Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome
Total Repeats: 6030
S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Length | Start | End | A% | T% | G% | C% | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
6001 | NC_013124 | TCGG | 2 | 8 | 2144274 | 2144281 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 256372777 |
6002 | NC_013124 | CGGC | 2 | 8 | 2146256 | 2146263 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 256372779 |
6003 | NC_013124 | CACC | 2 | 8 | 2146713 | 2146720 | 25 % | 0 % | 0 % | 75 % | 256372779 |
6004 | NC_013124 | CGAG | 2 | 8 | 2146749 | 2146756 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 256372779 |
6005 | NC_013124 | GGGT | 2 | 8 | 2146833 | 2146840 | 0 % | 25 % | 75 % | 0 % | 256372779 |
6006 | NC_013124 | CTCG | 2 | 8 | 2146913 | 2146920 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 256372779 |
6007 | NC_013124 | CCCA | 2 | 8 | 2147039 | 2147046 | 25 % | 0 % | 0 % | 75 % | 256372779 |
6008 | NC_013124 | GATC | 2 | 8 | 2147604 | 2147611 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 256372779 |
6009 | NC_013124 | GCCC | 2 | 8 | 2148373 | 2148380 | 0 % | 0 % | 25 % | 75 % | 256372779 |
6010 | NC_013124 | AACG | 2 | 8 | 2148429 | 2148436 | 50 % | 0 % | 25 % | 25 % | 256372779 |
6011 | NC_013124 | GCGA | 2 | 8 | 2148506 | 2148513 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 256372779 |
6012 | NC_013124 | TCGA | 2 | 8 | 2148773 | 2148780 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 256372779 |
6013 | NC_013124 | TGCC | 2 | 8 | 2148951 | 2148958 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 256372779 |
6014 | NC_013124 | GTGG | 2 | 8 | 2149396 | 2149403 | 0 % | 25 % | 75 % | 0 % | 256372779 |
6015 | NC_013124 | CGAG | 2 | 8 | 2149410 | 2149417 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 256372779 |
6016 | NC_013124 | CGGA | 2 | 8 | 2150373 | 2150380 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 256372780 |
6017 | NC_013124 | CGAT | 2 | 8 | 2150827 | 2150834 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 256372780 |
6018 | NC_013124 | CAAT | 2 | 8 | 2151376 | 2151383 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 256372781 |
6019 | NC_013124 | TCGG | 2 | 8 | 2152631 | 2152638 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 256372782 |
6020 | NC_013124 | GCTG | 2 | 8 | 2152685 | 2152692 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 256372782 |
6021 | NC_013124 | CTCG | 2 | 8 | 2152959 | 2152966 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 256372782 |
6022 | NC_013124 | CGTG | 2 | 8 | 2152992 | 2152999 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 256372782 |
6023 | NC_013124 | CGAA | 2 | 8 | 2155052 | 2155059 | 50 % | 0 % | 25 % | 25 % | 256372783 |
6024 | NC_013124 | CTGC | 2 | 8 | 2155639 | 2155646 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 256372784 |
6025 | NC_013124 | TCGC | 2 | 8 | 2155679 | 2155686 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 256372784 |
6026 | NC_013124 | TGCT | 2 | 8 | 2156222 | 2156229 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 256372784 |
6027 | NC_013124 | ACCG | 2 | 8 | 2156754 | 2156761 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 256372785 |
6028 | NC_013124 | GTGC | 2 | 8 | 2156789 | 2156796 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 256372785 |
6029 | NC_013124 | GCAA | 2 | 8 | 2157011 | 2157018 | 50 % | 0 % | 25 % | 25 % | 256372785 |
6030 | NC_013124 | TGCG | 2 | 8 | 2157317 | 2157324 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 256372785 |