MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Flavobacteriaceae bacterium 3519-10

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013062	TTTATT	2	12	21397	21408	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013062	CTGGAT	2	12	68665	68676	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013062	GTTGCA	2	12	69669	69680	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013062	TTAAAA	2	12	117965	117976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013062	TGAAAT	2	12	154605	154616	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013062	GTTTTT	2	12	169459	169470	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013062	TGAATA	2	12	178036	178047	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013062	TTATTT	2	12	178048	178059	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013062	AAAATT	2	12	200138	200149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013062	AATGAT	2	12	233007	233018	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013062	TTTCCG	2	12	277192	277203	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013062	TTCAAA	2	12	290149	290160	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013062	TTTTAC	2	12	296974	296985	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013062	GCCAAG	2	12	317128	317139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013062	AATTTT	2	12	320332	320343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013062	AGGTGG	2	12	322079	322090	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013062	TGCTTT	2	12	362366	362377	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_013062	ATCTTT	2	12	444942	444953	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_013062	ATCTTT	2	12	451605	451616	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013062	TTTTTA	2	12	475700	475711	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013062	AACTTT	2	12	477636	477647	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013062	AATTTA	2	12	502979	502990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013062	TTTTAA	2	12	531045	531056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013062	TTTGTT	2	12	542254	542265	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013062	ATTCAT	2	12	562532	562543	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_013062	TCTTTT	2	12	570051	570062	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013062	TATAAT	2	12	594543	594554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013062	TTAAAT	2	12	605172	605183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013062	TCATTT	2	12	619388	619399	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_013062	TTTAAT	2	12	634001	634012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013062	TTTGAT	2	12	639834	639845	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013062	TAATTC	2	12	647108	647119	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_013062	TGGTTT	2	12	681772	681783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013062	AAATTT	2	12	711344	711355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013062	ATTTAT	2	12	719965	719976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013062	AATAAC	2	12	724699	724710	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013062	AAAATT	2	12	746594	746605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013062	AATTAA	2	12	789930	789941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013062	TTAAAA	2	12	795529	795540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013062	TGAAAA	2	12	858620	858631	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013062	CCTCGG	2	12	885865	885876	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013062	TTTAAT	2	12	885901	885912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013062	AATTTT	2	12	908960	908971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013062	CTCAAC	2	12	924416	924427	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013062	CCTCAA	3	18	937968	937985	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013062	CCTTAA	2	12	937986	937997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013062	ATTAAG	2	12	943263	943274	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013062	AATGTA	2	12	949911	949922	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013062	ATTTAA	2	12	974011	974022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013062	TTTTAT	2	12	996005	996016	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013062	CTTTAA	2	12	996828	996839	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_013062	TATATC	2	12	1012555	1012566	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_013062	AAATTA	2	12	1012573	1012584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013062	ATTAAA	2	12	1016803	1016814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013062	TTTTAC	2	12	1045883	1045894	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_013062	AAAGAG	2	12	1049967	1049978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013062	CCGGGT	2	12	1069105	1069116	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013062	TTAAAA	2	12	1072805	1072816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013062	TTTCGA	2	12	1086749	1086760	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_013062	AGGAAA	2	12	1136595	1136606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013062	TCCTGC	2	12	1179738	1179749	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013062	ACAAAG	2	12	1186390	1186401	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_013062	TGATTT	2	12	1204059	1204070	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013062	GATGCA	2	12	1211847	1211858	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_013062	CCTCAA	2	12	1223338	1223349	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013062	GTTTTA	2	12	1268271	1268282	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013062	TAGAAA	2	12	1288038	1288049	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013062	ATTTCA	2	12	1304448	1304459	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_013062	TAATCC	2	12	1328991	1329002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013062	AAAATT	2	12	1330074	1330085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013062	ATTAAT	2	12	1337608	1337619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013062	TACCCA	2	12	1343160	1343171	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013062	GCTTTG	2	12	1365396	1365407	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_013062	AGTATT	2	12	1452935	1452946	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013062	TGTGTT	2	12	1463783	1463794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013062	TTTACA	2	12	1471558	1471569	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_013062	AAATAT	2	12	1490698	1490709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013062	ACTTTT	2	12	1538185	1538196	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_013062	TTAAAC	2	12	1544688	1544699	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_013062	ATTAAT	2	12	1602390	1602401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013062	TTATTG	2	12	1671080	1671091	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013062	GAATAA	2	12	1671468	1671479	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013062	GTAAAA	2	12	1683388	1683399	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013062	TTTTAC	2	12	1683536	1683547	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_013062	AAAAGC	2	12	1692835	1692846	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_013062	TAACTT	2	12	1692861	1692872	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_013062	TTAAAA	2	12	1692985	1692996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013062	TTGTAC	2	12	1737309	1737320	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_013062	TAAAAT	2	12	1812107	1812118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013062	TGAACA	2	12	1861293	1861304	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_013062	TACGTG	2	12	1902370	1902381	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_013062	ACTTTT	2	12	1925367	1925378	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_013062	TGAAAT	2	12	1950339	1950350	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013062	ATTTTA	2	12	1950382	1950393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013062	GAAATT	2	12	1981415	1981426	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013062	ATTTAA	2	12	1985329	1985340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013062	TAAATT	2	12	2010844	2010855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013062	CTTAAA	2	12	2026950	2026961	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_013062	TTTATA	2	12	2045154	2045165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013062	TAATTA	2	12	2047111	2047122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013062	TTTGTG	2	12	2054081	2054092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013062	GTTATA	2	12	2057178	2057189	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013062	ATTGAA	2	12	2071955	2071966	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013062	ATATGG	2	12	2157261	2157272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013062	AACACC	2	12	2197386	2197397	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_013062	AAAGAT	2	12	2199852	2199863	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013062	ATTTTT	2	12	2239688	2239699	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013062	TGTGTT	2	12	2300204	2300215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013062	ATTAAA	2	12	2313952	2313963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013062	ATCTTT	2	12	2382762	2382773	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_013062	TTTAGT	2	12	2409408	2409419	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013062	AAATTT	2	12	2529196	2529207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013062	ATTTAT	2	12	2563720	2563731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013062	ATTTTA	2	12	2624080	2624091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013062	TTGGTG	2	12	2650709	2650720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013062	AAAGAT	2	12	2744152	2744163	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.