MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Sulcia muelleri SMDSEM

Total Repeats: 271

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013123	TTTAGA	2	12	330	341	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256370582
2	NC_013123	TCTCCA	2	12	983	994	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	256370583
3	NC_013123	ATTTTA	2	12	1317	1328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256370583
4	NC_013123	AAAGAA	2	12	2145	2156	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256370584
5	NC_013123	GAAAAA	2	12	2559	2570	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256370584
6	NC_013123	TAAATT	2	12	3337	3348	50 %	50 %	0 %	0 %	256370584
7	NC_013123	ATCTAA	2	12	5593	5604	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256370585
8	NC_013123	TCATTT	2	12	5960	5971	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	256370585
9	NC_013123	AAAAGA	2	12	6019	6030	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256370585
10	NC_013123	AAAGAA	2	12	6484	6495	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256370586
11	NC_013123	ATATTA	2	12	7297	7308	50 %	50 %	0 %	0 %	256370586
12	NC_013123	TCTTGT	2	12	8466	8477	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	256370587
13	NC_013123	AATAAA	2	12	8712	8723	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	256370587
14	NC_013123	TAAAAA	2	12	10001	10012	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	256370588
15	NC_013123	AAAATG	2	12	10183	10194	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	256370588
16	NC_013123	TTTAAA	2	12	11684	11695	50 %	50 %	0 %	0 %	256370589
17	NC_013123	TTTATA	2	12	12898	12909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256370590
18	NC_013123	TTGAGG	2	12	14425	14436	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	256370590
19	NC_013123	TTGAGG	2	12	14446	14457	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	256370590
20	NC_013123	TCTCGA	2	12	16632	16643	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	256370593
21	NC_013123	ATTTGG	2	12	19643	19654	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	256370595
22	NC_013123	ATTTTG	2	12	19846	19857	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	256370596
23	NC_013123	ATCTTC	2	12	20127	20138	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	256370597
24	NC_013123	ATCTTC	2	12	20175	20186	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	256370597
25	NC_013123	GGAATG	2	12	21895	21906	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	256370598
26	NC_013123	TAAAAA	2	12	22194	22205	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	256370598
27	NC_013123	TAGAAA	2	12	22739	22750	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	256370599
28	NC_013123	TAAAGA	2	12	23697	23708	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	256370599
29	NC_013123	ATAAAA	2	12	23846	23857	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	256370599
30	NC_013123	AAATTT	2	12	25266	25277	50 %	50 %	0 %	0 %	256370599
31	NC_013123	TAAAAT	2	12	26064	26075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256370599
32	NC_013123	TGGATA	2	12	26226	26237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256370599
33	NC_013123	AAAAAT	2	12	26549	26560	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	256370600
34	NC_013123	TATTCC	2	12	28094	28105	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	256370601
35	NC_013123	CTCTTT	2	12	28447	28458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256370601
36	NC_013123	ATTTTC	2	12	29176	29187	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	256370602
37	NC_013123	TAAAAA	2	12	29873	29884	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	256370603
38	NC_013123	TTGAAA	2	12	31261	31272	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	256370605
39	NC_013123	AATTTA	2	12	32022	32033	50 %	50 %	0 %	0 %	256370605
40	NC_013123	TTCAAA	2	12	32119	32130	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256370605
41	NC_013123	AATTAA	2	12	32960	32971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256370606
42	NC_013123	ATTCTC	2	12	33979	33990	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	256370606
43	NC_013123	TAAATT	2	12	34332	34343	50 %	50 %	0 %	0 %	256370606
44	NC_013123	TTAATT	2	12	34971	34982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256370607
45	NC_013123	GAAAGA	2	12	37427	37438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256370610
46	NC_013123	TTATTT	2	12	37588	37599	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	256370611
47	NC_013123	AAAAAT	2	12	38295	38306	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	256370611
48	NC_013123	GAATAT	2	12	40179	40190	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	256370613
49	NC_013123	AAAAGA	2	12	40485	40496	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256370613
50	NC_013123	TTTTAA	2	12	41714	41725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256370614
51	NC_013123	ATTTAA	2	12	42254	42265	50 %	50 %	0 %	0 %	256370614
52	NC_013123	ATTTAA	2	12	45228	45239	50 %	50 %	0 %	0 %	256370618
53	NC_013123	TATAAA	2	12	45908	45919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256370619
54	NC_013123	TAAAAA	2	12	46319	46330	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	256370619
55	NC_013123	TAAATT	2	12	51541	51552	50 %	50 %	0 %	0 %	256370624
56	NC_013123	AAAATA	2	12	53439	53450	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	256370626
57	NC_013123	ACATTT	2	12	55064	55075	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	256370627
58	NC_013123	GAAATA	2	12	55630	55641	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	256370628
59	NC_013123	TTAATG	2	12	55642	55653	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256370628
60	NC_013123	GAAAAA	2	12	55713	55724	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256370628
61	NC_013123	AAAAGA	2	12	56183	56194	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256370628
62	NC_013123	TAAAAA	2	12	56801	56812	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	256370628
63	NC_013123	TCTAAA	2	12	57222	57233	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256370628
64	NC_013123	TCTTTT	2	12	57492	57503	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	256370628
65	NC_013123	AATTAA	2	12	60126	60137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256370631
66	NC_013123	ATTAAA	2	12	60844	60855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256370631
67	NC_013123	TAAACT	2	12	61861	61872	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256370634
68	NC_013123	AATTTA	2	12	61905	61916	50 %	50 %	0 %	0 %	256370634
69	NC_013123	ATTGCC	2	12	62525	62536	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	256370634
70	NC_013123	AATTAA	2	12	63642	63653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256370635
71	NC_013123	AATTAA	2	12	63674	63685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256370635
72	NC_013123	CTCACT	2	12	65664	65675	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	256370636
73	NC_013123	CTCACC	4	24	65676	65699	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	256370636
74	NC_013123	AAATTA	2	12	68873	68884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256370637
75	NC_013123	CTTGTT	2	12	72224	72235	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	256370638
76	NC_013123	TTCATA	4	24	72385	72408	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	256370638
77	NC_013123	ACATTA	2	12	72680	72691	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256370639
78	NC_013123	ATTTTA	2	12	72789	72800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256370639
79	NC_013123	TAATCA	2	12	72936	72947	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256370639
80	NC_013123	TTCTAC	2	12	74595	74606	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	256370642
81	NC_013123	AATTTC	2	12	75222	75233	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	256370642
82	NC_013123	ATTAAT	2	12	77408	77419	50 %	50 %	0 %	0 %	256370643
83	NC_013123	TCAATT	2	12	77421	77432	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	256370643
84	NC_013123	ATCAAA	2	12	79181	79192	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	256370644
85	NC_013123	GAAAAA	2	12	79453	79464	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256370644
86	NC_013123	TAAAAA	2	12	80150	80161	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	256370644
87	NC_013123	TAAAAA	2	12	81062	81073	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	256370644
88	NC_013123	TTCCTA	2	12	82156	82167	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	256370645
89	NC_013123	TAAAAT	2	12	83071	83082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256370645
90	NC_013123	AAAATT	2	12	83160	83171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256370646
91	NC_013123	ATTAAT	2	12	84226	84237	50 %	50 %	0 %	0 %	256370648
92	NC_013123	GTTTAA	2	12	84318	84329	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256370648
93	NC_013123	ATTTTT	2	12	85135	85146	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	256370648
94	NC_013123	TTTATT	2	12	85312	85323	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	256370648
95	NC_013123	CTGCTA	2	12	98627	98638	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	256370654
96	NC_013123	TATAGA	2	12	98769	98780	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	256370654
97	NC_013123	TTAAAA	2	12	104071	104082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256370661
98	NC_013123	GTTGGA	2	12	105027	105038	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	256370663
99	NC_013123	TTTCAA	2	12	105044	105055	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	256370663
100	NC_013123	GAAAAA	2	12	106384	106395	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256370665
101	NC_013123	TAAAAG	2	12	107269	107280	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	256370666
102	NC_013123	TGAATT	3	18	108605	108622	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256370667
103	NC_013123	AGAATT	7	42	108623	108664	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	256370667
104	NC_013123	AATTTT	2	12	109510	109521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256370668
105	NC_013123	TTTGAT	2	12	109664	109675	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	256370668
106	NC_013123	AAATTT	2	12	110177	110188	50 %	50 %	0 %	0 %	256370669
107	NC_013123	TTTCCT	2	12	110520	110531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256370669
108	NC_013123	TCCAAA	2	12	110891	110902	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	256370669
109	NC_013123	GATTTT	2	12	111106	111117	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	256370669
110	NC_013123	TCGATT	2	12	117825	117836	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	256370675
111	NC_013123	ATATCT	2	12	118862	118873	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	256370676
112	NC_013123	AGATTT	2	12	118954	118965	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256370676
113	NC_013123	ATTAAA	2	12	119317	119328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256370677
114	NC_013123	AAGATA	2	12	120212	120223	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	256370677
115	NC_013123	ATATGG	2	12	120243	120254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256370677
116	NC_013123	AGGAAA	2	12	121066	121077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256370678
117	NC_013123	ATTTTA	2	12	121278	121289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256370678
118	NC_013123	AGGAAA	2	12	122044	122055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256370678
119	NC_013123	TGATAT	2	12	122581	122592	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256370678
120	NC_013123	ATAAAT	2	12	124799	124810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256370678
121	NC_013123	TAGAAT	2	12	126223	126234	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	256370679
122	NC_013123	TGAGAA	2	12	127028	127039	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	256370680
123	NC_013123	TTTTAT	2	12	127535	127546	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	256370680
124	NC_013123	ATTCTA	2	12	128115	128126	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	256370681
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.