MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1_lp54

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013129	AC	3	6	701	706	50 %	0 %	0 %	50 %	256041952
2	NC_013129	AT	4	8	930	937	50 %	50 %	0 %	0 %	256041952
3	NC_013129	TA	3	6	1948	1953	50 %	50 %	0 %	0 %	256041953
4	NC_013129	CT	4	8	2409	2416	0 %	50 %	0 %	50 %	256041954
5	NC_013129	TC	3	6	2804	2809	0 %	50 %	0 %	50 %	256041954
6	NC_013129	TA	3	6	3033	3038	50 %	50 %	0 %	0 %	256041955
7	NC_013129	CA	3	6	6395	6400	50 %	0 %	0 %	50 %	256041958
8	NC_013129	AG	3	6	6593	6598	50 %	0 %	50 %	0 %	256041959
9	NC_013129	AT	3	6	7427	7432	50 %	50 %	0 %	0 %	256041960
10	NC_013129	CA	3	6	7551	7556	50 %	0 %	0 %	50 %	256041960
11	NC_013129	AC	3	6	7880	7885	50 %	0 %	0 %	50 %	256041960
12	NC_013129	AT	3	6	8532	8537	50 %	50 %	0 %	0 %	256041962
13	NC_013129	AG	3	6	8683	8688	50 %	0 %	50 %	0 %	256041962
14	NC_013129	AC	3	6	11871	11876	50 %	0 %	0 %	50 %	256041966
15	NC_013129	TA	4	8	12199	12206	50 %	50 %	0 %	0 %	256041966
16	NC_013129	AT	4	8	13747	13754	50 %	50 %	0 %	0 %	256041968
17	NC_013129	TA	3	6	13923	13928	50 %	50 %	0 %	0 %	256041968
18	NC_013129	TG	3	6	13976	13981	0 %	50 %	50 %	0 %	256041968
19	NC_013129	GA	4	8	14178	14185	50 %	0 %	50 %	0 %	256041968
20	NC_013129	AG	3	6	15636	15641	50 %	0 %	50 %	0 %	256041971
21	NC_013129	TC	3	6	16107	16112	0 %	50 %	0 %	50 %	256041972
22	NC_013129	AT	3	6	18169	18174	50 %	50 %	0 %	0 %	256041974
23	NC_013129	AG	3	6	18602	18607	50 %	0 %	50 %	0 %	256041974
24	NC_013129	AG	3	6	18627	18632	50 %	0 %	50 %	0 %	256041974
25	NC_013129	GA	3	6	18667	18672	50 %	0 %	50 %	0 %	256041974
26	NC_013129	AT	3	6	19666	19671	50 %	50 %	0 %	0 %	256041975
27	NC_013129	AG	3	6	19767	19772	50 %	0 %	50 %	0 %	256041975
28	NC_013129	GC	3	6	19890	19895	0 %	0 %	50 %	50 %	256041975
29	NC_013129	AG	3	6	20806	20811	50 %	0 %	50 %	0 %	256041976
30	NC_013129	AG	3	6	20851	20856	50 %	0 %	50 %	0 %	256041976
31	NC_013129	AT	3	6	21066	21071	50 %	50 %	0 %	0 %	256041977
32	NC_013129	TA	3	6	21077	21082	50 %	50 %	0 %	0 %	256041977
33	NC_013129	AG	3	6	21567	21572	50 %	0 %	50 %	0 %	256041977
34	NC_013129	AT	3	6	21928	21933	50 %	50 %	0 %	0 %	256041978
35	NC_013129	GT	3	6	22712	22717	0 %	50 %	50 %	0 %	256041978
36	NC_013129	GA	4	8	22747	22754	50 %	0 %	50 %	0 %	256041978
37	NC_013129	CA	3	6	24805	24810	50 %	0 %	0 %	50 %	256041980
38	NC_013129	GA	3	6	25856	25861	50 %	0 %	50 %	0 %	256041981
39	NC_013129	AG	3	6	26198	26203	50 %	0 %	50 %	0 %	256041981
40	NC_013129	GA	3	6	28304	28309	50 %	0 %	50 %	0 %	256041984
41	NC_013129	GA	3	6	28548	28553	50 %	0 %	50 %	0 %	256041984
42	NC_013129	AT	3	6	28725	28730	50 %	50 %	0 %	0 %	256041984
43	NC_013129	CT	3	6	29324	29329	0 %	50 %	0 %	50 %	256041985
44	NC_013129	TA	3	6	29392	29397	50 %	50 %	0 %	0 %	256041986
45	NC_013129	AG	3	6	30585	30590	50 %	0 %	50 %	0 %	256041988
46	NC_013129	TC	3	6	31377	31382	0 %	50 %	0 %	50 %	256041989
47	NC_013129	GA	3	6	31733	31738	50 %	0 %	50 %	0 %	256041990
48	NC_013129	AG	3	6	32424	32429	50 %	0 %	50 %	0 %	256041991
49	NC_013129	GA	3	6	33790	33795	50 %	0 %	50 %	0 %	256041993
50	NC_013129	TC	3	6	34506	34511	0 %	50 %	0 %	50 %	256041994
51	NC_013129	AG	3	6	35334	35339	50 %	0 %	50 %	0 %	256041995
52	NC_013129	AG	3	6	35635	35640	50 %	0 %	50 %	0 %	256041995
53	NC_013129	AG	3	6	35686	35691	50 %	0 %	50 %	0 %	256041995
54	NC_013129	AG	4	8	36359	36366	50 %	0 %	50 %	0 %	256041997
55	NC_013129	GA	3	6	36897	36902	50 %	0 %	50 %	0 %	256041998
56	NC_013129	AG	3	6	36968	36973	50 %	0 %	50 %	0 %	256041998
57	NC_013129	AG	3	6	37088	37093	50 %	0 %	50 %	0 %	256041998
58	NC_013129	AG	3	6	37443	37448	50 %	0 %	50 %	0 %	256041998
59	NC_013129	GT	3	6	37547	37552	0 %	50 %	50 %	0 %	256041999
60	NC_013129	CT	3	6	38598	38603	0 %	50 %	0 %	50 %	256042000
61	NC_013129	AG	3	6	38653	38658	50 %	0 %	50 %	0 %	256042000
62	NC_013129	CT	3	6	39840	39845	0 %	50 %	0 %	50 %	256042001
63	NC_013129	TG	3	6	40656	40661	0 %	50 %	50 %	0 %	256042002
64	NC_013129	TC	3	6	43019	43024	0 %	50 %	0 %	50 %	256042005
65	NC_013129	AG	3	6	43410	43415	50 %	0 %	50 %	0 %	256042005
66	NC_013129	GT	3	6	45139	45144	0 %	50 %	50 %	0 %	256042007
67	NC_013129	CT	3	6	48846	48851	0 %	50 %	0 %	50 %	256042010
68	NC_013129	TC	3	6	49756	49761	0 %	50 %	0 %	50 %	256042012
69	NC_013129	AG	3	6	52067	52072	50 %	0 %	50 %	0 %	256042014
70	NC_013129	CA	3	6	52122	52127	50 %	0 %	0 %	50 %	256042014
71	NC_013129	AG	3	6	52248	52253	50 %	0 %	50 %	0 %	256042014
72	NC_013129	TA	3	6	52447	52452	50 %	50 %	0 %	0 %	256042014

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.