MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 3739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013124	CGC	2	6	2053287	2053292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_013124	CCG	2	6	2053314	2053319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3503	NC_013124	GAC	2	6	2053342	2053347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_013124	GTC	2	6	2053348	2053353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_013124	CCT	2	6	2055879	2055884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3506	NC_013124	CAC	2	6	2056578	2056583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3507	NC_013124	GCG	2	6	2056641	2056646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_013124	CAG	2	6	2056734	2056739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_013124	AGG	2	6	2056785	2056790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_013124	AGC	2	6	2056791	2056796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_013124	CGA	2	6	2059264	2059269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_013124	GAG	2	6	2060418	2060423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_013124	CTC	2	6	2060858	2060863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3514	NC_013124	CCT	2	6	2066840	2066845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3515	NC_013124	AAC	2	6	2066912	2066917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_013124	ACC	2	6	2068477	2068482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_013124	CCA	2	6	2068540	2068545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3518	NC_013124	GAG	2	6	2071116	2071121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_013124	GCT	2	6	2071159	2071164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_013124	GCA	2	6	2071242	2071247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_013124	GCT	2	6	2071322	2071327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_013124	TTG	2	6	2074610	2074615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_013124	GCT	2	6	2074693	2074698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_013124	ACC	2	6	2074981	2074986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3525	NC_013124	GCC	2	6	2075125	2075130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3526	NC_013124	TCC	2	6	2075131	2075136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_013124	CGG	2	6	2075163	2075168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_013124	TCG	2	6	2075242	2075247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_013124	CCA	2	6	2075270	2075275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3530	NC_013124	GAA	2	6	2075296	2075301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_013124	ACC	2	6	2075477	2075482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_013124	TCG	2	6	2075570	2075575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_013124	TCT	2	6	2075662	2075667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_013124	TCG	2	6	2075675	2075680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_013124	CGT	2	6	2075767	2075772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_013124	CGT	2	6	2075811	2075816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_013124	GTA	2	6	2075898	2075903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_013124	GCT	2	6	2075923	2075928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_013124	CCT	2	6	2075960	2075965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3540	NC_013124	TCC	2	6	2076328	2076333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3541	NC_013124	GCC	2	6	2076446	2076451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_013124	GAG	2	6	2079151	2079156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_013124	CTC	2	6	2079175	2079180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3544	NC_013124	GGC	2	6	2079189	2079194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_013124	CGC	2	6	2079200	2079205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_013124	CGC	2	6	2079210	2079215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3547	NC_013124	CGA	2	6	2079221	2079226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_013124	GAG	2	6	2079338	2079343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_013124	AGC	2	6	2083495	2083500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_013124	CGA	2	6	2083537	2083542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_013124	CGA	2	6	2083550	2083555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_013124	CGA	3	9	2083557	2083565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_013124	CCA	2	6	2083614	2083619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3554	NC_013124	CCT	2	6	2085674	2085679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_013124	CAC	2	6	2085683	2085688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3556	NC_013124	GCC	2	6	2085698	2085703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3557	NC_013124	AGC	2	6	2085704	2085709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_013124	GAG	2	6	2085763	2085768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_013124	TCA	2	6	2085816	2085821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_013124	TCG	2	6	2085864	2085869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_013124	TCG	2	6	2087596	2087601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_013124	CCA	2	6	2088755	2088760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3563	NC_013124	CCT	2	6	2093594	2093599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3564	NC_013124	CGC	2	6	2093805	2093810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3565	NC_013124	TCA	2	6	2096038	2096043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_013124	CCT	2	6	2097586	2097591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3567	NC_013124	TCG	2	6	2097607	2097612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_013124	GTG	2	6	2097617	2097622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_013124	CTC	2	6	2102146	2102151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_013124	GAC	2	6	2102177	2102182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_013124	ACG	2	6	2104019	2104024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_013124	GTG	2	6	2104041	2104046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_013124	CGA	3	9	2104049	2104057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_013124	TCG	2	6	2104069	2104074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_013124	CTC	2	6	2108541	2108546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3576	NC_013124	GAC	2	6	2108717	2108722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_013124	ATC	2	6	2108773	2108778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_013124	CGG	2	6	2110370	2110375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_013124	CCT	2	6	2110386	2110391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3580	NC_013124	TCG	2	6	2110434	2110439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_013124	CGG	2	6	2111194	2111199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_013124	GAG	2	6	2111263	2111268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_013124	CCA	2	6	2111330	2111335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3584	NC_013124	CGC	2	6	2111351	2111356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3585	NC_013124	GAC	2	6	2111439	2111444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_013124	GTC	2	6	2111455	2111460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_013124	ACG	2	6	2111539	2111544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_013124	CGA	2	6	2111554	2111559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_013124	GGC	2	6	2111585	2111590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_013124	TGA	2	6	2111640	2111645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_013124	TCG	2	6	2111673	2111678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_013124	CCA	2	6	2112842	2112847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3593	NC_013124	CGG	2	6	2112944	2112949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_013124	CGA	2	6	2112992	2112997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_013124	TCG	2	6	2113005	2113010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_013124	CTC	2	6	2113054	2113059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3597	NC_013124	CAC	2	6	2113114	2113119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3598	NC_013124	TCC	2	6	2113134	2113139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3599	NC_013124	CTG	2	6	2113324	2113329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_013124	CGC	2	6	2113362	2113367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_013124	ATC	2	6	2113393	2113398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_013124	ACG	3	9	2113412	2113420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_013124	CAG	2	6	2113421	2113426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_013124	CCA	2	6	2113439	2113444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3605	NC_013124	TCG	3	9	2113529	2113537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_013124	CCA	2	6	2113583	2113588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3607	NC_013124	CGT	2	6	2113754	2113759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_013124	AGA	2	6	2113793	2113798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_013124	TCG	2	6	2113861	2113866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_013124	CCG	2	6	2113975	2113980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3611	NC_013124	TCG	2	6	2113990	2113995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_013124	CGT	2	6	2114012	2114017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_013124	TCA	2	6	2114047	2114052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_013124	CGA	2	6	2114093	2114098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_013124	CTG	2	6	2114182	2114187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_013124	GGC	2	6	2114250	2114255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_013124	CGA	2	6	2114339	2114344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_013124	GGT	2	6	2114357	2114362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_013124	GGT	2	6	2114405	2114410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_013124	CGA	3	9	2114429	2114437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_013124	CGA	2	6	2114444	2114449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_013124	CGT	2	6	2114450	2114455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_013124	CGG	2	6	2114473	2114478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_013124	GGT	2	6	2114498	2114503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_013124	CGA	2	6	2114705	2114710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_013124	GCG	2	6	2115812	2115817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.