MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Flavobacteriaceae bacterium 3519-10

Total Repeats: 272

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013062	CAATT	2	10	10026	10035	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013062	AGATC	2	10	22529	22538	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013062	GCGTT	2	10	40033	40042	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013062	AATTA	2	10	46306	46315	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013062	GAAGA	2	10	46410	46419	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013062	GGACG	2	10	79174	79183	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013062	GCAAA	2	10	98157	98166	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013062	TTTAA	2	10	112452	112461	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013062	TTTAA	2	10	112796	112805	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013062	CAAAA	2	10	150509	150518	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_013062	AAAAT	2	10	154440	154449	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013062	AACCT	2	10	225689	225698	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_013062	GTCCG	2	10	226776	226785	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_013062	AAAGT	2	10	232292	232301	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013062	AAGCA	2	10	233768	233777	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_013062	AATTA	2	10	233798	233807	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013062	ATTGA	2	10	239278	239287	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013062	AAATT	2	10	247446	247455	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013062	AAATA	2	10	252228	252237	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013062	AAATG	2	10	285765	285774	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013062	GGTTT	2	10	286304	286313	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013062	AAACT	2	10	286522	286531	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_013062	ATAAA	2	10	290043	290052	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013062	TAAAA	2	10	311247	311256	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013062	CGTGT	2	10	327934	327943	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_013062	CTGCA	2	10	362512	362521	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_013062	ACAAT	2	10	365979	365988	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_013062	TGTTT	2	10	382094	382103	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013062	GTTTA	2	10	384598	384607	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013062	AATTC	2	10	424692	424701	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_013062	TTTAG	2	10	424837	424846	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013062	TGAGT	2	10	431004	431013	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013062	GAAAA	2	10	431532	431541	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013062	TTTAA	2	10	433743	433752	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013062	GTTGT	2	10	433896	433905	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013062	AGAAA	2	10	435167	435176	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013062	TGACC	2	10	439206	439215	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_013062	ACGGA	2	10	458174	458183	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_013062	AAGCG	2	10	464778	464787	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_013062	ACAAT	2	10	475534	475543	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_013062	AGACG	2	10	491121	491130	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_013062	AATAG	2	10	494862	494871	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013062	CGGTA	2	10	502942	502951	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_013062	TTTTC	2	10	527919	527928	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_013062	TTTTA	2	10	529818	529827	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013062	ATTTT	2	10	549267	549276	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013062	TTGAA	2	10	563401	563410	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013062	CTACG	2	10	593236	593245	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_013062	TTCTG	2	10	593379	593388	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013062	AAAGA	2	10	596058	596067	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013062	ATTTT	2	10	619747	619756	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013062	ATAAA	2	10	626925	626934	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013062	TACTT	2	10	633154	633163	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_013062	AAATT	2	10	633914	633923	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013062	AAAGA	2	10	634075	634084	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013062	TTCTT	2	10	644544	644553	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_013062	GAATA	2	10	646916	646925	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013062	AGATA	2	10	647438	647447	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013062	AACTT	2	10	648723	648732	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_013062	TATAA	2	10	653559	653568	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013062	ATCCA	2	10	653895	653904	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_013062	TTAAT	2	10	653954	653963	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013062	AACTA	2	10	657298	657307	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_013062	GTTTA	2	10	659655	659664	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013062	AATTG	2	10	687861	687870	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013062	TATAA	2	10	701292	701301	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013062	TCATA	2	10	703799	703808	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_013062	TTAAA	2	10	730915	730924	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013062	ATTTT	2	10	736421	736430	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013062	GAAAA	2	10	780817	780826	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013062	AAATC	2	10	782021	782030	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_013062	ATCAT	2	10	790649	790658	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_013062	GGTCA	2	10	796757	796766	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_013062	GATTT	2	10	796780	796789	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013062	AAATT	2	10	797570	797579	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013062	CTTTT	2	10	798203	798212	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_013062	AAATT	2	10	798333	798342	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013062	AAATA	2	10	828560	828569	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013062	ATCAA	2	10	834134	834143	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_013062	CTTGC	2	10	836747	836756	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_013062	TATTT	2	10	854382	854391	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013062	TAAAA	2	10	855342	855351	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013062	ACAAA	2	10	858635	858644	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_013062	TCGCT	2	10	869420	869429	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_013062	TCGCT	2	10	869498	869507	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_013062	TCGCT	2	10	869577	869586	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_013062	TCGCT	2	10	869656	869665	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_013062	TAATT	2	10	874454	874463	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013062	GAAAA	2	10	874585	874594	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013062	GGCAT	2	10	895331	895340	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_013062	TTTGT	2	10	907080	907089	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013062	GAAAT	2	10	930481	930490	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013062	ATAGA	2	10	949648	949657	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013062	TTCAT	2	10	973275	973284	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_013062	ATTTA	2	10	980924	980933	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013062	ATCTT	2	10	990032	990041	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_013062	ACCTT	2	10	1009681	1009690	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_013062	TTTCT	2	10	1017363	1017372	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_013062	TTGTG	2	10	1032520	1032529	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013062	AAAAT	2	10	1032634	1032643	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013062	TAATT	2	10	1034322	1034331	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013062	TGCTG	2	10	1035275	1035284	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_013062	TAGTT	2	10	1037033	1037042	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013062	ATTAC	2	10	1045740	1045749	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_013062	ATTTT	2	10	1049920	1049929	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013062	TTTAA	2	10	1069284	1069293	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013062	CTGCA	2	10	1076459	1076468	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_013062	AATAT	2	10	1087759	1087768	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013062	ATTTT	2	10	1092274	1092283	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013062	TATTT	2	10	1121186	1121195	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013062	AGTAA	2	10	1122848	1122857	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013062	AAGTA	2	10	1126049	1126058	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013062	GCCAT	2	10	1131886	1131895	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_013062	AATTT	2	10	1131999	1132008	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013062	TGTAA	2	10	1135894	1135903	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013062	TTCAT	2	10	1137718	1137727	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_013062	AAGAT	2	10	1139708	1139717	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013062	AGAGA	2	10	1145255	1145264	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013062	TCTGC	2	10	1147370	1147379	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_013062	ATTAG	2	10	1159230	1159239	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013062	TTTTA	2	10	1164488	1164497	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013062	TAAAA	2	10	1169903	1169912	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013062	CTCAG	2	10	1170164	1170173	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_013062	CAGTC	2	10	1170316	1170325	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_013062	GTTTG	2	10	1171738	1171747	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013062	TAATT	2	10	1172450	1172459	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013062	AGCGC	2	10	1185317	1185326	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_013062	TTTGC	2	10	1191137	1191146	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_013062	GTTAC	2	10	1192805	1192814	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_013062	TTCTT	2	10	1196973	1196982	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_013062	TTCGC	2	10	1204131	1204140	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_013062	GCTTT	2	10	1204199	1204208	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_013062	GATGG	2	10	1211665	1211674	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013062	CTTTA	2	10	1216632	1216641	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_013062	GTTTA	2	10	1244544	1244553	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013062	ATCTG	2	10	1245406	1245415	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_013062	CAGGA	2	10	1247140	1247149	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_013062	TAAAA	2	10	1255449	1255458	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013062	ATTTT	2	10	1257719	1257728	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013062	AATCA	2	10	1274955	1274964	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_013062	ATTTT	2	10	1277063	1277072	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013062	TAAGT	2	10	1280219	1280228	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013062	AAAAT	2	10	1291004	1291013	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013062	CGTTA	2	10	1304315	1304324	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_013062	GTTTC	2	10	1304367	1304376	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_013062	ATTTA	2	10	1316695	1316704	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013062	TTTTA	2	10	1316710	1316719	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_013062	AATTA	2	10	1351808	1351817	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_013062	TCTTA	2	10	1389796	1389805	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
156	NC_013062	GTTCA	2	10	1433632	1433641	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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161	NC_013062	TTTTA	2	10	1519285	1519294	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_013062	TGATT	2	10	1519977	1519986	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_013062	TTTTG	2	10	1521742	1521751	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
164	NC_013062	TTATT	2	10	1525862	1525871	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_013062	ATTAT	2	10	1602483	1602492	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_013062	TCCTG	2	10	1616520	1616529	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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181	NC_013062	TTTTA	2	10	1750842	1750851	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_013062	AAACA	2	10	1797778	1797787	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
187	NC_013062	AAAAT	2	10	1812079	1812088	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_013062	TTTTA	2	10	1889034	1889043	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_013062	TCGCT	2	10	1950577	1950586	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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197	NC_013062	TGATT	2	10	1960579	1960588	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_013062	GGAAA	2	10	2727644	2727653	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.