MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Neisseria meningitidis alpha14 chromosome

Total Repeats: 1177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013016	CGACA	2	10	891	900	40 %	0 %	20 %	40 %	254804029
2	NC_013016	GACGG	2	10	2345	2354	20 %	0 %	60 %	20 %	254804030
3	NC_013016	GCGTG	2	10	3201	3210	0 %	20 %	60 %	20 %	254804030
4	NC_013016	ACGGG	2	10	3496	3505	20 %	0 %	60 %	20 %	254804031
5	NC_013016	GGCGC	2	10	3516	3525	0 %	0 %	60 %	40 %	254804031
6	NC_013016	ATTGA	2	10	4530	4539	40 %	40 %	20 %	0 %	254804032
7	NC_013016	GATTG	2	10	6048	6057	20 %	40 %	40 %	0 %	254804033
8	NC_013016	CAAAG	2	10	7559	7568	60 %	0 %	20 %	20 %	254804034
9	NC_013016	TGCCT	2	10	7917	7926	0 %	40 %	20 %	40 %	254804035
10	NC_013016	ATGTC	2	10	10495	10504	20 %	40 %	20 %	20 %	254804040
11	NC_013016	TGGGC	2	10	12515	12524	0 %	20 %	60 %	20 %	254804042
12	NC_013016	TTTGA	2	10	12571	12580	20 %	60 %	20 %	0 %	254804042
13	NC_013016	TATTT	2	10	13177	13186	20 %	80 %	0 %	0 %	254804043
14	NC_013016	AAAAC	2	10	13277	13286	80 %	0 %	0 %	20 %	254804043
15	NC_013016	TGTCC	2	10	14477	14486	0 %	40 %	20 %	40 %	254804045
16	NC_013016	GCGCC	2	10	17752	17761	0 %	0 %	40 %	60 %	254804046
17	NC_013016	GCAAT	2	10	20516	20525	40 %	20 %	20 %	20 %	254804050
18	NC_013016	GAAGT	2	10	20542	20551	40 %	20 %	40 %	0 %	254804050
19	NC_013016	AGCCA	2	10	23562	23571	40 %	0 %	20 %	40 %	254804054
20	NC_013016	TCTGG	2	10	25032	25041	0 %	40 %	40 %	20 %	254804055
21	NC_013016	ATTTG	2	10	27408	27417	20 %	60 %	20 %	0 %	254804059
22	NC_013016	ACATC	2	10	28230	28239	40 %	20 %	0 %	40 %	254804060
23	NC_013016	GCCGC	2	10	29830	29839	0 %	0 %	40 %	60 %	254804062
24	NC_013016	GTTGC	2	10	29899	29908	0 %	40 %	40 %	20 %	254804062
25	NC_013016	GGTGG	2	10	34692	34701	0 %	20 %	80 %	0 %	254804066
26	NC_013016	CGAAC	2	10	37207	37216	40 %	0 %	20 %	40 %	254804067
27	NC_013016	AGCCG	2	10	39791	39800	20 %	0 %	40 %	40 %	254804067
28	NC_013016	CGTGG	2	10	41161	41170	0 %	20 %	60 %	20 %	254804068
29	NC_013016	TCGGT	2	10	42935	42944	0 %	40 %	40 %	20 %	254804069
30	NC_013016	TGTTT	2	10	44022	44031	0 %	80 %	20 %	0 %	254804069
31	NC_013016	CGGCC	2	10	45570	45579	0 %	0 %	40 %	60 %	254804070
32	NC_013016	TTTTC	2	10	45773	45782	0 %	80 %	0 %	20 %	254804071
33	NC_013016	GAAAA	2	10	45878	45887	80 %	0 %	20 %	0 %	254804071
34	NC_013016	GCCGC	2	10	46479	46488	0 %	0 %	40 %	60 %	254804073
35	NC_013016	CTTGT	2	10	52586	52595	0 %	60 %	20 %	20 %	254804078
36	NC_013016	ATTTT	2	10	52674	52683	20 %	80 %	0 %	0 %	254804079
37	NC_013016	TAAAT	2	10	57239	57248	60 %	40 %	0 %	0 %	254804084
38	NC_013016	ATAAA	2	10	59732	59741	80 %	20 %	0 %	0 %	254804087
39	NC_013016	ATTTG	2	10	60665	60674	20 %	60 %	20 %	0 %	254804088
40	NC_013016	TGCCG	2	10	65192	65201	0 %	20 %	40 %	40 %	254804094
41	NC_013016	CGGTT	2	10	68849	68858	0 %	40 %	40 %	20 %	254804098
42	NC_013016	TTTGG	2	10	69459	69468	0 %	60 %	40 %	0 %	254804099
43	NC_013016	CTGTT	2	10	70421	70430	0 %	60 %	20 %	20 %	254804101
44	NC_013016	TCCGC	2	10	77309	77318	0 %	20 %	20 %	60 %	254804108
45	NC_013016	GGCGG	2	10	78385	78394	0 %	0 %	80 %	20 %	254804109
46	NC_013016	TGCCG	2	10	78750	78759	0 %	20 %	40 %	40 %	254804110
47	NC_013016	TGGCT	2	10	79435	79444	0 %	40 %	40 %	20 %	254804111
48	NC_013016	ACCGA	2	10	80226	80235	40 %	0 %	20 %	40 %	254804111
49	NC_013016	AGGCA	2	10	81989	81998	40 %	0 %	40 %	20 %	254804113
50	NC_013016	CGGCG	2	10	85545	85554	0 %	0 %	60 %	40 %	254804116
51	NC_013016	CGGGC	2	10	87477	87486	0 %	0 %	60 %	40 %	254804118
52	NC_013016	AGGAG	2	10	91350	91359	40 %	0 %	60 %	0 %	254804122
53	NC_013016	TCGAT	2	10	91921	91930	20 %	40 %	20 %	20 %	254804123
54	NC_013016	CCCGC	2	10	92368	92377	0 %	0 %	20 %	80 %	254804123
55	NC_013016	CGGGG	2	10	93719	93728	0 %	0 %	80 %	20 %	254804125
56	NC_013016	AATCC	2	10	95957	95966	40 %	20 %	0 %	40 %	254804127
57	NC_013016	CAGGA	2	10	96072	96081	40 %	0 %	40 %	20 %	254804127
58	NC_013016	AGGGC	2	10	97460	97469	20 %	0 %	60 %	20 %	254804128
59	NC_013016	TCCGT	2	10	98941	98950	0 %	40 %	20 %	40 %	254804129
60	NC_013016	TTTCC	2	10	100761	100770	0 %	60 %	0 %	40 %	254804130
61	NC_013016	CAAAA	2	10	101858	101867	80 %	0 %	0 %	20 %	254804131
62	NC_013016	TTTGC	2	10	105101	105110	0 %	60 %	20 %	20 %	254804135
63	NC_013016	CGGCG	2	10	105246	105255	0 %	0 %	60 %	40 %	254804135
64	NC_013016	GTTTT	2	10	105440	105449	0 %	80 %	20 %	0 %	254804135
65	NC_013016	CGATA	2	10	105521	105530	40 %	20 %	20 %	20 %	254804135
66	NC_013016	GGCAA	2	10	107112	107121	40 %	0 %	40 %	20 %	254804137
67	NC_013016	CAAAC	2	10	107517	107526	60 %	0 %	0 %	40 %	254804138
68	NC_013016	AGCAA	2	10	107531	107540	60 %	0 %	20 %	20 %	254804138
69	NC_013016	GGTAT	2	10	108424	108433	20 %	40 %	40 %	0 %	254804138
70	NC_013016	AGCGG	2	10	110567	110576	20 %	0 %	60 %	20 %	254804140
71	NC_013016	TGCCG	2	10	113689	113698	0 %	20 %	40 %	40 %	254804143
72	NC_013016	GGGCA	2	10	115465	115474	20 %	0 %	60 %	20 %	254804146
73	NC_013016	GTTCA	2	10	118652	118661	20 %	40 %	20 %	20 %	254804147
74	NC_013016	CAAAA	2	10	119704	119713	80 %	0 %	0 %	20 %	254804148
75	NC_013016	ACGGC	2	10	121642	121651	20 %	0 %	40 %	40 %	254804149
76	NC_013016	GTTAC	2	10	121660	121669	20 %	40 %	20 %	20 %	254804149
77	NC_013016	GGTCT	2	10	125454	125463	0 %	40 %	40 %	20 %	254804151
78	NC_013016	ATAGG	2	10	126607	126616	40 %	20 %	40 %	0 %	254804153
79	NC_013016	GGCGT	2	10	127855	127864	0 %	20 %	60 %	20 %	254804154
80	NC_013016	AGGCG	2	10	128925	128934	20 %	0 %	60 %	20 %	254804155
81	NC_013016	TGCGG	2	10	129051	129060	0 %	20 %	60 %	20 %	254804156
82	NC_013016	GGCGC	3	15	131348	131362	0 %	0 %	60 %	40 %	254804158
83	NC_013016	TGGCG	2	10	135575	135584	0 %	20 %	60 %	20 %	254804162
84	NC_013016	CGCGG	2	10	138862	138871	0 %	0 %	60 %	40 %	254804166
85	NC_013016	CCGCG	2	10	140628	140637	0 %	0 %	40 %	60 %	254804169
86	NC_013016	AGACG	2	10	150193	150202	40 %	0 %	40 %	20 %	254804174
87	NC_013016	AAACC	2	10	152337	152346	60 %	0 %	0 %	40 %	254804175
88	NC_013016	TTTCT	2	10	152366	152375	0 %	80 %	0 %	20 %	254804175
89	NC_013016	GGTTG	2	10	154593	154602	0 %	40 %	60 %	0 %	254804176
90	NC_013016	CAACC	2	10	154646	154655	40 %	0 %	0 %	60 %	254804176
91	NC_013016	CTGCC	2	10	157041	157050	0 %	20 %	20 %	60 %	254804177
92	NC_013016	AAGTG	2	10	158198	158207	40 %	20 %	40 %	0 %	254804178
93	NC_013016	GCCGC	2	10	161310	161319	0 %	0 %	40 %	60 %	254804180
94	NC_013016	CGGCA	2	10	163873	163882	20 %	0 %	40 %	40 %	254804182
95	NC_013016	GCGCG	2	10	164943	164952	0 %	0 %	60 %	40 %	254804186
96	NC_013016	GGGCG	2	10	165524	165533	0 %	0 %	80 %	20 %	254804186
97	NC_013016	ACCGT	2	10	166103	166112	20 %	20 %	20 %	40 %	254804187
98	NC_013016	GCTTG	2	10	168745	168754	0 %	40 %	40 %	20 %	254804189
99	NC_013016	TGCGG	2	10	171322	171331	0 %	20 %	60 %	20 %	254804189
100	NC_013016	TGCCG	2	10	174583	174592	0 %	20 %	40 %	40 %	254804191
101	NC_013016	CGGCG	2	10	174943	174952	0 %	0 %	60 %	40 %	254804191
102	NC_013016	CCGCG	2	10	176550	176559	0 %	0 %	40 %	60 %	254804191
103	NC_013016	GCCGC	2	10	176762	176771	0 %	0 %	40 %	60 %	254804191
104	NC_013016	CAAAA	2	10	181022	181031	80 %	0 %	0 %	20 %	254804195
105	NC_013016	GTACG	2	10	185656	185665	20 %	20 %	40 %	20 %	254804199
106	NC_013016	CGCGC	2	10	192696	192705	0 %	0 %	40 %	60 %	254804202
107	NC_013016	TTTTC	2	10	193353	193362	0 %	80 %	0 %	20 %	254804202
108	NC_013016	GGGCG	2	10	194642	194651	0 %	0 %	80 %	20 %	254804203
109	NC_013016	GCGCC	2	10	200366	200375	0 %	0 %	40 %	60 %	254804208
110	NC_013016	ACCGC	2	10	200379	200388	20 %	0 %	20 %	60 %	254804208
111	NC_013016	GCCGG	2	10	204344	204353	0 %	0 %	60 %	40 %	254804210
112	NC_013016	ATATG	2	10	206995	207004	40 %	40 %	20 %	0 %	254804210
113	NC_013016	GCGCC	2	10	209089	209098	0 %	0 %	40 %	60 %	254804213
114	NC_013016	GCCGC	2	10	212605	212614	0 %	0 %	40 %	60 %	254804214
115	NC_013016	AAAAC	2	10	212908	212917	80 %	0 %	0 %	20 %	254804214
116	NC_013016	GCAAC	2	10	213336	213345	40 %	0 %	20 %	40 %	254804214
117	NC_013016	GAATG	2	10	213349	213358	40 %	20 %	40 %	0 %	254804214
118	NC_013016	TTTGA	2	10	214058	214067	20 %	60 %	20 %	0 %	254804215
119	NC_013016	TCGGT	2	10	214858	214867	0 %	40 %	40 %	20 %	254804215
120	NC_013016	TTGAT	2	10	215049	215058	20 %	60 %	20 %	0 %	254804215
121	NC_013016	TCCGT	2	10	226165	226174	0 %	40 %	20 %	40 %	254804222
122	NC_013016	GGCAT	2	10	227567	227576	20 %	20 %	40 %	20 %	254804224
123	NC_013016	CCCGC	2	10	228505	228514	0 %	0 %	20 %	80 %	254804226
124	NC_013016	CGGCG	2	10	229169	229178	0 %	0 %	60 %	40 %	254804226
125	NC_013016	GCCCA	2	10	230393	230402	20 %	0 %	20 %	60 %	254804228
126	NC_013016	CGGCG	2	10	233763	233772	0 %	0 %	60 %	40 %	254804231
127	NC_013016	GGCGC	2	10	233789	233798	0 %	0 %	60 %	40 %	254804231
128	NC_013016	GCCGC	2	10	235044	235053	0 %	0 %	40 %	60 %	254804232
129	NC_013016	CCGGC	2	10	242726	242735	0 %	0 %	40 %	60 %	254804242
130	NC_013016	CAATG	2	10	243914	243923	40 %	20 %	20 %	20 %	254804243
131	NC_013016	CAAAC	2	10	245718	245727	60 %	0 %	0 %	40 %	254804246
132	NC_013016	GGAAG	2	10	246487	246496	40 %	0 %	60 %	0 %	254804248
133	NC_013016	ATGCA	2	10	247048	247057	40 %	20 %	20 %	20 %	254804249
134	NC_013016	GCCTT	2	10	252338	252347	0 %	40 %	20 %	40 %	254804253
135	NC_013016	CGCGC	2	10	254209	254218	0 %	0 %	40 %	60 %	254804255
136	NC_013016	GCGCC	2	10	254487	254496	0 %	0 %	40 %	60 %	254804255
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141	NC_013016	AGCTT	2	10	257219	257228	20 %	40 %	20 %	20 %	254804258
142	NC_013016	TGGAT	2	10	257742	257751	20 %	40 %	40 %	0 %	254804258
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149	NC_013016	GATAT	2	10	277403	277412	40 %	40 %	20 %	0 %	254804274
150	NC_013016	ATGGG	2	10	277539	277548	20 %	20 %	60 %	0 %	254804274
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156	NC_013016	TGGAA	2	10	291981	291990	40 %	20 %	40 %	0 %	254804286
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167	NC_013016	TGGTT	2	10	318184	318193	0 %	60 %	40 %	0 %	254804310
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174	NC_013016	GCGAT	2	10	326807	326816	20 %	20 %	40 %	20 %	254804318
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201	NC_013016	TTTTA	2	10	363830	363839	20 %	80 %	0 %	0 %	254804348
202	NC_013016	ATTTT	2	10	363910	363919	20 %	80 %	0 %	0 %	254804348
203	NC_013016	TCAGT	2	10	368755	368764	20 %	40 %	20 %	20 %	254804355
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249	NC_013016	GGCAG	2	10	454862	454871	20 %	0 %	60 %	20 %	254804422
250	NC_013016	CGGCG	2	10	454985	454994	0 %	0 %	60 %	40 %	254804422
251	NC_013016	CGGTT	2	10	456057	456066	0 %	40 %	40 %	20 %	254804423
252	NC_013016	ATCGG	2	10	457749	457758	20 %	20 %	40 %	20 %	254804424
253	NC_013016	CCGAC	2	10	461726	461735	20 %	0 %	20 %	60 %	254804429
254	NC_013016	GCATC	2	10	463658	463667	20 %	20 %	20 %	40 %	254804429
255	NC_013016	GCAGG	2	10	464316	464325	20 %	0 %	60 %	20 %	254804429
256	NC_013016	TTTGT	2	10	467010	467019	0 %	80 %	20 %	0 %	254804431
257	NC_013016	CGGCA	2	10	470180	470189	20 %	0 %	40 %	40 %	254804433
258	NC_013016	CGATG	2	10	472673	472682	20 %	20 %	40 %	20 %	254804435
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260	NC_013016	CGATG	2	10	473915	473924	20 %	20 %	40 %	20 %	254804435
261	NC_013016	AGATA	2	10	479703	479712	60 %	20 %	20 %	0 %	254804437
262	NC_013016	AGCGA	2	10	479957	479966	40 %	0 %	40 %	20 %	254804438
263	NC_013016	GATAT	2	10	480207	480216	40 %	40 %	20 %	0 %	254804438
264	NC_013016	CGATT	2	10	480379	480388	20 %	40 %	20 %	20 %	254804438
265	NC_013016	GCCTT	2	10	482049	482058	0 %	40 %	20 %	40 %	254804442
266	NC_013016	GCGGT	2	10	485733	485742	0 %	20 %	60 %	20 %	254804446
267	NC_013016	AATGA	2	10	492024	492033	60 %	20 %	20 %	0 %	254804452
268	NC_013016	CGCAG	2	10	492313	492322	20 %	0 %	40 %	40 %	254804452
269	NC_013016	GGCCG	2	10	492633	492642	0 %	0 %	60 %	40 %	254804452
270	NC_013016	CAAAA	2	10	495952	495961	80 %	0 %	0 %	20 %	254804456
271	NC_013016	TTTGC	2	10	496088	496097	0 %	60 %	20 %	20 %	254804456
272	NC_013016	CAAAC	2	10	500642	500651	60 %	0 %	0 %	40 %	254804460
273	NC_013016	CGATG	2	10	500905	500914	20 %	20 %	40 %	20 %	254804461
274	NC_013016	GCGAC	2	10	500937	500946	20 %	0 %	40 %	40 %	254804461
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276	NC_013016	GCCTT	2	10	502302	502311	0 %	40 %	20 %	40 %	254804462
277	NC_013016	GCGCG	2	10	502423	502432	0 %	0 %	60 %	40 %	254804462
278	NC_013016	CGGTA	2	10	508810	508819	20 %	20 %	40 %	20 %	254804466
279	NC_013016	AATCA	2	10	512456	512465	60 %	20 %	0 %	20 %	254804468
280	NC_013016	GCAGG	2	10	517964	517973	20 %	0 %	60 %	20 %	254804470
281	NC_013016	CGTGT	2	10	522179	522188	0 %	40 %	40 %	20 %	254804476
282	NC_013016	CGTAC	2	10	522400	522409	20 %	20 %	20 %	40 %	254804476
283	NC_013016	GCAGT	2	10	523076	523085	20 %	20 %	40 %	20 %	254804476
284	NC_013016	GGGTA	2	10	523604	523613	20 %	20 %	60 %	0 %	254804476
285	NC_013016	TGGTG	2	10	523681	523690	0 %	40 %	60 %	0 %	254804476
286	NC_013016	TTGCC	2	10	526429	526438	0 %	40 %	20 %	40 %	254804479
287	NC_013016	GTCCA	2	10	526690	526699	20 %	20 %	20 %	40 %	254804479
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289	NC_013016	GCAGG	2	10	527994	528003	20 %	0 %	60 %	20 %	254804479
290	NC_013016	ACCGC	2	10	530646	530655	20 %	0 %	20 %	60 %	254804484
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293	NC_013016	TGCGG	2	10	534120	534129	0 %	20 %	60 %	20 %	254804488
294	NC_013016	GGTAA	2	10	534481	534490	40 %	20 %	40 %	0 %	254804489
295	NC_013016	TTTCT	2	10	536188	536197	0 %	80 %	0 %	20 %	254804490
296	NC_013016	CATTG	2	10	536200	536209	20 %	40 %	20 %	20 %	254804490
297	NC_013016	TGCCG	2	10	537328	537337	0 %	20 %	40 %	40 %	254804491
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299	NC_013016	GGCAA	3	15	538224	538238	40 %	0 %	40 %	20 %	254804493
300	NC_013016	CCGTA	2	10	539666	539675	20 %	20 %	20 %	40 %	254804495
301	NC_013016	CGCGC	2	10	548851	548860	0 %	0 %	40 %	60 %	254804500
302	NC_013016	GGCAT	2	10	551826	551835	20 %	20 %	40 %	20 %	254804501
303	NC_013016	CGCGC	2	10	553358	553367	0 %	0 %	40 %	60 %	254804503
304	NC_013016	GCACG	2	10	555307	555316	20 %	0 %	40 %	40 %	254804505
305	NC_013016	TTCTT	2	10	558145	558154	0 %	80 %	0 %	20 %	254804507
306	NC_013016	GTCGC	2	10	560042	560051	0 %	20 %	40 %	40 %	254804509
307	NC_013016	CAAAC	2	10	561339	561348	60 %	0 %	0 %	40 %	254804510
308	NC_013016	CGTCG	2	10	562388	562397	0 %	20 %	40 %	40 %	254804512
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320	NC_013016	TTGCG	2	10	594530	594539	0 %	40 %	40 %	20 %	254804544
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324	NC_013016	ATGCG	2	10	603848	603857	20 %	20 %	40 %	20 %	254804554
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332	NC_013016	AAAAG	2	10	619533	619542	80 %	0 %	20 %	0 %	254804570
333	NC_013016	CCTGC	2	10	620167	620176	0 %	20 %	20 %	60 %	254804570
334	NC_013016	CCGAA	2	10	622001	622010	40 %	0 %	20 %	40 %	254804571
335	NC_013016	CCGAT	2	10	622345	622354	20 %	20 %	20 %	40 %	254804571
336	NC_013016	TACGG	2	10	622482	622491	20 %	20 %	40 %	20 %	254804571
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343	NC_013016	GGGAA	2	10	632735	632744	40 %	0 %	60 %	0 %	254804580
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346	NC_013016	TTTTG	2	10	637852	637861	0 %	80 %	20 %	0 %	254804584
347	NC_013016	TGCGG	2	10	638431	638440	0 %	20 %	60 %	20 %	254804584
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349	NC_013016	TTTTG	2	10	638770	638779	0 %	80 %	20 %	0 %	254804584
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361	NC_013016	CCGCT	2	10	660512	660521	0 %	20 %	20 %	60 %	254804599
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364	NC_013016	CGGTG	2	10	661193	661202	0 %	20 %	60 %	20 %	254804600
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372	NC_013016	TGATT	2	10	670784	670793	20 %	60 %	20 %	0 %	254804609
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376	NC_013016	GCAGT	2	10	684494	684503	20 %	20 %	40 %	20 %	254804623
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380	NC_013016	ATATT	2	10	687264	687273	40 %	60 %	0 %	0 %	254804626
381	NC_013016	GCGCG	2	10	687946	687955	0 %	0 %	60 %	40 %	254804627
382	NC_013016	GTGTC	2	10	689131	689140	0 %	40 %	40 %	20 %	254804629
383	NC_013016	CGATT	2	10	689764	689773	20 %	40 %	20 %	20 %	254804631
384	NC_013016	ATCGG	2	10	690536	690545	20 %	20 %	40 %	20 %	254804631
385	NC_013016	TGTTC	2	10	690558	690567	0 %	60 %	20 %	20 %	254804631
386	NC_013016	GGATT	2	10	692241	692250	20 %	40 %	40 %	0 %	254804633
387	NC_013016	ATCAA	2	10	692572	692581	60 %	20 %	0 %	20 %	254804634
388	NC_013016	CAAGG	2	10	694218	694227	40 %	0 %	40 %	20 %	254804636
389	NC_013016	TTGGT	2	10	694685	694694	0 %	60 %	40 %	0 %	254804637
390	NC_013016	CGCGC	2	10	700099	700108	0 %	0 %	40 %	60 %	254804642
391	NC_013016	TTGCC	2	10	703500	703509	0 %	40 %	20 %	40 %	254804645
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