MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1_lp54

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013129	CTTTT	2	10	9227	9236	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013129	ATTTT	2	10	9346	9355	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013129	TATAA	2	10	9388	9397	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013129	TACTT	2	10	11669	11678	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013129	TTTGA	2	10	15024	15033	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013129	ATAAA	3	15	17332	17346	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013129	TTTTA	2	10	17409	17418	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013129	ATTTT	2	10	17436	17445	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013129	AATTA	2	10	18072	18081	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013129	TAATT	2	10	20375	20384	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013129	TATTT	2	10	23341	23350	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013129	TTAAT	2	10	25161	25170	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013129	ATTTT	2	10	39418	39427	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013129	TATTT	2	10	40135	40144	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013129	TAATA	2	10	42182	42191	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013129	ATTAA	2	10	42491	42500	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013129	ATATA	2	10	51877	51886	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013129	TAAAT	2	10	52872	52881	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.