MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1_lp54

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013129	ATTAAT	2	12	654	665	50 %	50 %	0 %	0 %	256041952
2	NC_013129	TTAAAC	2	12	1625	1636	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256041953
3	NC_013129	CTGTAT	2	12	3697	3708	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	256041955
4	NC_013129	ACAATA	2	12	5572	5583	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	256041957
5	NC_013129	ATTGAG	2	12	6102	6113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041958
6	NC_013129	AAAAGT	2	12	10932	10943	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	256041965
7	NC_013129	GAAAAA	2	12	12056	12067	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256041966
8	NC_013129	AAAAAC	2	12	12539	12550	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	256041966
9	NC_013129	AAAGCA	2	12	13011	13022	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	256041967
10	NC_013129	GATAAA	2	12	14336	14347	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	256041969
11	NC_013129	TAAAGA	2	12	14486	14497	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	256041969
12	NC_013129	TTTTTA	2	12	17130	17141	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	256041973
13	NC_013129	TTCCAA	2	12	23137	23148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041978
14	NC_013129	ATCAAA	2	12	24642	24653	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	256041980
15	NC_013129	TTTTTA	2	12	25062	25073	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	256041980
16	NC_013129	TGAAGA	2	12	25717	25728	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	256041981
17	NC_013129	ATTATG	2	12	25908	25919	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256041981
18	NC_013129	GTTTTA	2	12	30536	30547	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	256041988
19	NC_013129	GCTTAA	2	12	31622	31633	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	256041989
20	NC_013129	AGGCAC	2	12	31787	31798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256041990
21	NC_013129	AAAAAG	2	12	33759	33770	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256041993
22	NC_013129	AAATTC	2	12	33861	33872	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256041993
23	NC_013129	TACAAA	2	12	34545	34556	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	256041994
24	NC_013129	AAATAT	2	12	35260	35271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041995
25	NC_013129	ACAAAA	2	12	35285	35296	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	256041995
26	NC_013129	TTTGGG	2	12	38320	38331	0 %	50 %	50 %	0 %	256042000
27	NC_013129	GTATTA	2	12	38515	38526	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256042000
28	NC_013129	CTTTGT	2	12	44406	44417	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	256042006
29	NC_013129	GGAATT	2	12	51493	51504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256042013

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.