %	0 %	50 %	256055311
55	NC_013130	GA	3	6	31792	31797	50 %	0 %	50 %	0 %	256055312
56	NC_013130	AG	3	6	32483	32488	50 %	0 %	50 %	0 %	256055313
57	NC_013130	GA	3	6	33849	33854	50 %	0 %	50 %	0 %	256055315
58	NC_013130	TC	3	6	34565	34570	0 %	50 %	0 %	50 %	256055316
59	NC_013130	AG	3	6	35393	35398	50 %	0 %	50 %	0 %	256055317
60	NC_013130	AG	3	6	35694	35699	50 %	0 %	50 %	0 %	256055317
61	NC_013130	AG	3	6	35745	35750	50 %	0 %	50 %	0 %	256055317
62	NC_013130	AG	4	8	36418	36425	50 %	0 %	50 %	0 %	256055319
63	NC_013130	GA	3	6	36956	36961	50 %	0 %	50 %	0 %	256055320
64	NC_013130	AG	3	6	37027	37032	50 %	0 %	50 %	0 %	256055320
65	NC_013130	AG	3	6	37147	37152	50 %	0 %	50 %	0 %	256055320
66	NC_013130	AG	3	6	37502	37507	50 %	0 %	50 %	0 %	256055320
67	NC_013130	GT	3	6	37606	37611	0 %	50 %	50 %	0 %	256055321
68	NC_013130	CT	3	6	38657	38662	0 %	50 %	0 %	50 %	256055322
69	NC_013130	AG	3	6	38712	38717	50 %	0 %	50 %	0 %	256055322
70	NC_013130	AT	3	6	39805	39810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013130	CT	3	6	39898	39903	0 %	50 %	0 %	50 %	256055323
72	NC_013130	TA	3	6	40159	40164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013130	TG	3	6	40714	40719	0 %	50 %	50 %	0 %	256055324
74	NC_013130	TA	3	6	41085	41090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013130	GT	3	6	41367	41372	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013130	TC	3	6	43077	43082	0 %	50 %	0 %	50 %	256055327
77	NC_013130	AG	3	6	43468	43473	50 %	0 %	50 %	0 %	256055327
78	NC_013130	CT	3	6	43668	43673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013130	GT	3	6	45197	45202	0 %	50 %	50 %	0 %	256055329
80	NC_013130	AT	3	6	46259	46264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013130	GC	3	6	46757	46762	0 %	0 %	50 %	50 %	256055330
82	NC_013130	AT	3	6	48530	48535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013130	TC	3	6	50611	50616	0 %	50 %	0 %	50 %	256055335
84	NC_013130	GT	3	6	50772	50777	0 %	50 %	50 %	0 %	256055335
85	NC_013130	AT	3	6	52611	52616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013130	AG	3	6	52937	52942	50 %	0 %	50 %	0 %	256055337
87	NC_013130	CA	3	6	52992	52997	50 %	0 %	0 %	50 %	256055337
88	NC_013130	AG	3	6	53118	53123	50 %	0 %	50 %	0 %	256055337
89	NC_013130	TA	3	6	53317	53322	50 %	50 %	0 %	0 %	256055337
90	NC_013130	GT	3	6	53637	53642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.