MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 1853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013124	GCGCC	2	10	552486	552495	0 %	0 %	40 %	60 %	256371356
502	NC_013124	CGAGG	2	10	554000	554009	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
503	NC_013124	CTCGT	2	10	557045	557054	0 %	40 %	20 %	40 %	256371358
504	NC_013124	CATCG	2	10	558570	558579	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
505	NC_013124	GACTG	2	10	558589	558598	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
506	NC_013124	CGGGG	2	10	558928	558937	0 %	0 %	80 %	20 %	256371359
507	NC_013124	CGAGG	2	10	560202	560211	20 %	0 %	60 %	20 %	256371360
508	NC_013124	CCGGA	2	10	560345	560354	20 %	0 %	40 %	40 %	256371360
509	NC_013124	GCCCA	2	10	560446	560455	20 %	0 %	20 %	60 %	256371360
510	NC_013124	CGAGC	2	10	561403	561412	20 %	0 %	40 %	40 %	256371361
511	NC_013124	TCGGC	2	10	562989	562998	0 %	20 %	40 %	40 %	256371362
512	NC_013124	GCGTC	2	10	563205	563214	0 %	20 %	40 %	40 %	256371362
513	NC_013124	GCGAC	2	10	565548	565557	20 %	0 %	40 %	40 %	256371365
514	NC_013124	ATCAC	2	10	567979	567988	40 %	20 %	0 %	40 %	256371369
515	NC_013124	CGCAG	2	10	569179	569188	20 %	0 %	40 %	40 %	256371370
516	NC_013124	GCGCG	2	10	570527	570536	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
517	NC_013124	GCGGG	2	10	570695	570704	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
518	NC_013124	GGGAG	2	10	571191	571200	20 %	0 %	80 %	0 %	256371372
519	NC_013124	TCGGC	2	10	571518	571527	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
520	NC_013124	GGTGT	2	10	572458	572467	0 %	40 %	60 %	0 %	256371373
521	NC_013124	TGCGC	2	10	573356	573365	0 %	20 %	40 %	40 %	256371373
522	NC_013124	TCGAC	2	10	574710	574719	20 %	20 %	20 %	40 %	256371374
523	NC_013124	CCGAG	2	10	575565	575574	20 %	0 %	40 %	40 %	256371374
524	NC_013124	GACGC	2	10	576544	576553	20 %	0 %	40 %	40 %	256371375
525	NC_013124	CGAGC	2	10	578744	578753	20 %	0 %	40 %	40 %	256371377
526	NC_013124	CCCGC	2	10	580886	580895	0 %	0 %	20 %	80 %	256371379
527	NC_013124	GCGGT	2	10	581535	581544	0 %	20 %	60 %	20 %	256371379
528	NC_013124	CGGAA	2	10	582057	582066	40 %	0 %	40 %	20 %	256371379
529	NC_013124	GAGGG	2	10	582458	582467	20 %	0 %	80 %	0 %	256371379
530	NC_013124	CCGCG	2	10	587237	587246	0 %	0 %	40 %	60 %	256371384
531	NC_013124	CGACG	2	10	591470	591479	20 %	0 %	40 %	40 %	256371387
532	NC_013124	GAAAC	2	10	592299	592308	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
533	NC_013124	TCGGT	2	10	592558	592567	0 %	40 %	40 %	20 %	256371389
534	NC_013124	TGCAC	2	10	593867	593876	20 %	20 %	20 %	40 %	256371389
535	NC_013124	TGGGT	2	10	594797	594806	0 %	40 %	60 %	0 %	256371390
536	NC_013124	GCGTC	2	10	595245	595254	0 %	20 %	40 %	40 %	256371390
537	NC_013124	GGCGA	2	10	601149	601158	20 %	0 %	60 %	20 %	256371397
538	NC_013124	CGGCG	2	10	602723	602732	0 %	0 %	60 %	40 %	256371400
539	NC_013124	CCTCA	2	10	603687	603696	20 %	20 %	0 %	60 %	256371401
540	NC_013124	CTCGT	2	10	604212	604221	0 %	40 %	20 %	40 %	256371401
541	NC_013124	CGAGG	2	10	607244	607253	20 %	0 %	60 %	20 %	256371404
542	NC_013124	GTCTC	2	10	608111	608120	0 %	40 %	20 %	40 %	256371405
543	NC_013124	AGGGC	2	10	608677	608686	20 %	0 %	60 %	20 %	256371406
544	NC_013124	CTCCG	2	10	611822	611831	0 %	20 %	20 %	60 %	256371408
545	NC_013124	CGAGC	2	10	615370	615379	20 %	0 %	40 %	40 %	256371412
546	NC_013124	TCGTC	2	10	615960	615969	0 %	40 %	20 %	40 %	256371413
547	NC_013124	AGGGG	2	10	616935	616944	20 %	0 %	80 %	0 %	256371414
548	NC_013124	GATGG	2	10	616983	616992	20 %	20 %	60 %	0 %	256371415
549	NC_013124	CGAGC	2	10	617486	617495	20 %	0 %	40 %	40 %	256371415
550	NC_013124	GCGAG	2	10	619647	619656	20 %	0 %	60 %	20 %	256371416
551	NC_013124	GCGGG	2	10	622578	622587	0 %	0 %	80 %	20 %	256371420
552	NC_013124	CGAGC	2	10	623185	623194	20 %	0 %	40 %	40 %	256371421
553	NC_013124	GTAGC	2	10	625078	625087	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
554	NC_013124	CGGTG	2	10	625200	625209	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
555	NC_013124	TCGTC	2	10	625990	625999	0 %	40 %	20 %	40 %	256371423
556	NC_013124	CGGCT	2	10	627330	627339	0 %	20 %	40 %	40 %	256371424
557	NC_013124	AAGGC	2	10	628455	628464	40 %	0 %	40 %	20 %	256371425
558	NC_013124	CGAGG	2	10	629682	629691	20 %	0 %	60 %	20 %	256371426
559	NC_013124	CGACC	2	10	630133	630142	20 %	0 %	20 %	60 %	256371427
560	NC_013124	GCCTC	2	10	632889	632898	0 %	20 %	20 %	60 %	256371430
561	NC_013124	GCTGC	2	10	636618	636627	0 %	20 %	40 %	40 %	256371434
562	NC_013124	GTCGC	2	10	636792	636801	0 %	20 %	40 %	40 %	256371434
563	NC_013124	CGTGA	2	10	636855	636864	20 %	20 %	40 %	20 %	256371434
564	NC_013124	TGCGC	2	10	637307	637316	0 %	20 %	40 %	40 %	256371434
565	NC_013124	ACCCT	2	10	638051	638060	20 %	20 %	0 %	60 %	256371435
566	NC_013124	GGCCG	2	10	639386	639395	0 %	0 %	60 %	40 %	256371436
567	NC_013124	GCAGC	2	10	640855	640864	20 %	0 %	40 %	40 %	256371437
568	NC_013124	GAGGG	2	10	641761	641770	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
569	NC_013124	CGTGC	2	10	642032	642041	0 %	20 %	40 %	40 %	256371438
570	NC_013124	CGGGG	2	10	643327	643336	0 %	0 %	80 %	20 %	256371440
571	NC_013124	TTCGG	2	10	651587	651596	0 %	40 %	40 %	20 %	256371447
572	NC_013124	AGACG	2	10	651742	651751	40 %	0 %	40 %	20 %	256371447
573	NC_013124	TGCGC	2	10	652826	652835	0 %	20 %	40 %	40 %	256371448
574	NC_013124	GGCGA	2	10	655964	655973	20 %	0 %	60 %	20 %	256371451
575	NC_013124	CGAGG	2	10	657784	657793	20 %	0 %	60 %	20 %	256371451
576	NC_013124	TCCTC	2	10	660200	660209	0 %	40 %	0 %	60 %	256371454
577	NC_013124	TGGCG	2	10	660628	660637	0 %	20 %	60 %	20 %	256371454
578	NC_013124	GCCGG	2	10	661828	661837	0 %	0 %	60 %	40 %	256371455
579	NC_013124	GCTAC	2	10	662066	662075	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
580	NC_013124	TCGGA	2	10	664088	664097	20 %	20 %	40 %	20 %	256371457
581	NC_013124	AGCCG	2	10	665109	665118	20 %	0 %	40 %	40 %	256371458
582	NC_013124	CGAGC	2	10	666738	666747	20 %	0 %	40 %	40 %	256371460
583	NC_013124	TCGCG	2	10	668014	668023	0 %	20 %	40 %	40 %	256371461
584	NC_013124	CGTTC	2	10	668233	668242	0 %	40 %	20 %	40 %	256371461
585	NC_013124	CGATG	2	10	668504	668513	20 %	20 %	40 %	20 %	256371461
586	NC_013124	CGGTG	2	10	669246	669255	0 %	20 %	60 %	20 %	256371462
587	NC_013124	GCGCG	2	10	669887	669896	0 %	0 %	60 %	40 %	256371463
588	NC_013124	TCGAG	2	10	670711	670720	20 %	20 %	40 %	20 %	256371464
589	NC_013124	CGACG	2	10	672646	672655	20 %	0 %	40 %	40 %	256371465
590	NC_013124	GGTCG	2	10	673163	673172	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
591	NC_013124	CGCGA	2	10	676269	676278	20 %	0 %	40 %	40 %	256371469
592	NC_013124	GCCAC	2	10	676757	676766	20 %	0 %	20 %	60 %	256371469
593	NC_013124	GCTCG	2	10	677320	677329	0 %	20 %	40 %	40 %	256371470
594	NC_013124	GACCG	2	10	677424	677433	20 %	0 %	40 %	40 %	256371470
595	NC_013124	CACTA	2	10	680144	680153	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
596	NC_013124	CGACG	2	10	681863	681872	20 %	0 %	40 %	40 %	256371476
597	NC_013124	CCACA	2	10	683474	683483	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
598	NC_013124	CCGAC	2	10	683531	683540	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
599	NC_013124	GTCGT	2	10	685424	685433	0 %	40 %	40 %	20 %	256371480
600	NC_013124	GCCGT	2	10	686077	686086	0 %	20 %	40 %	40 %	256371481
601	NC_013124	GAGGG	2	10	686155	686164	20 %	0 %	80 %	0 %	256371481
602	NC_013124	GTGCC	2	10	687642	687651	0 %	20 %	40 %	40 %	256371485
603	NC_013124	GCAGG	2	10	688199	688208	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
604	NC_013124	TAGGC	2	10	688411	688420	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
605	NC_013124	CGGCG	2	10	688695	688704	0 %	0 %	60 %	40 %	256371486
606	NC_013124	GTGCG	2	10	689346	689355	0 %	20 %	60 %	20 %	256371487
607	NC_013124	TTCGC	2	10	689607	689616	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
608	NC_013124	GGTGC	2	10	690956	690965	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
609	NC_013124	GACGC	2	10	691153	691162	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
610	NC_013124	GGTTC	2	10	691619	691628	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
611	NC_013124	GTCTC	2	10	691990	691999	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
612	NC_013124	GTGCG	2	10	692133	692142	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
613	NC_013124	CGTCG	2	10	692843	692852	0 %	20 %	40 %	40 %	256371490
614	NC_013124	GCCGT	2	10	693720	693729	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
615	NC_013124	GGCGT	2	10	693770	693779	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
616	NC_013124	GGCGA	2	10	695933	695942	20 %	0 %	60 %	20 %	256371492
617	NC_013124	CGAGG	2	10	696108	696117	20 %	0 %	60 %	20 %	256371492
618	NC_013124	GGGCC	2	10	696408	696417	0 %	0 %	60 %	40 %	256371492
619	NC_013124	GATCA	2	10	696660	696669	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
620	NC_013124	GCCGC	2	10	697492	697501	0 %	0 %	40 %	60 %	256371493
621	NC_013124	CTCCC	2	10	697925	697934	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
622	NC_013124	GCGCG	2	10	698708	698717	0 %	0 %	60 %	40 %	256371495
623	NC_013124	CTCGG	2	10	698793	698802	0 %	20 %	40 %	40 %	256371495
624	NC_013124	CCGAC	2	10	699526	699535	20 %	0 %	20 %	60 %	256371495
625	NC_013124	GTCGA	2	10	700332	700341	20 %	20 %	40 %	20 %	256371495
626	NC_013124	ACGCG	2	10	700871	700880	20 %	0 %	40 %	40 %	256371495
627	NC_013124	GCGAG	2	10	703282	703291	20 %	0 %	60 %	20 %	256371496
628	NC_013124	GAGCA	2	10	703629	703638	40 %	0 %	40 %	20 %	256371497
629	NC_013124	CGAGC	2	10	703697	703706	20 %	0 %	40 %	40 %	256371497
630	NC_013124	TCGTG	2	10	704135	704144	0 %	40 %	40 %	20 %	256371497
631	NC_013124	CTCGC	2	10	709612	709621	0 %	20 %	20 %	60 %	256371501
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633	NC_013124	CGATG	2	10	711970	711979	20 %	20 %	40 %	20 %	256371504
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