MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Actinosynnema mirum DSM 43827 chromosome

Total Repeats: 7773

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013093	GACCGG	2	12	4784799	4784810	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256378116
4502	NC_013093	GAGCGG	2	12	4784833	4784844	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	256378116
4503	NC_013093	CCAGCG	2	12	4785403	4785414	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256378117
4504	NC_013093	CGTGCT	2	12	4785604	4785615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256378117
4505	NC_013093	GTCGAG	2	12	4786085	4786096	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	256378117
4506	NC_013093	GGCCGA	2	12	4789525	4789536	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256378120
4507	NC_013093	GCTCCC	2	12	4789921	4789932	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	256378120
4508	NC_013093	CACCGA	2	12	4790787	4790798	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	256378122
4509	NC_013093	TCGCCC	2	12	4791778	4791789	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	256378123
4510	NC_013093	TCGACG	2	12	4792990	4793001	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256378125
4511	NC_013093	GACCGG	2	12	4793700	4793711	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256378125
4512	NC_013093	CGGTGG	3	18	4793759	4793776	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	256378125
4513	NC_013093	TCCAGC	2	12	4794184	4794195	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	256378125
4514	NC_013093	GCCCGC	2	12	4794351	4794362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256378125
4515	NC_013093	GGTCGG	2	12	4794704	4794715	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	256378125
4516	NC_013093	CAGGGC	2	12	4795215	4795226	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256378125
4517	NC_013093	CGGTGC	2	12	4797437	4797448	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256378125
4518	NC_013093	GTAGGC	2	12	4804004	4804015	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	256378130
4519	NC_013093	GGTCAG	2	12	4804370	4804381	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	256378130
4520	NC_013093	CTTGTG	2	12	4804409	4804420	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	256378130
4521	NC_013093	GAGCGC	2	12	4804692	4804703	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256378131
4522	NC_013093	GCATCG	2	12	4805753	4805764	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256378131
4523	NC_013093	GCACCA	2	12	4808127	4808138	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	256378133
4524	NC_013093	ACGCCG	2	12	4808261	4808272	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256378133
4525	NC_013093	GAAGCC	2	12	4809595	4809606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256378134
4526	NC_013093	GCTCGG	2	12	4811266	4811277	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256378136
4527	NC_013093	ACGTCG	2	12	4811970	4811981	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256378136
4528	NC_013093	CACCCG	2	12	4812691	4812702	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	256378137
4529	NC_013093	ACCGGG	2	12	4815139	4815150	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256378139
4530	NC_013093	CGGTCC	2	12	4816060	4816071	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256378139
4531	NC_013093	CTGGGC	2	12	4816663	4816674	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256378140
4532	NC_013093	CGGGCG	2	12	4817453	4817464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256378141
4533	NC_013093	GGCCGA	2	12	4818257	4818268	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256378142
4534	NC_013093	GGATCG	2	12	4818857	4818868	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	256378142
4535	NC_013093	CGCGGG	2	12	4820165	4820176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256378143
4536	NC_013093	TGCGGC	2	12	4820622	4820633	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256378144
4537	NC_013093	GCTGCC	2	12	4821073	4821084	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256378144
4538	NC_013093	CCGCGC	2	12	4822292	4822303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256378145
4539	NC_013093	TGCCGC	2	12	4822394	4822405	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256378145
4540	NC_013093	GACAGC	2	12	4823415	4823426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256378146
4541	NC_013093	GCCGGG	2	12	4824737	4824748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256378147
4542	NC_013093	GGGACG	2	12	4824822	4824833	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	256378147
4543	NC_013093	CGATGC	2	12	4826226	4826237	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256378148
4544	NC_013093	ACCGCG	2	12	4826817	4826828	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256378149
4545	NC_013093	CCTGCG	2	12	4827656	4827667	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256378150
4546	NC_013093	CCCCCG	2	12	4827916	4827927	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	256378151
4547	NC_013093	CCCGCG	2	12	4828379	4828390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256378151
4548	NC_013093	GGCGGT	2	12	4830226	4830237	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	256378152
4549	NC_013093	CCCAGC	2	12	4830944	4830955	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	256378153
4550	NC_013093	GGGTGC	2	12	4831205	4831216	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	256378153
4551	NC_013093	TCCTGC	2	12	4832979	4832990	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	256378154
4552	NC_013093	GCGACC	2	12	4833153	4833164	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256378154
4553	NC_013093	TCGTAG	2	12	4833648	4833659	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	256378155
4554	NC_013093	CCCCCG	2	12	4837232	4837243	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	256378158
4555	NC_013093	GAACTC	2	12	4837503	4837514	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	256378158
4556	NC_013093	CGACGG	2	12	4837533	4837544	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256378158
4557	NC_013093	ACGGCG	2	12	4837979	4837990	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256378158
4558	NC_013093	GGACGG	2	12	4838463	4838474	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	256378158
4559	NC_013093	CAGGTC	2	12	4840234	4840245	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256378160
4560	NC_013093	CGGTGA	2	12	4840707	4840718	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	256378160
4561	NC_013093	GGCCGA	2	12	4843790	4843801	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256378162
4562	NC_013093	GACGGC	2	12	4844604	4844615	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256378163
4563	NC_013093	GATCGG	2	12	4850171	4850182	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	256378167
4564	NC_013093	TGCGCT	2	12	4850452	4850463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256378168
4565	NC_013093	CGTCGG	2	12	4852546	4852557	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256378168
4566	NC_013093	CGAGCA	2	12	4854200	4854211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256378169
4567	NC_013093	GGCGCG	2	12	4855325	4855336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256378169
4568	NC_013093	GCCGTC	2	12	4856805	4856816	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256378170
4569	NC_013093	CGGTCG	2	12	4857038	4857049	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256378170
4570	NC_013093	CGCGGG	2	12	4857291	4857302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256378170
4571	NC_013093	GCCCGA	2	12	4857748	4857759	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256378171
4572	NC_013093	GCCCCA	2	12	4858105	4858116	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	256378171
4573	NC_013093	ACCTGG	2	12	4861680	4861691	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256378173
4574	NC_013093	CGCGCT	2	12	4862726	4862737	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256378175
4575	NC_013093	CACGGT	2	12	4864055	4864066	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256378175
4576	NC_013093	GGTCGG	2	12	4865066	4865077	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	256378176
4577	NC_013093	AGGCCG	2	12	4866894	4866905	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256378178
4578	NC_013093	GCCAGC	2	12	4867254	4867265	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256378178
4579	NC_013093	CCAGGC	2	12	4867363	4867374	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256378178
4580	NC_013093	CGAGCA	2	12	4868397	4868408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256378179
4581	NC_013093	CGAACC	2	12	4868721	4868732	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	256378179
4582	NC_013093	TGGTCG	2	12	4869245	4869256	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	256378180
4583	NC_013093	GGCCCT	2	12	4869723	4869734	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256378180
4584	NC_013093	GGCGCG	2	12	4869869	4869880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256378180
4585	NC_013093	CTGCGG	2	12	4870279	4870290	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256378180
4586	NC_013093	GAACCG	2	12	4870847	4870858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256378180
4587	NC_013093	CGCTCG	2	12	4872516	4872527	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256378182
4588	NC_013093	TGGCCT	2	12	4872628	4872639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256378182
4589	NC_013093	CGCGGT	2	12	4873045	4873056	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256378182
4590	NC_013093	CGGCCT	2	12	4873057	4873068	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256378182
4591	NC_013093	GCCCGC	2	12	4873755	4873766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256378182
4592	NC_013093	CGGCGA	2	12	4875260	4875271	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256378183
4593	NC_013093	GGCGCT	2	12	4882597	4882608	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256378191
4594	NC_013093	GGTCTC	2	12	4882870	4882881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256378191
4595	NC_013093	ACCTGG	2	12	4884459	4884470	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256378192
4596	NC_013093	TGCCGC	2	12	4884682	4884693	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256378192
4597	NC_013093	CGTGGT	2	12	4885312	4885323	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	256378193
4598	NC_013093	CGCTCC	2	12	4886575	4886586	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	256378194
4599	NC_013093	ACCCGA	2	12	4887065	4887076	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	256378194
4600	NC_013093	CAGCGC	2	12	4887300	4887311	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256378194
4601	NC_013093	CGCCCG	2	12	4888097	4888108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256378194
4602	NC_013093	GCGAGC	2	12	4888552	4888563	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256378195
4603	NC_013093	GTGGGC	3	18	4889289	4889306	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	256378195
4604	NC_013093	ACGCGG	2	12	4889600	4889611	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256378195
4605	NC_013093	CGGTGG	2	12	4892866	4892877	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	256378198
4606	NC_013093	CTGGTG	2	12	4892916	4892927	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	256378198
4607	NC_013093	CTCGCG	2	12	4894764	4894775	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256378200
4608	NC_013093	AGCCGA	2	12	4895889	4895900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256378201
4609	NC_013093	TTCAGG	2	12	4895990	4896001	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	256378201
4610	NC_013093	CGAGCA	2	12	4896299	4896310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256378202
4611	NC_013093	ACCAGG	2	12	4896490	4896501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256378202
4612	NC_013093	GGCCGA	2	12	4899057	4899068	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256378204
4613	NC_013093	TGGGGT	2	12	4901087	4901098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256378207
4614	NC_013093	GGTGGG	3	18	4901241	4901258	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	256378207
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4721	NC_013093	GCGCTG	2	12	5011933	5011944	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256378294
4722	NC_013093	CGGTGG	2	12	5012366	5012377	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	256378294
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4826	NC_013093	GGCGAG	2	12	5112867	5112878	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	256378382
4827	NC_013093	GACGGC	2	12	5113637	5113648	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256378382
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4829	NC_013093	GGCATC	2	12	5118444	5118455	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256378386
4830	NC_013093	TCCTGC	2	12	5120606	5120617	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	256378387
4831	NC_013093	CGCCTC	2	12	5121277	5121288	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	256378387
4832	NC_013093	CCGGTT	2	12	5121877	5121888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256378388
4833	NC_013093	TGCGGT	2	12	5122071	5122082	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	256378388
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4835	NC_013093	ATCGCG	2	12	5124386	5124397	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256378390
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