MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 40170

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_013124	GAT	2	6	2149111	2149116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372779
40002	NC_013124	CAC	2	6	2149126	2149131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372779
40003	NC_013124	GCT	2	6	2149152	2149157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372779
40004	NC_013124	AGC	2	6	2149238	2149243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372779
40005	NC_013124	ATG	2	6	2149268	2149273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372779
40006	NC_013124	TTG	2	6	2149333	2149338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256372779
40007	NC_013124	CGT	2	6	2149354	2149359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372779
40008	NC_013124	AGC	2	6	2149370	2149375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372779
40009	NC_013124	CGT	2	6	2149458	2149463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372779
40010	NC_013124	GGC	2	6	2149555	2149560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372779
40011	NC_013124	CAC	2	6	2149597	2149602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372779
40012	NC_013124	CGC	2	6	2149780	2149785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40013	NC_013124	CAC	2	6	2149823	2149828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40014	NC_013124	AGC	2	6	2149840	2149845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40015	NC_013124	CGC	2	6	2149910	2149915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40016	NC_013124	CTC	2	6	2149920	2149925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40017	NC_013124	ACC	2	6	2149953	2149958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40018	NC_013124	GGC	2	6	2149990	2149995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40019	NC_013124	CGA	2	6	2150104	2150109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372780
40020	NC_013124	CGA	2	6	2150143	2150148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372780
40021	NC_013124	CGA	3	9	2150236	2150244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372780
40022	NC_013124	CCT	2	6	2150275	2150280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372780
40023	NC_013124	TCG	2	6	2150320	2150325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372780
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40031	NC_013124	TCG	2	6	2150592	2150597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372780
40032	NC_013124	ACG	2	6	2150642	2150647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372780
40033	NC_013124	GTC	2	6	2150687	2150692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372780
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40042	NC_013124	CTG	2	6	2151243	2151248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372781
40043	NC_013124	GTA	2	6	2151294	2151299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372781
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40049	NC_013124	CCG	3	9	2151972	2151980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40050	NC_013124	ACC	2	6	2152098	2152103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40051	NC_013124	CGA	2	6	2152165	2152170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40052	NC_013124	CTC	2	6	2152393	2152398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40053	NC_013124	CTC	2	6	2152404	2152409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40054	NC_013124	CTC	2	6	2152418	2152423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40055	NC_013124	GGA	2	6	2152432	2152437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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40085	NC_013124	CGC	2	6	2154280	2154285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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40087	NC_013124	ACC	2	6	2154408	2154413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40088	NC_013124	ACG	2	6	2154450	2154455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40089	NC_013124	CAG	2	6	2154520	2154525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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40112	NC_013124	GCG	2	6	2155587	2155592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372784
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40117	NC_013124	TGT	2	6	2155983	2155988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256372784
40118	NC_013124	TCG	2	6	2155989	2155994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372784
40119	NC_013124	TCG	2	6	2156063	2156068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372784
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40121	NC_013124	TCG	2	6	2156169	2156174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372784
40122	NC_013124	GTC	2	6	2156256	2156261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372784
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40156	NC_013124	CGA	2	6	2157308	2157313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372785
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40166	NC_013124	CGG	2	6	2157905	2157910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372787
40167	NC_013124	TCG	2	6	2157993	2157998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372788
40168	NC_013124	ACG	2	6	2158030	2158035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372788
40169	NC_013124	TTG	2	6	2158040	2158045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256372788
40170	NC_013124	GAG	2	6	2158109	2158114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.