MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Sulcia muelleri SMDSEM

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013123	ATTTTA	2	12	17802	17813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013123	CAGTTT	12	72	17854	17925	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013123	TGAAAA	3	18	19252	19269	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013123	AACACA	2	12	48905	48916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013123	GAATAT	2	12	48927	48938	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013123	TTTTGT	2	12	48969	48980	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013123	ATTTTT	2	12	62711	62722	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013123	TTTCAC	2	12	74137	74148	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013123	AATTTT	3	18	74345	74362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013123	CATTTT	4	24	74363	74386	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_013123	AATTAT	4	24	76794	76817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013123	GGCGTA	4	24	76855	76878	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013123	CATCGG	5	30	76950	76979	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013123	TATTAA	2	12	78739	78750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013123	AAATTT	2	12	88868	88879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013123	AGGTCC	2	12	89860	89871	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013123	TCAATT	2	12	90628	90639	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_013123	TTGATT	2	12	90994	91005	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013123	GGTGTT	2	12	91814	91825	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013123	ATTAGA	34	204	94586	94789	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013123	TGGATA	9	54	94826	94879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013123	TGGATA	3	18	94886	94903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013123	ATTAAA	2	12	95049	95060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013123	GTTGGA	14	84	95389	95472	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013123	ATATTT	2	12	95522	95533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013123	ATTTCT	2	12	95545	95556	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013123	ATTAGA	2	12	95695	95706	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013123	ATTAGA	2	12	95725	95736	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013123	ATTAGA	2	12	95755	95766	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013123	ATTAGA	2	12	95815	95826	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013123	ATTAGA	2	12	95845	95856	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013123	ATTAGA	2	12	95875	95886	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013123	ATTAGA	2	12	95905	95916	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013123	GATTAT	2	12	96188	96199	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013123	AGGTTT	2	12	96241	96252	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013123	TAGATT	2	12	96297	96308	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013123	CTTTTT	2	12	176480	176491	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013123	ATTTAT	2	12	177859	177870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013123	TGGAGT	2	12	178360	178371	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013123	AAATTT	2	12	178426	178437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013123	TAAAAA	2	12	178540	178551	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013123	CTTTAG	2	12	179212	179223	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_013123	AATTAT	4	24	180683	180706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013123	AATTAA	2	12	224919	224930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013123	TTAATA	2	12	230015	230026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013123	TAATAT	2	12	234449	234460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013123	GGAAAT	2	12	250395	250406	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013123	AAAATT	2	12	251150	251161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.