MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Neisseria meningitidis alpha14 chromosome

Total Repeats: 5543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013016	CTGA	2	8	21	28	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013016	TTTG	2	8	933	940	0 %	75 %	25 %	0 %	254804029
3	NC_013016	CGGG	2	8	998	1005	0 %	0 %	75 %	25 %	254804029
4	NC_013016	CTGC	2	8	1879	1886	0 %	25 %	25 %	50 %	254804029
5	NC_013016	TCGG	2	8	2253	2260	0 %	25 %	50 %	25 %	254804030
6	NC_013016	GGCC	2	8	2763	2770	0 %	0 %	50 %	50 %	254804030
7	NC_013016	GTCC	2	8	3483	3490	0 %	25 %	25 %	50 %	254804031
8	NC_013016	CTTC	2	8	3653	3660	0 %	50 %	0 %	50 %	254804031
9	NC_013016	ATAC	2	8	3768	3775	50 %	25 %	0 %	25 %	254804031
10	NC_013016	CCTG	2	8	4042	4049	0 %	25 %	25 %	50 %	254804032
11	NC_013016	GCTG	2	8	4057	4064	0 %	25 %	50 %	25 %	254804032
12	NC_013016	GTCG	2	8	4778	4785	0 %	25 %	50 %	25 %	254804032
13	NC_013016	ATAA	2	8	4846	4853	75 %	25 %	0 %	0 %	254804032
14	NC_013016	GATG	2	8	5687	5694	25 %	25 %	50 %	0 %	254804033
15	NC_013016	GGCG	2	8	6038	6045	0 %	0 %	75 %	25 %	254804033
16	NC_013016	TGCG	2	8	6322	6329	0 %	25 %	50 %	25 %	254804033
17	NC_013016	CTCG	2	8	6667	6674	0 %	25 %	25 %	50 %	254804034
18	NC_013016	TCCA	2	8	6677	6684	25 %	25 %	0 %	50 %	254804034
19	NC_013016	AAAC	2	8	6841	6848	75 %	0 %	0 %	25 %	254804034
20	NC_013016	GGCG	2	8	7054	7061	0 %	0 %	75 %	25 %	254804034
21	NC_013016	CCGA	2	8	7328	7335	25 %	0 %	25 %	50 %	254804034
22	NC_013016	GCGG	2	8	7580	7587	0 %	0 %	75 %	25 %	254804034
23	NC_013016	CTGC	2	8	7691	7698	0 %	25 %	25 %	50 %	254804034
24	NC_013016	GTGC	2	8	7847	7854	0 %	25 %	50 %	25 %	254804035
25	NC_013016	GAAA	2	8	8510	8517	75 %	0 %	25 %	0 %	254804036
26	NC_013016	CGGG	2	8	9846	9853	0 %	0 %	75 %	25 %	254804038
27	NC_013016	GTTT	2	8	10093	10100	0 %	75 %	25 %	0 %	254804039
28	NC_013016	GGCA	2	8	10191	10198	25 %	0 %	50 %	25 %	254804039
29	NC_013016	CGGG	2	8	10971	10978	0 %	0 %	75 %	25 %	254804041
30	NC_013016	TCCG	2	8	11262	11269	0 %	25 %	25 %	50 %	254804041
31	NC_013016	GCGG	2	8	11329	11336	0 %	0 %	75 %	25 %	254804041
32	NC_013016	GCAG	2	8	11614	11621	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013016	GGTC	2	8	11886	11893	0 %	25 %	50 %	25 %	254804042
34	NC_013016	GGTT	2	8	13576	13583	0 %	50 %	50 %	0 %	254804044
35	NC_013016	TTGG	2	8	13775	13782	0 %	50 %	50 %	0 %	254804044
36	NC_013016	GTTC	2	8	14357	14364	0 %	50 %	25 %	25 %	254804045
37	NC_013016	CAGG	2	8	14396	14403	25 %	0 %	50 %	25 %	254804045
38	NC_013016	AGGT	2	8	14539	14546	25 %	25 %	50 %	0 %	254804045
39	NC_013016	GTGG	2	8	14559	14566	0 %	25 %	75 %	0 %	254804045
40	NC_013016	GGCA	2	8	14817	14824	25 %	0 %	50 %	25 %	254804045
41	NC_013016	GGCG	2	8	15650	15657	0 %	0 %	75 %	25 %	254804045
42	NC_013016	GGTT	2	8	16340	16347	0 %	50 %	50 %	0 %	254804045
43	NC_013016	AACA	2	8	18370	18377	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013016	GGCG	2	8	18881	18888	0 %	0 %	75 %	25 %	254804048
45	NC_013016	GGCG	2	8	19038	19045	0 %	0 %	75 %	25 %	254804048
46	NC_013016	GATT	2	8	19607	19614	25 %	50 %	25 %	0 %	254804049
47	NC_013016	AGGC	2	8	20392	20399	25 %	0 %	50 %	25 %	254804050
48	NC_013016	TGAA	2	8	20503	20510	50 %	25 %	25 %	0 %	254804050
49	NC_013016	GCAG	2	8	20624	20631	25 %	0 %	50 %	25 %	254804050
50	NC_013016	TGAA	2	8	20988	20995	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013016	CTGC	2	8	21594	21601	0 %	25 %	25 %	50 %	254804051
52	NC_013016	CAGG	2	8	21765	21772	25 %	0 %	50 %	25 %	254804051
53	NC_013016	ATTG	2	8	21945	21952	25 %	50 %	25 %	0 %	254804052
54	NC_013016	TAAT	2	8	22334	22341	50 %	50 %	0 %	0 %	254804052
55	NC_013016	CAAT	2	8	22676	22683	50 %	25 %	0 %	25 %	254804052
56	NC_013016	TTGG	2	8	22726	22733	0 %	50 %	50 %	0 %	254804052
57	NC_013016	ATTT	2	8	22736	22743	25 %	75 %	0 %	0 %	254804052
58	NC_013016	GATT	2	8	23099	23106	25 %	50 %	25 %	0 %	254804053
59	NC_013016	TGAA	2	8	23284	23291	50 %	25 %	25 %	0 %	254804053
60	NC_013016	TGAA	2	8	23450	23457	50 %	25 %	25 %	0 %	254804053
61	NC_013016	TTGA	2	8	24144	24151	25 %	50 %	25 %	0 %	254804055
62	NC_013016	CCGA	2	8	25404	25411	25 %	0 %	25 %	50 %	254804056
63	NC_013016	GCCC	2	8	25589	25596	0 %	0 %	25 %	75 %	254804056
64	NC_013016	CGGA	2	8	25770	25777	25 %	0 %	50 %	25 %	254804056
65	NC_013016	GGCA	2	8	25833	25840	25 %	0 %	50 %	25 %	254804056
66	NC_013016	TGAA	2	8	25904	25911	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013016	GTTT	2	8	26176	26183	0 %	75 %	25 %	0 %	254804057
68	NC_013016	AGAA	2	8	26982	26989	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013016	ATTT	2	8	27195	27202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013016	ATCA	2	8	28919	28926	50 %	25 %	0 %	25 %	254804061
71	NC_013016	GCCC	2	8	29368	29375	0 %	0 %	25 %	75 %	254804061
72	NC_013016	TTTG	2	8	29622	29629	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013016	AATC	2	8	30065	30072	50 %	25 %	0 %	25 %	254804063
74	NC_013016	CCGC	2	8	30131	30138	0 %	0 %	25 %	75 %	254804063
75	NC_013016	AAAG	2	8	30616	30623	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013016	TTGC	2	8	30909	30916	0 %	50 %	25 %	25 %	254804064
77	NC_013016	GAAA	2	8	31049	31056	75 %	0 %	25 %	0 %	254804064
78	NC_013016	TCAA	2	8	31333	31340	50 %	25 %	0 %	25 %	254804064
79	NC_013016	GGCA	2	8	31407	31414	25 %	0 %	50 %	25 %	254804064
80	NC_013016	AAGA	2	8	31947	31954	75 %	0 %	25 %	0 %	254804065
81	NC_013016	GCGG	2	8	32265	32272	0 %	0 %	75 %	25 %	254804065
82	NC_013016	AGCC	2	8	32933	32940	25 %	0 %	25 %	50 %	254804065
83	NC_013016	TTTA	2	8	33448	33455	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013016	TCAG	2	8	33732	33739	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_013016	ACCG	2	8	34749	34756	25 %	0 %	25 %	50 %	254804066
86	NC_013016	TCGG	2	8	35070	35077	0 %	25 %	50 %	25 %	254804066
87	NC_013016	GACG	2	8	37183	37190	25 %	0 %	50 %	25 %	254804067
88	NC_013016	ACCG	2	8	37381	37388	25 %	0 %	25 %	50 %	254804067
89	NC_013016	CCTG	2	8	37447	37454	0 %	25 %	25 %	50 %	254804067
90	NC_013016	GACG	2	8	37762	37769	25 %	0 %	50 %	25 %	254804067
91	NC_013016	TGCC	2	8	38275	38282	0 %	25 %	25 %	50 %	254804067
92	NC_013016	TGCC	2	8	39021	39028	0 %	25 %	25 %	50 %	254804067
93	NC_013016	CCGT	2	8	39215	39222	0 %	25 %	25 %	50 %	254804067
94	NC_013016	GACG	2	8	39430	39437	25 %	0 %	50 %	25 %	254804067
95	NC_013016	GACG	2	8	39492	39499	25 %	0 %	50 %	25 %	254804067
96	NC_013016	CGAG	2	8	39546	39553	25 %	0 %	50 %	25 %	254804067
97	NC_013016	CCGA	2	8	39875	39882	25 %	0 %	25 %	50 %	254804067
98	NC_013016	GTTT	2	8	39989	39996	0 %	75 %	25 %	0 %	254804067
99	NC_013016	CAGG	2	8	40056	40063	25 %	0 %	50 %	25 %	254804067
100	NC_013016	AGCC	2	8	40367	40374	25 %	0 %	25 %	50 %	254804067
101	NC_013016	GACA	2	8	40399	40406	50 %	0 %	25 %	25 %	254804067
102	NC_013016	TCGG	2	8	40496	40503	0 %	25 %	50 %	25 %	254804067
103	NC_013016	GGCT	2	8	41366	41373	0 %	25 %	50 %	25 %	254804068
104	NC_013016	CTGT	2	8	42153	42160	0 %	50 %	25 %	25 %	254804068
105	NC_013016	TGCG	2	8	42361	42368	0 %	25 %	50 %	25 %	254804068
106	NC_013016	GAAA	2	8	42369	42376	75 %	0 %	25 %	0 %	254804068
107	NC_013016	CGGT	2	8	42399	42406	0 %	25 %	50 %	25 %	254804068
108	NC_013016	TAAA	2	8	42659	42666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013016	TATT	2	8	43025	43032	25 %	75 %	0 %	0 %	254804069
110	NC_013016	GGCG	2	8	43176	43183	0 %	0 %	75 %	25 %	254804069
111	NC_013016	CCTG	2	8	43601	43608	0 %	25 %	25 %	50 %	254804069
112	NC_013016	GGCG	2	8	43878	43885	0 %	0 %	75 %	25 %	254804069
113	NC_013016	GAAA	2	8	44343	44350	75 %	0 %	25 %	0 %	254804070
114	NC_013016	ACAG	2	8	44539	44546	50 %	0 %	25 %	25 %	254804070
115	NC_013016	AACC	2	8	44638	44645	50 %	0 %	0 %	50 %	254804070
116	NC_013016	TTGA	2	8	44848	44855	25 %	50 %	25 %	0 %	254804070
117	NC_013016	AAAG	2	8	45039	45046	75 %	0 %	25 %	0 %	254804070
118	NC_013016	AATA	2	8	45052	45059	75 %	25 %	0 %	0 %	254804070
119	NC_013016	TGCT	2	8	45323	45330	0 %	50 %	25 %	25 %	254804070
120	NC_013016	GTTT	2	8	46061	46068	0 %	75 %	25 %	0 %	254804072
121	NC_013016	AATA	2	8	46310	46317	75 %	25 %	0 %	0 %	254804073
122	NC_013016	GTGG	2	8	46974	46981	0 %	25 %	75 %	0 %	254804073
123	NC_013016	GGCG	2	8	47372	47379	0 %	0 %	75 %	25 %	254804073
124	NC_013016	CTCC	2	8	47882	47889	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
125	NC_013016	AAGC	2	8	49841	49848	50 %	0 %	25 %	25 %	254804075
126	NC_013016	TTGG	2	8	50286	50293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013016	ATCA	2	8	50583	50590	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_013016	CAGG	2	8	51008	51015	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013016	CAAT	2	8	51662	51669	50 %	25 %	0 %	25 %	254804076
130	NC_013016	TTCA	2	8	51730	51737	25 %	50 %	0 %	25 %	254804076
131	NC_013016	TGCT	2	8	51783	51790	0 %	50 %	25 %	25 %	254804077
132	NC_013016	CCCA	2	8	51933	51940	25 %	0 %	0 %	75 %	254804077
133	NC_013016	AAAG	2	8	52053	52060	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013016	ATTA	2	8	52201	52208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013016	ATAA	2	8	52798	52805	75 %	25 %	0 %	0 %	254804079
136	NC_013016	TTAT	2	8	52883	52890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013016	GGGC	2	8	53516	53523	0 %	0 %	75 %	25 %	254804080
138	NC_013016	CTGT	2	8	53828	53835	0 %	50 %	25 %	25 %	254804080
139	NC_013016	ATCC	2	8	54153	54160	25 %	25 %	0 %	50 %	254804080
140	NC_013016	GGAT	2	8	54164	54171	25 %	25 %	50 %	0 %	254804080
141	NC_013016	GACC	2	8	54360	54367	25 %	0 %	25 %	50 %	254804080
142	NC_013016	AACA	2	8	55108	55115	75 %	0 %	0 %	25 %	254804082
143	NC_013016	TAAA	2	8	55705	55712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_013016	CATT	2	8	95105	95112	25 %	50 %	0 %	25 %	254804126
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280	NC_013016	AGTG	2	8	104566	104573	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
281	NC_013016	GGGA	2	8	104780	104787	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
282	NC_013016	GAAA	2	8	105428	105435	75 %	0 %	25 %	0 %	254804135
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