MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Actinosynnema mirum DSM 43827 chromosome

Total Repeats: 9164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013093	GAGGG	2	10	78	87	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013093	GACGG	2	10	236	245	20 %	0 %	60 %	20 %	256374161
3	NC_013093	ACCAC	2	10	1686	1695	40 %	0 %	0 %	60 %	256374161
4	NC_013093	GACCT	2	10	1825	1834	20 %	20 %	20 %	40 %	256374161
5	NC_013093	TGTGG	2	10	2113	2122	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013093	GAAGA	2	10	2378	2387	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013093	TCGCG	2	10	4599	4608	0 %	20 %	40 %	40 %	256374163
8	NC_013093	CGCGC	2	10	5986	5995	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_013093	GGTCC	2	10	6086	6095	0 %	20 %	40 %	40 %	256374165
10	NC_013093	CCGAC	2	10	7218	7227	20 %	0 %	20 %	60 %	256374166
11	NC_013093	CCGCG	2	10	7606	7615	0 %	0 %	40 %	60 %	256374166
12	NC_013093	CCCGC	2	10	8675	8684	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
13	NC_013093	GTCCA	2	10	10011	10020	20 %	20 %	20 %	40 %	256374167
14	NC_013093	GGGGC	2	10	10952	10961	0 %	0 %	80 %	20 %	256374167
15	NC_013093	CGGGC	2	10	11568	11577	0 %	0 %	60 %	40 %	256374168
16	NC_013093	CGGGT	2	10	11999	12008	0 %	20 %	60 %	20 %	256374168
17	NC_013093	TCGGG	2	10	12711	12720	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013093	CTGCC	2	10	14623	14632	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_013093	CGGCG	2	10	16075	16084	0 %	0 %	60 %	40 %	256374174
20	NC_013093	CGCGC	2	10	16105	16114	0 %	0 %	40 %	60 %	256374174
21	NC_013093	GCGGA	2	10	16352	16361	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013093	CTGGA	2	10	17490	17499	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_013093	CGTGC	2	10	21679	21688	0 %	20 %	40 %	40 %	256374181
24	NC_013093	GGCAC	2	10	21963	21972	20 %	0 %	40 %	40 %	256374181
25	NC_013093	TGCCG	2	10	22842	22851	0 %	20 %	40 %	40 %	256374181
26	NC_013093	TGGGC	2	10	23972	23981	0 %	20 %	60 %	20 %	256374182
27	NC_013093	TCGTC	2	10	25354	25363	0 %	40 %	20 %	40 %	256374183
28	NC_013093	CCGGT	2	10	26025	26034	0 %	20 %	40 %	40 %	256374183
29	NC_013093	GGGGA	2	10	28000	28009	20 %	0 %	80 %	0 %	256374185
30	NC_013093	GCGCC	2	10	28383	28392	0 %	0 %	40 %	60 %	256374185
31	NC_013093	GAGCA	2	10	28820	28829	40 %	0 %	40 %	20 %	256374185
32	NC_013093	GGCCT	2	10	28844	28853	0 %	20 %	40 %	40 %	256374185
33	NC_013093	CGCCC	2	10	29670	29679	0 %	0 %	20 %	80 %	256374186
34	NC_013093	CGTCA	2	10	29869	29878	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_013093	CCGGG	2	10	31194	31203	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_013093	CTGGA	2	10	32897	32906	20 %	20 %	40 %	20 %	256374189
37	NC_013093	CCGGC	2	10	32914	32923	0 %	0 %	40 %	60 %	256374189
38	NC_013093	GCGCC	2	10	33294	33303	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
39	NC_013093	TCCGG	2	10	33354	33363	0 %	20 %	40 %	40 %	256374190
40	NC_013093	CGCAG	2	10	34074	34083	20 %	0 %	40 %	40 %	256374190
41	NC_013093	GCGCC	2	10	34230	34239	0 %	0 %	40 %	60 %	256374190
42	NC_013093	TCGAC	2	10	35023	35032	20 %	20 %	20 %	40 %	256374191
43	NC_013093	AGGCC	2	10	35968	35977	20 %	0 %	40 %	40 %	256374192
44	NC_013093	GCGCT	2	10	36444	36453	0 %	20 %	40 %	40 %	256374192
45	NC_013093	ACCCG	2	10	37460	37469	20 %	0 %	20 %	60 %	256374193
46	NC_013093	CGGCG	2	10	38765	38774	0 %	0 %	60 %	40 %	256374194
47	NC_013093	GCGGT	2	10	39704	39713	0 %	20 %	60 %	20 %	256374195
48	NC_013093	TCGAC	2	10	43296	43305	20 %	20 %	20 %	40 %	256374198
49	NC_013093	CGACC	2	10	43966	43975	20 %	0 %	20 %	60 %	256374199
50	NC_013093	ACCGA	2	10	44073	44082	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_013093	CGGCC	2	10	44145	44154	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_013093	CGGCG	2	10	44406	44415	0 %	0 %	60 %	40 %	256374200
53	NC_013093	GCGCC	2	10	44567	44576	0 %	0 %	40 %	60 %	256374200
54	NC_013093	TCGGC	2	10	45490	45499	0 %	20 %	40 %	40 %	256374201
55	NC_013093	GCCAC	2	10	47061	47070	20 %	0 %	20 %	60 %	256374203
56	NC_013093	TCGGC	2	10	47811	47820	0 %	20 %	40 %	40 %	256374204
57	NC_013093	GTCCG	2	10	48845	48854	0 %	20 %	40 %	40 %	256374204
58	NC_013093	GCGCC	2	10	49232	49241	0 %	0 %	40 %	60 %	256374205
59	NC_013093	TCGGC	2	10	49767	49776	0 %	20 %	40 %	40 %	256374206
60	NC_013093	GCCGG	2	10	50421	50430	0 %	0 %	60 %	40 %	256374206
61	NC_013093	GGGCT	2	10	50795	50804	0 %	20 %	60 %	20 %	256374206
62	NC_013093	CCCGG	2	10	54610	54619	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
63	NC_013093	CCGGG	2	10	54879	54888	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
64	NC_013093	CGCCC	2	10	56347	56356	0 %	0 %	20 %	80 %	256374212
65	NC_013093	CGGCA	2	10	59699	59708	20 %	0 %	40 %	40 %	256374214
66	NC_013093	CCTCG	2	10	60154	60163	0 %	20 %	20 %	60 %	256374214
67	NC_013093	CGGTG	2	10	63557	63566	0 %	20 %	60 %	20 %	256374215
68	NC_013093	CGGGC	2	10	64448	64457	0 %	0 %	60 %	40 %	256374216
69	NC_013093	GCGGG	2	10	64900	64909	0 %	0 %	80 %	20 %	256374216
70	NC_013093	GCCGG	2	10	65261	65270	0 %	0 %	60 %	40 %	256374216
71	NC_013093	CGCGG	2	10	66540	66549	0 %	0 %	60 %	40 %	256374217
72	NC_013093	GGCGC	2	10	67158	67167	0 %	0 %	60 %	40 %	256374217
73	NC_013093	AAACC	2	10	69591	69600	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_013093	GTCGC	2	10	69900	69909	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_013093	GCCCG	2	10	69935	69944	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
76	NC_013093	CACCC	2	10	70221	70230	20 %	0 %	0 %	80 %	256374219
77	NC_013093	CGGGC	2	10	71916	71925	0 %	0 %	60 %	40 %	256374222
78	NC_013093	CGCCC	2	10	72513	72522	0 %	0 %	20 %	80 %	256374222
79	NC_013093	GCCCG	2	10	72913	72922	0 %	0 %	40 %	60 %	256374222
80	NC_013093	CGTGG	2	10	73291	73300	0 %	20 %	60 %	20 %	256374223
81	NC_013093	CGACC	2	10	73691	73700	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
82	NC_013093	GGCCG	2	10	73723	73732	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
83	NC_013093	CCGGG	2	10	78114	78123	0 %	0 %	60 %	40 %	256374229
84	NC_013093	CGACC	2	10	79914	79923	20 %	0 %	20 %	60 %	256374230
85	NC_013093	GTCGT	2	10	80346	80355	0 %	40 %	40 %	20 %	256374231
86	NC_013093	CGGCG	2	10	80606	80615	0 %	0 %	60 %	40 %	256374231
87	NC_013093	CGGGC	2	10	80651	80660	0 %	0 %	60 %	40 %	256374231
88	NC_013093	CGGCG	2	10	80858	80867	0 %	0 %	60 %	40 %	256374231
89	NC_013093	CGGTG	2	10	82931	82940	0 %	20 %	60 %	20 %	256374234
90	NC_013093	GCAGG	2	10	83108	83117	20 %	0 %	60 %	20 %	256374234
91	NC_013093	GTCCT	2	10	83578	83587	0 %	40 %	20 %	40 %	256374235
92	NC_013093	CCGCG	2	10	84704	84713	0 %	0 %	40 %	60 %	256374236
93	NC_013093	GCCCG	2	10	84920	84929	0 %	0 %	40 %	60 %	256374236
94	NC_013093	CGCGC	2	10	87537	87546	0 %	0 %	40 %	60 %	256374239
95	NC_013093	CGGCC	2	10	88977	88986	0 %	0 %	40 %	60 %	256374241
96	NC_013093	GGTCG	2	10	89950	89959	0 %	20 %	60 %	20 %	256374242
97	NC_013093	AGCGC	2	10	91522	91531	20 %	0 %	40 %	40 %	256374243
98	NC_013093	GCGCG	2	10	92246	92255	0 %	0 %	60 %	40 %	256374244
99	NC_013093	GTCGG	2	10	92503	92512	0 %	20 %	60 %	20 %	256374244
100	NC_013093	GCGCG	2	10	94110	94119	0 %	0 %	60 %	40 %	256374246
101	NC_013093	TCGCC	2	10	94155	94164	0 %	20 %	20 %	60 %	256374246
102	NC_013093	GCGCG	2	10	94745	94754	0 %	0 %	60 %	40 %	256374247
103	NC_013093	GGTCC	2	10	95205	95214	0 %	20 %	40 %	40 %	256374248
104	NC_013093	GGGCT	2	10	96032	96041	0 %	20 %	60 %	20 %	256374248
105	NC_013093	GCCGC	2	10	96113	96122	0 %	0 %	40 %	60 %	256374248
106	NC_013093	CCGAC	2	10	96147	96156	20 %	0 %	20 %	60 %	256374248
107	NC_013093	GCGAC	2	10	96563	96572	20 %	0 %	40 %	40 %	256374249
108	NC_013093	GCTGC	2	10	96963	96972	0 %	20 %	40 %	40 %	256374249
109	NC_013093	GCGCC	2	10	97817	97826	0 %	0 %	40 %	60 %	256374250
110	NC_013093	CGCCC	2	10	98090	98099	0 %	0 %	20 %	80 %	256374250
111	NC_013093	CGCTG	2	10	99168	99177	0 %	20 %	40 %	40 %	256374251
112	NC_013093	GGGCG	2	10	101504	101513	0 %	0 %	80 %	20 %	256374253
113	NC_013093	GCCCC	2	10	101875	101884	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
114	NC_013093	CGGGG	2	10	103195	103204	0 %	0 %	80 %	20 %	256374255
115	NC_013093	CGGCC	2	10	103514	103523	0 %	0 %	40 %	60 %	256374255
116	NC_013093	GGCCG	2	10	105021	105030	0 %	0 %	60 %	40 %	256374255
117	NC_013093	CCGGG	2	10	105341	105350	0 %	0 %	60 %	40 %	256374255
118	NC_013093	CCGCG	2	10	105566	105575	0 %	0 %	40 %	60 %	256374255
119	NC_013093	GGACC	2	10	105628	105637	20 %	0 %	40 %	40 %	256374255
120	NC_013093	GCCCC	2	10	107402	107411	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
121	NC_013093	GCCGA	2	10	110224	110233	20 %	0 %	40 %	40 %	256374260
122	NC_013093	GGACA	2	10	111565	111574	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_013093	CCGGC	2	10	111636	111645	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
124	NC_013093	CGCGC	2	10	111675	111684	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
125	NC_013093	CGTGC	2	10	112657	112666	0 %	20 %	40 %	40 %	256374263
126	NC_013093	CGGTC	2	10	112849	112858	0 %	20 %	40 %	40 %	256374264
127	NC_013093	GCCCG	2	10	114439	114448	0 %	0 %	40 %	60 %	256374267
128	NC_013093	CCCGT	2	10	114873	114882	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
129	NC_013093	GCCCG	2	10	115652	115661	0 %	0 %	40 %	60 %	256374268
130	NC_013093	GGACC	2	10	116288	116297	20 %	0 %	40 %	40 %	256374268
131	NC_013093	CCGGC	2	10	117265	117274	0 %	0 %	40 %	60 %	256374268
132	NC_013093	GTCCG	2	10	117318	117327	0 %	20 %	40 %	40 %	256374268
133	NC_013093	CGGCC	2	10	117890	117899	0 %	0 %	40 %	60 %	256374268
134	NC_013093	GACCG	2	10	118173	118182	20 %	0 %	40 %	40 %	256374268
135	NC_013093	CGCGG	2	10	118650	118659	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
136	NC_013093	CGGCG	2	10	118773	118782	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
137	NC_013093	GCCGC	2	10	119151	119160	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
138	NC_013093	CCGGC	2	10	119613	119622	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
139	NC_013093	CCCGC	2	10	120422	120431	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
140	NC_013093	CCCAG	2	10	120447	120456	20 %	0 %	20 %	60 %	256374269
141	NC_013093	GCGTC	2	10	120465	120474	0 %	20 %	40 %	40 %	256374269
142	NC_013093	TCCGG	2	10	120585	120594	0 %	20 %	40 %	40 %	256374269
143	NC_013093	CGCAG	2	10	121399	121408	20 %	0 %	40 %	40 %	256374270
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146	NC_013093	GCCCG	2	10	128863	128872	0 %	0 %	40 %	60 %	256374277
147	NC_013093	TCGGC	2	10	129575	129584	0 %	20 %	40 %	40 %	256374277
148	NC_013093	CGCAG	2	10	132927	132936	20 %	0 %	40 %	40 %	256374280
149	NC_013093	CGGGC	2	10	133497	133506	0 %	0 %	60 %	40 %	256374280
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153	NC_013093	CGGTG	2	10	140841	140850	0 %	20 %	60 %	20 %	256374287
154	NC_013093	TCGGT	2	10	141116	141125	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
155	NC_013093	CGGGG	2	10	141499	141508	0 %	0 %	80 %	20 %	256374288
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157	NC_013093	GACCC	2	10	143485	143494	20 %	0 %	20 %	60 %	256374290
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160	NC_013093	GCGGT	2	10	152475	152484	0 %	20 %	60 %	20 %	256374298
161	NC_013093	CGACC	2	10	153875	153884	20 %	0 %	20 %	60 %	256374299
162	NC_013093	GCACC	2	10	154343	154352	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
163	NC_013093	AGGTC	2	10	154989	154998	20 %	20 %	40 %	20 %	256374300
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165	NC_013093	GGCGG	2	10	158008	158017	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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184	NC_013093	GCCGC	2	10	173330	173339	0 %	0 %	40 %	60 %	256374315
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198	NC_013093	CGCAC	2	10	184355	184364	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
199	NC_013093	GCCCG	2	10	184444	184453	0 %	0 %	40 %	60 %	256374326
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235	NC_013093	CGTCA	2	10	221019	221028	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
236	NC_013093	GGGAG	2	10	222077	222086	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
237	NC_013093	GTTCG	2	10	223780	223789	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
238	NC_013093	GAACC	2	10	224617	224626	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
239	NC_013093	GCCCG	2	10	225634	225643	0 %	0 %	40 %	60 %	256374362
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242	NC_013093	CGGCG	2	10	231447	231456	0 %	0 %	60 %	40 %	256374365
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248	NC_013093	CCCCG	2	10	234434	234443	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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252	NC_013093	CGCAG	2	10	237710	237719	20 %	0 %	40 %	40 %	256374369
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260	NC_013093	GCGCG	2	10	243701	243710	0 %	0 %	60 %	40 %	256374375
261	NC_013093	TGGCC	2	10	246411	246420	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
262	NC_013093	TCGCC	2	10	246663	246672	0 %	20 %	20 %	60 %	256374378
263	NC_013093	GACCG	2	10	247726	247735	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
264	NC_013093	CCGGA	2	10	249232	249241	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
265	NC_013093	GGTCC	2	10	249466	249475	0 %	20 %	40 %	40 %	256374380
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269	NC_013093	CCGAC	2	10	254461	254470	20 %	0 %	20 %	60 %	256374385
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400	NC_013093	CGGCG	2	10	397358	397367	0 %	0 %	60 %	40 %	256374521
401	NC_013093	GCCGC	2	10	398126	398135	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
402	NC_013093	GCCGC	2	10	398168	398177	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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