MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella microti CCM 4915 chromosome 1

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013119	ACGGTT	2	12	35686	35697	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013119	CCTGGC	2	12	82919	82930	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013119	TTTTGC	2	12	96088	96099	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013119	GCTTTT	2	12	104866	104877	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_013119	AAGGGC	2	12	126262	126273	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_013119	GGGGAA	2	12	171359	171370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013119	TCTGGC	2	12	187849	187860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013119	CCAGTG	2	12	210748	210759	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013119	CTGATG	2	12	277086	277097	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013119	GGCACA	2	12	287533	287544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013119	ATGCCG	2	12	329455	329466	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013119	GACCGT	2	12	330666	330677	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013119	CGAAGA	2	12	331838	331849	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013119	CTGAAA	2	12	333271	333282	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_013119	CTGTCT	2	12	344045	344056	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013119	TTGCCT	2	12	344350	344361	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013119	TTTAAC	2	12	435057	435068	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_013119	ATAAAA	2	12	456814	456825	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013119	CGTTTT	2	12	508853	508864	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013119	ATGACC	2	12	517784	517795	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013119	ACGGTC	2	12	528951	528962	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013119	CGATGG	2	12	553538	553549	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013119	GCTTTG	2	12	554271	554282	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_013119	TTACGT	2	12	559239	559250	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_013119	TGCCGC	2	12	564115	564126	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013119	ATTTGT	2	12	664064	664075	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013119	GGCAAA	2	12	665846	665857	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_013119	GGCAAA	2	12	665980	665991	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_013119	GGCAAA	2	12	666114	666125	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_013119	CATCGT	2	12	689489	689500	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013119	CGGGAT	2	12	733186	733197	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_013119	ATTGAA	2	12	755520	755531	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013119	CTTTTC	2	12	771506	771517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013119	TCGCGC	2	12	812185	812196	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013119	GAAATT	2	12	904268	904279	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013119	AGACGC	2	12	938681	938692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013119	GCTGAT	2	12	1002619	1002630	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013119	TATTTT	2	12	1021971	1021982	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013119	CAGCGC	2	12	1110247	1110258	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013119	TTTTCC	2	12	1147858	1147869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013119	CAAAAA	2	12	1186342	1186353	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_013119	TGAATT	2	12	1241890	1241901	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013119	CGTTTC	2	12	1299724	1299735	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013119	CACCGC	2	12	1300777	1300788	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_013119	AAAACA	2	12	1300966	1300977	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_013119	TGGAAC	2	12	1321629	1321640	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_013119	CTTCGC	2	12	1334617	1334628	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013119	AAGAAA	2	12	1342782	1342793	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013119	CCGCGC	2	12	1391837	1391848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_013119	GTAAAA	2	12	1410094	1410105	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013119	GCATTT	2	12	1416071	1416082	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_013119	CATCGG	2	12	1442568	1442579	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013119	ATGCCA	2	12	1444983	1444994	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013119	AAGGAA	2	12	1477251	1477262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013119	GCTCTG	2	12	1479332	1479343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013119	AAAAGC	2	12	1551826	1551837	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_013119	CTGCCG	2	12	1598968	1598979	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013119	AATGCC	2	12	1657816	1657827	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013119	CAAATG	2	12	1795066	1795077	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_013119	CTGCCG	2	12	1803660	1803671	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013119	AGAAAC	2	12	1850943	1850954	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013119	AACTCA	2	12	1867076	1867087	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013119	GAAACG	2	12	1910680	1910691	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_013119	CGTGGC	2	12	1972299	1972310	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013119	TTCTTT	2	12	2071392	2071403	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013119	ATCTGC	2	12	2083908	2083919	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013119	TCTTTG	2	12	2109148	2109159	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.