MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013124	GCTCGC	2	12	34498	34509	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013124	GGCGAT	2	12	35793	35804	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013124	GCTCGG	2	12	75717	75728	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013124	CCTCCG	2	12	101859	101870	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_013124	GTCATC	2	12	128180	128191	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013124	GATCAA	2	12	128589	128600	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013124	TGAGGC	2	12	131565	131576	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013124	AGGTCG	2	12	131634	131645	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_013124	CCGTGG	2	12	141688	141699	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013124	AGGGCC	2	12	179815	179826	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013124	CGCTGT	2	12	187353	187364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013124	ACGTCG	2	12	199488	199499	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013124	CGAGGC	2	12	253496	253507	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013124	CGGCGC	2	12	291015	291026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013124	GTCGTG	2	12	315555	315566	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_013124	CCTCCG	2	12	355163	355174	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_013124	GGTCGA	2	12	364889	364900	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_013124	CCTGCG	2	12	364997	365008	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013124	GCCGGT	2	12	469634	469645	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013124	GCCCGG	2	12	489238	489249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013124	GCGATG	2	12	497107	497118	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013124	GAGCCA	2	12	497139	497150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013124	CCTCGG	2	12	518935	518946	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013124	CGTGCG	2	12	524457	524468	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013124	ATCTCG	2	12	554248	554259	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013124	TTCGAC	2	12	555045	555056	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013124	GAGCGC	2	12	558231	558242	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013124	CTGCCC	2	12	570491	570502	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_013124	GTCCGT	2	12	579236	579247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013124	GAGGTG	2	12	671697	671708	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013124	CGGCTG	2	12	682854	682865	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013124	CCCGGT	2	12	729675	729686	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013124	TCGACG	2	12	778560	778571	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013124	CTGCGG	2	12	791632	791643	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013124	GTGCGG	2	12	820916	820927	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013124	GCGCTG	2	12	874444	874455	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013124	GCGGGT	2	12	874528	874539	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013124	TGTCGA	2	12	945347	945358	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013124	CGGTGC	2	12	950125	950136	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013124	TGTCGA	2	12	952161	952172	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_013124	GGTCGC	2	12	953996	954007	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013124	GCTTCG	2	12	997444	997455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013124	CTTGGC	3	18	997978	997995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013124	CCGAGG	2	12	1013604	1013615	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013124	CCCCGG	2	12	1016476	1016487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_013124	GGTCGG	2	12	1061702	1061713	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_013124	CGTACG	2	12	1077349	1077360	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013124	CCCGGA	2	12	1114573	1114584	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013124	TCGCTT	2	12	1116174	1116185	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013124	CGGTTC	2	12	1128233	1128244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013124	TGTCGA	2	12	1128498	1128509	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_013124	TACCGT	2	12	1173127	1173138	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013124	ATACCT	2	12	1186182	1186193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013124	CGAGCC	2	12	1218597	1218608	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013124	CTCGAC	2	12	1237509	1237520	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013124	GCCGTC	2	12	1249415	1249426	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013124	CGATGC	2	12	1271062	1271073	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013124	CCGGCG	2	12	1284887	1284898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013124	GTCGGC	2	12	1325291	1325302	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013124	CACGAC	2	12	1329864	1329875	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013124	GGCACG	2	12	1336379	1336390	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013124	TGCGCC	2	12	1336894	1336905	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013124	CGGCGA	2	12	1354502	1354513	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013124	ACGTCG	2	12	1446602	1446613	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013124	TCGCCG	2	12	1448506	1448517	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013124	CCCTCG	2	12	1489771	1489782	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_013124	TCGGCG	2	12	1492762	1492773	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013124	CCTGGC	2	12	1533961	1533972	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013124	ACCGGG	2	12	1578722	1578733	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013124	CCCGGA	2	12	1614478	1614489	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013124	TCGCTT	2	12	1616079	1616090	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013124	AGCGGC	2	12	1708923	1708934	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013124	CTCGAC	2	12	1710717	1710728	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013124	AGCGCA	2	12	1711155	1711166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013124	GGTGAC	2	12	1759898	1759909	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_013124	TGCCCG	2	12	1841940	1841951	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013124	CACTCG	2	12	1862233	1862244	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013124	TCGGGA	2	12	1941056	1941067	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_013124	CAGCCG	2	12	1943774	1943785	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013124	GCTCGC	2	12	1953599	1953610	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_013124	TGGAGG	2	12	1955657	1955668	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013124	GGCGAC	2	12	1974710	1974721	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013124	GTGGCC	2	12	1982057	1982068	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013124	TCGGCA	2	12	1992306	1992317	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013124	ATGGGC	2	12	2004972	2004983	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_013124	GGACGC	2	12	2005160	2005171	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013124	CCACGC	2	12	2031135	2031146	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_013124	CGAGGC	2	12	2032637	2032648	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013124	CCCCAA	2	12	2060864	2060875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_013124	GCCCGA	2	12	2132308	2132319	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013124	CCAACG	2	12	2152148	2152159	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.