MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Sulcia muelleri SMDSEM

Total Repeats: 445

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013123	AAATC	2	10	1160	1169	60 %	20 %	0 %	20 %	256370583
2	NC_013123	TAAAT	2	10	1881	1890	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013123	TAATT	2	10	2093	2102	40 %	60 %	0 %	0 %	256370584
4	NC_013123	TATTC	2	10	3559	3568	20 %	60 %	0 %	20 %	256370584
5	NC_013123	AGAAA	2	10	3646	3655	80 %	0 %	20 %	0 %	256370585
6	NC_013123	TACAA	2	10	3781	3790	60 %	20 %	0 %	20 %	256370585
7	NC_013123	GAAAA	2	10	4024	4033	80 %	0 %	20 %	0 %	256370585
8	NC_013123	ATTAT	2	10	4198	4207	40 %	60 %	0 %	0 %	256370585
9	NC_013123	ATTTT	2	10	4713	4722	20 %	80 %	0 %	0 %	256370585
10	NC_013123	TTGAT	2	10	5247	5256	20 %	60 %	20 %	0 %	256370585
11	NC_013123	AAAAC	2	10	5422	5431	80 %	0 %	0 %	20 %	256370585
12	NC_013123	TTTTA	2	10	5530	5539	20 %	80 %	0 %	0 %	256370585
13	NC_013123	TAAAT	2	10	6201	6210	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013123	TAAAA	2	10	6318	6327	80 %	20 %	0 %	0 %	256370586
15	NC_013123	ATTTT	2	10	7786	7795	20 %	80 %	0 %	0 %	256370587
16	NC_013123	TATAA	2	10	8064	8073	60 %	40 %	0 %	0 %	256370587
17	NC_013123	TAAAA	2	10	8288	8297	80 %	20 %	0 %	0 %	256370587
18	NC_013123	AAAAT	2	10	9160	9169	80 %	20 %	0 %	0 %	256370587
19	NC_013123	TAATT	2	10	9981	9990	40 %	60 %	0 %	0 %	256370588
20	NC_013123	TTATT	2	10	10098	10107	20 %	80 %	0 %	0 %	256370588
21	NC_013123	AAATT	2	10	10325	10334	60 %	40 %	0 %	0 %	256370588
22	NC_013123	TTAAT	3	15	10424	10438	40 %	60 %	0 %	0 %	256370588
23	NC_013123	ATTTA	2	10	11651	11660	40 %	60 %	0 %	0 %	256370589
24	NC_013123	ATTTA	2	10	12197	12206	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013123	TATTT	2	10	12643	12652	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013123	GAAAA	2	10	13362	13371	80 %	0 %	20 %	0 %	256370590
27	NC_013123	TGGCA	2	10	15153	15162	20 %	20 %	40 %	20 %	256370591
28	NC_013123	TAGAA	3	15	15305	15319	60 %	20 %	20 %	0 %	256370591
29	NC_013123	TAAAT	2	10	15452	15461	60 %	40 %	0 %	0 %	256370592
30	NC_013123	TTTGG	2	10	15540	15549	0 %	60 %	40 %	0 %	256370592
31	NC_013123	ATTAT	2	10	15665	15674	40 %	60 %	0 %	0 %	256370592
32	NC_013123	CTTTT	2	10	17461	17470	0 %	80 %	0 %	20 %	256370593
33	NC_013123	AAATG	2	10	19036	19045	60 %	20 %	20 %	0 %	256370594
34	NC_013123	TTAGG	10	50	19697	19746	20 %	40 %	40 %	0 %	256370595
35	NC_013123	TTAAA	2	10	20291	20300	60 %	40 %	0 %	0 %	256370597
36	NC_013123	ATTAA	2	10	20338	20347	60 %	40 %	0 %	0 %	256370597
37	NC_013123	GTACA	2	10	21572	21581	40 %	20 %	20 %	20 %	256370597
38	NC_013123	ATAAA	2	10	21733	21742	80 %	20 %	0 %	0 %	256370597
39	NC_013123	ATTAT	5	25	21755	21779	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013123	TAAAA	2	10	22347	22356	80 %	20 %	0 %	0 %	256370598
41	NC_013123	ATTTT	2	10	22502	22511	20 %	80 %	0 %	0 %	256370598
42	NC_013123	AATTG	3	15	22664	22678	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013123	AAAAG	2	10	22939	22948	80 %	0 %	20 %	0 %	256370599
44	NC_013123	ATATT	2	10	24076	24085	40 %	60 %	0 %	0 %	256370599
45	NC_013123	GTTTG	2	10	24505	24514	0 %	60 %	40 %	0 %	256370599
46	NC_013123	AATAT	2	10	25328	25337	60 %	40 %	0 %	0 %	256370599
47	NC_013123	TAACT	2	10	25653	25662	40 %	40 %	0 %	20 %	256370599
48	NC_013123	TTTAT	2	10	26399	26408	20 %	80 %	0 %	0 %	256370600
49	NC_013123	GTTGT	2	10	26515	26524	0 %	60 %	40 %	0 %	256370600
50	NC_013123	TATAT	2	10	27518	27527	40 %	60 %	0 %	0 %	256370601
51	NC_013123	TATTT	2	10	28202	28211	20 %	80 %	0 %	0 %	256370601
52	NC_013123	ATTTA	2	10	30758	30767	40 %	60 %	0 %	0 %	256370603
53	NC_013123	TTAAT	2	10	31163	31172	40 %	60 %	0 %	0 %	256370604
54	NC_013123	AATGT	2	10	31446	31455	40 %	40 %	20 %	0 %	256370605
55	NC_013123	TAAAT	2	10	33433	33442	60 %	40 %	0 %	0 %	256370606
56	NC_013123	TAAAT	2	10	33906	33915	60 %	40 %	0 %	0 %	256370606
57	NC_013123	TATAT	2	10	34566	34575	40 %	60 %	0 %	0 %	256370606
58	NC_013123	TCATA	2	10	35124	35133	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_013123	ATTTT	2	10	35228	35237	20 %	80 %	0 %	0 %	256370608
60	NC_013123	ATAAA	2	10	35279	35288	80 %	20 %	0 %	0 %	256370608
61	NC_013123	ATCAT	2	10	35301	35310	40 %	40 %	0 %	20 %	256370608
62	NC_013123	AGAAA	3	15	36231	36245	80 %	0 %	20 %	0 %	256370609
63	NC_013123	CAAAT	2	10	36328	36337	60 %	20 %	0 %	20 %	256370609
64	NC_013123	AATTA	2	10	36752	36761	60 %	40 %	0 %	0 %	256370609
65	NC_013123	TAAAT	2	10	39976	39985	60 %	40 %	0 %	0 %	256370612
66	NC_013123	AAATT	2	10	40554	40563	60 %	40 %	0 %	0 %	256370613
67	NC_013123	AAATT	2	10	40603	40612	60 %	40 %	0 %	0 %	256370613
68	NC_013123	TTTCT	2	10	41166	41175	0 %	80 %	0 %	20 %	256370613
69	NC_013123	TTATT	2	10	41590	41599	20 %	80 %	0 %	0 %	256370614
70	NC_013123	AGTAT	2	10	42156	42165	40 %	40 %	20 %	0 %	256370614
71	NC_013123	TTTTA	2	10	43969	43978	20 %	80 %	0 %	0 %	256370616
72	NC_013123	AATAA	3	15	45291	45305	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013123	TAAAA	2	10	46223	46232	80 %	20 %	0 %	0 %	256370619
74	NC_013123	AAAAT	2	10	46537	46546	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013123	TAACA	2	10	46646	46655	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_013123	TAAAT	2	10	46686	46695	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013123	AAAAT	2	10	47671	47680	80 %	20 %	0 %	0 %	256370620
78	NC_013123	AAATT	2	10	48103	48112	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013123	GAAAT	2	10	48473	48482	60 %	20 %	20 %	0 %	256370621
80	NC_013123	ATTTT	2	10	48948	48957	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013123	TTATA	2	10	48959	48968	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013123	TTAAT	2	10	51006	51015	40 %	60 %	0 %	0 %	256370624
83	NC_013123	ATTTT	2	10	51114	51123	20 %	80 %	0 %	0 %	256370624
84	NC_013123	TATAA	2	10	51333	51342	60 %	40 %	0 %	0 %	256370624
85	NC_013123	ATATA	2	10	51504	51513	60 %	40 %	0 %	0 %	256370624
86	NC_013123	TAAAT	2	10	52158	52167	60 %	40 %	0 %	0 %	256370625
87	NC_013123	TTCTG	2	10	52784	52793	0 %	60 %	20 %	20 %	256370625
88	NC_013123	AATTT	2	10	55615	55624	40 %	60 %	0 %	0 %	256370628
89	NC_013123	TTAAA	2	10	56509	56518	60 %	40 %	0 %	0 %	256370628
90	NC_013123	AAAAG	2	10	56826	56835	80 %	0 %	20 %	0 %	256370628
91	NC_013123	ATTTA	2	10	56893	56902	40 %	60 %	0 %	0 %	256370628
92	NC_013123	TATTT	2	10	57590	57599	20 %	80 %	0 %	0 %	256370628
93	NC_013123	AATAA	2	10	57870	57879	80 %	20 %	0 %	0 %	256370628
94	NC_013123	TATAT	2	10	57947	57956	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013123	GAAAA	2	10	58911	58920	80 %	0 %	20 %	0 %	256370630
96	NC_013123	ATTAA	2	10	60206	60215	60 %	40 %	0 %	0 %	256370631
97	NC_013123	TATAA	2	10	60563	60572	60 %	40 %	0 %	0 %	256370631
98	NC_013123	AAAAT	2	10	60630	60639	80 %	20 %	0 %	0 %	256370631
99	NC_013123	GAAAA	2	10	61153	61162	80 %	0 %	20 %	0 %	256370631
100	NC_013123	AAATA	2	10	61549	61558	80 %	20 %	0 %	0 %	256370633
101	NC_013123	TTTTA	2	10	62345	62354	20 %	80 %	0 %	0 %	256370634
102	NC_013123	TCTAT	2	10	62433	62442	20 %	60 %	0 %	20 %	256370634
103	NC_013123	TAAAA	2	10	62485	62494	80 %	20 %	0 %	0 %	256370634
104	NC_013123	AAATT	2	10	63163	63172	60 %	40 %	0 %	0 %	256370635
105	NC_013123	ATTTT	2	10	63982	63991	20 %	80 %	0 %	0 %	256370636
106	NC_013123	AAAAT	2	10	64415	64424	80 %	20 %	0 %	0 %	256370636
107	NC_013123	ATTTG	2	10	64702	64711	20 %	60 %	20 %	0 %	256370636
108	NC_013123	TTTCA	2	10	64956	64965	20 %	60 %	0 %	20 %	256370636
109	NC_013123	ATTTT	2	10	68847	68856	20 %	80 %	0 %	0 %	256370637
110	NC_013123	AATTT	2	10	69120	69129	40 %	60 %	0 %	0 %	256370637
111	NC_013123	TTTAT	2	10	69149	69158	20 %	80 %	0 %	0 %	256370637
112	NC_013123	ATTTT	2	10	69789	69798	20 %	80 %	0 %	0 %	256370637
113	NC_013123	ATTTA	2	10	70783	70792	40 %	60 %	0 %	0 %	256370637
114	NC_013123	CAATC	2	10	71115	71124	40 %	20 %	0 %	40 %	256370637
115	NC_013123	AAGTA	2	10	71263	71272	60 %	20 %	20 %	0 %	256370637
116	NC_013123	AATTC	3	15	72006	72020	40 %	40 %	0 %	20 %	256370638
117	NC_013123	AGTTT	2	10	72250	72259	20 %	60 %	20 %	0 %	256370638
118	NC_013123	TCAAA	2	10	72825	72834	60 %	20 %	0 %	20 %	256370639
119	NC_013123	TTTAA	2	10	72948	72957	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013123	GTTAA	2	10	73646	73655	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013123	ATTTT	2	10	73749	73758	20 %	80 %	0 %	0 %	256370641
122	NC_013123	ATTTT	2	10	74056	74065	20 %	80 %	0 %	0 %	256370641
123	NC_013123	GATAT	2	10	74795	74804	40 %	40 %	20 %	0 %	256370642
124	NC_013123	CTTTT	2	10	75694	75703	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_013123	TATTT	7	35	75711	75745	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013123	AATTT	6	30	75746	75775	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013123	AAAAT	2	10	76070	76079	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013123	AAAAT	2	10	76126	76135	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013123	AAAAT	2	10	76182	76191	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013123	AAAAT	2	10	76238	76247	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013123	AAAAT	2	10	76294	76303	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013123	AATAT	3	15	76337	76351	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013123	ATATA	76	380	76354	76733	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013123	TAAAT	2	10	76739	76748	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013123	TAGAT	4	20	77041	77060	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013123	TAGAT	2	10	77073	77082	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013123	TAGAT	2	10	77095	77104	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013123	TAGAT	2	10	77117	77126	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013123	TAGAT	2	10	77139	77148	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013123	TAGAT	2	10	77161	77170	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013123	TAGAT	2	10	77183	77192	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013123	TAGAT	2	10	77205	77214	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013123	TAGAT	2	10	77227	77236	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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412	NC_013123	ATTTT	2	10	256618	256627	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
413	NC_013123	ATTTT	2	10	256632	256641	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
414	NC_013123	ATTTT	2	10	256646	256655	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
415	NC_013123	ATTTT	2	10	256660	256669	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
416	NC_013123	ATTTT	2	10	256674	256683	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
417	NC_013123	ATTTT	2	10	256688	256697	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
418	NC_013123	ATTTT	2	10	256702	256711	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
419	NC_013123	AAATT	2	10	257583	257592	60 %	40 %	0 %	0 %	256370806
420	NC_013123	TAATT	2	10	258386	258395	40 %	60 %	0 %	0 %	256370807
421	NC_013123	ATTTG	2	10	259664	259673	20 %	60 %	20 %	0 %	256370807
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439	NC_013123	AATTA	2	10	272212	272221	60 %	40 %	0 %	0 %	256370820
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444	NC_013123	TAATT	2	10	276760	276769	40 %	60 %	0 %	0 %	256370823
445	NC_013123	TTAAT	2	10	276918	276927	40 %	60 %	0 %	0 %	256370823

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.