MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis alpha14 chromosome

Total Repeats: 1248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013016	CTGA	2	8	21	28	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013016	GCAG	2	8	11614	11621	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013016	AACA	2	8	18370	18377	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013016	TGAA	2	8	20988	20995	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013016	TGAA	2	8	25904	25911	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013016	AGAA	2	8	26982	26989	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013016	ATTT	2	8	27195	27202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013016	TTTG	2	8	29622	29629	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013016	AAAG	2	8	30616	30623	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013016	TTTA	2	8	33448	33455	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013016	TCAG	2	8	33732	33739	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013016	TAAA	2	8	42659	42666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013016	CTCC	2	8	47882	47889	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_013016	TTGG	2	8	50286	50293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013016	ATCA	2	8	50583	50590	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013016	CAGG	2	8	51008	51015	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013016	AAAG	2	8	52053	52060	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013016	ATTA	2	8	52201	52208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013016	TTAT	2	8	52883	52890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013016	TAAA	2	8	55705	55712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013016	CTAT	2	8	55719	55726	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013016	GCTT	2	8	55905	55912	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013016	GGGC	2	8	55959	55966	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013016	CTTG	2	8	56768	56775	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013016	CTTT	2	8	60880	60887	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013016	ATAA	2	8	64595	64602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013016	GGCG	2	8	64638	64645	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013016	TTTC	2	8	67540	67547	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013016	TTGT	2	8	67556	67563	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013016	TGCC	2	8	68392	68399	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013016	CGGA	2	8	71609	71616	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013016	GCCC	2	8	72039	72046	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_013016	GGTT	2	8	72257	72264	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013016	TTTG	2	8	72366	72373	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013016	ACTT	2	8	75756	75763	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013016	TATG	2	8	80458	80465	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013016	GTTT	2	8	82148	82155	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013016	AAAT	2	8	82173	82180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013016	AAAT	2	8	82266	82273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013016	CAAT	2	8	82394	82401	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013016	TTGA	2	8	82502	82509	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013016	TCCG	2	8	85126	85133	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013016	TCCG	2	8	85136	85143	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013016	GGCG	2	8	85173	85180	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013016	ATGT	2	8	86118	86125	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013016	ACGG	2	8	86190	86197	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013016	ACGG	2	8	86517	86524	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013016	GTTG	2	8	86629	86636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013016	CCGG	2	8	86664	86671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013016	CCGG	2	8	88201	88208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013016	AACC	2	8	96453	96460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013016	CGCC	2	8	96679	96686	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_013016	TATC	2	8	102639	102646	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013016	TGAT	2	8	103725	103732	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013016	CTGG	2	8	103969	103976	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013016	ACAA	2	8	104217	104224	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013016	AGTG	2	8	104566	104573	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013016	GGGA	2	8	104780	104787	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013016	TGCC	2	8	109716	109723	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013016	AACA	2	8	109933	109940	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013016	GGTT	2	8	111864	111871	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013016	GTTT	2	8	112670	112677	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013016	ACCG	2	8	113593	113600	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_013016	GGAT	2	8	122565	122572	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013016	CGAA	2	8	122944	122951	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013016	GGAT	2	8	123046	123053	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013016	GCCG	2	8	124383	124390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013016	TTTC	2	8	124676	124683	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013016	ATGG	2	8	126965	126972	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013016	CGGG	2	8	127333	127340	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013016	CGGG	2	8	127442	127449	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_013016	TGCC	2	8	127562	127569	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013016	GGGA	2	8	131132	131139	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013016	GCAC	2	8	140463	140470	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013016	AATT	2	8	141819	141826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013016	AGAC	2	8	142076	142083	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013016	GCTT	2	8	142234	142241	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_013016	TGGT	2	8	142401	142408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013016	GTAG	2	8	143586	143593	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013016	AGAA	2	8	143698	143705	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013016	GTTT	2	8	144134	144141	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013016	AAAC	2	8	144191	144198	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013016	GCGA	2	8	144607	144614	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_013016	AAAC	2	8	145147	145154	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_013016	GACA	2	8	145302	145309	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013016	AAAG	2	8	145444	145451	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013016	ACTG	2	8	147284	147291	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013016	ATCG	2	8	148511	148518	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_013016	ATTG	2	8	148666	148673	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013016	GTAG	2	8	149247	149254	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013016	AGTT	2	8	149523	149530	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013016	TCGG	2	8	150859	150866	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013016	ATTG	2	8	151999	152006	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013016	GTCG	2	8	156039	156046	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_013016	GCAG	2	8	157697	157704	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_013016	TATG	2	8	162102	162109	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013016	TCAG	2	8	165819	165826	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013016	CCGC	2	8	168291	168298	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_013016	TTTA	2	8	173251	173258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013016	TTGT	2	8	178248	178255	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013016	GGGC	2	8	180151	180158	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_013016	CGAA	2	8	186729	186736	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_013016	AACG	2	8	187264	187271	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_013016	TGAT	2	8	188139	188146	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013016	CTGG	2	8	188383	188390	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013016	ACAA	2	8	188631	188638	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013016	AGTG	2	8	188980	188987	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013016	GGGA	2	8	189173	189180	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013016	CAAA	2	8	189201	189208	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_013016	GCCC	2	8	191650	191657	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
111	NC_013016	AGAA	2	8	191827	191834	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013016	ATCC	2	8	191892	191899	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013016	ACGG	2	8	192085	192092	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_013016	ATCG	2	8	192336	192343	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013016	GTTT	2	8	192558	192565	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013016	TTTG	2	8	196351	196358	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013016	TTAC	2	8	196667	196674	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_013016	TTAA	2	8	196702	196709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013016	TTCT	2	8	197016	197023	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_013016	GTTT	2	8	197097	197104	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013016	TTAT	2	8	197118	197125	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013016	TGGT	2	8	197132	197139	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013016	TTTA	2	8	201134	201141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013016	AAGC	2	8	201875	201882	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_013016	CCGG	2	8	201975	201982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_013016	GTTT	2	8	207681	207688	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013016	CGGA	2	8	208391	208398	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_013016	ATTT	2	8	210515	210522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013016	ATTT	2	8	210791	210798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013016	GGAT	2	8	210938	210945	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013016	GGAT	2	8	211311	211318	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013016	CTGT	2	8	219559	219566	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_013016	GCAG	2	8	219735	219742	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_013016	CTGT	2	8	220168	220175	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_013016	GGAT	2	8	220393	220400	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013016	GTTT	2	8	221008	221015	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013016	TCTT	2	8	221846	221853	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_013016	TGTA	2	8	224085	224092	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013016	AAAT	2	8	224129	224136	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013016	CCGT	2	8	225225	225232	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013016	CCGT	3	12	225293	225304	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_013016	TGCC	2	8	230740	230747	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_013016	CGCC	2	8	230821	230828	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
144	NC_013016	CGGA	2	8	230876	230883	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_013016	CCTC	2	8	231215	231222	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
146	NC_013016	CGGG	2	8	236976	236983	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013016	TTTG	2	8	240933	240940	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013016	TATT	2	8	244000	244007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013016	CCGA	2	8	244035	244042	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_013016	CAAA	2	8	244090	244097	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_013016	GGCA	2	8	251315	251322	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_013016	GTCT	2	8	251554	251561	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_013016	CCGT	2	8	252580	252587	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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158	NC_013016	CAAT	2	8	264348	264355	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
159	NC_013016	TGCG	2	8	265241	265248	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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161	NC_013016	CTGG	2	8	265783	265790	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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172	NC_013016	ATAA	2	8	276873	276880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_013016	ATGA	2	8	278181	278188	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_013016	GGAT	2	8	285440	285447	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_013016	GGCA	2	8	287878	287885	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
180	NC_013016	CTTT	2	8	293088	293095	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
181	NC_013016	TTTA	2	8	293259	293266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_013016	CTTG	2	8	293542	293549	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
183	NC_013016	TTAT	2	8	293974	293981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_013016	TTAT	2	8	293998	294005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_013016	ATTG	2	8	302396	302403	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_013016	CTTC	2	8	303734	303741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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221	NC_013016	CTTT	2	8	364317	364324	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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262	NC_013016	CCCG	2	8	470881	470888	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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296	NC_013016	TGTT	2	8	531539	531546	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
297	NC_013016	CGGT	2	8	534224	534231	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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497	NC_013016	AGTG	2	8	913521	913528	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
498	NC_013016	GGGA	2	8	913725	913732	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
499	NC_013016	CAAG	2	8	914558	914565	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
500	NC_013016	ATTG	2	8	914644	914651	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

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