MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Neisseria meningitidis alpha14 chromosome

Total Repeats: 26121

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013016	ATG	3	9	784	792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804029
2	NC_013016	GGT	2	6	807	812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254804029
3	NC_013016	GAC	2	6	814	819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804029
4	NC_013016	AAC	2	6	827	832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804029
5	NC_013016	GTT	2	6	840	845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254804029
6	NC_013016	GAA	2	6	847	852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254804029
7	NC_013016	CGG	2	6	870	875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804029
8	NC_013016	CGG	2	6	901	906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804029
9	NC_013016	CGG	2	6	957	962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804029
10	NC_013016	GAA	2	6	964	969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254804029
11	NC_013016	GCC	2	6	1051	1056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804029
12	NC_013016	CGC	2	6	1061	1066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804029
13	NC_013016	ACG	2	6	1208	1213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804029
14	NC_013016	GGC	2	6	1306	1311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804029
15	NC_013016	TCG	2	6	1441	1446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804029
16	NC_013016	GGC	2	6	1507	1512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804029
17	NC_013016	GCT	2	6	1644	1649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804029
18	NC_013016	CAT	2	6	1665	1670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804029
19	NC_013016	GGT	2	6	1791	1796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254804029
20	NC_013016	ACT	2	6	1910	1915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804029
21	NC_013016	ATG	2	6	2101	2106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804030
22	NC_013016	GCT	2	6	2114	2119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804030
23	NC_013016	GCC	2	6	2271	2276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804030
24	NC_013016	GCT	2	6	2321	2326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804030
25	NC_013016	TGA	2	6	2491	2496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804030
26	NC_013016	CCG	2	6	2579	2584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804030
27	NC_013016	GCC	2	6	2598	2603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804030
28	NC_013016	GCG	2	6	2643	2648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804030
29	NC_013016	CAT	2	6	2705	2710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804030
30	NC_013016	GCA	2	6	2785	2790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804030
31	NC_013016	CTG	2	6	2826	2831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804030
32	NC_013016	GCG	2	6	2832	2837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804030
33	NC_013016	CAA	2	6	2841	2846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804030
34	NC_013016	GCT	2	6	2861	2866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804030
35	NC_013016	GTC	2	6	2868	2873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804030
36	NC_013016	GCG	2	6	2942	2947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804030
37	NC_013016	CGG	2	6	3047	3052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804030
38	NC_013016	GCG	2	6	3100	3105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804030
39	NC_013016	CGA	2	6	3109	3114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804030
40	NC_013016	GCG	2	6	3174	3179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804030
41	NC_013016	CGG	2	6	3193	3198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804030
42	NC_013016	CGG	2	6	3453	3458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804031
43	NC_013016	CTG	2	6	3583	3588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804031
44	NC_013016	GGC	2	6	3609	3614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804031
45	NC_013016	CGT	2	6	3723	3728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804031
46	NC_013016	CGT	2	6	3780	3785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804031
47	NC_013016	TGC	2	6	3797	3802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804031
48	NC_013016	GTT	2	6	3908	3913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254804032
49	NC_013016	GAA	2	6	3971	3976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254804032
50	NC_013016	AAG	2	6	4003	4008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254804032
51	NC_013016	ATA	2	6	4168	4173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254804032
52	NC_013016	TGA	2	6	4186	4191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804032
53	NC_013016	TGC	2	6	4234	4239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804032
54	NC_013016	TCG	2	6	4285	4290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804032
55	NC_013016	ATG	2	6	4365	4370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804032
56	NC_013016	CAG	2	6	4406	4411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804032
57	NC_013016	GCT	2	6	4412	4417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804032
58	NC_013016	CGC	2	6	4504	4509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804032
59	NC_013016	CCG	2	6	4570	4575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804032
60	NC_013016	ACC	2	6	4587	4592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254804032
61	NC_013016	CTG	2	6	4656	4661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804032
62	NC_013016	GGA	2	6	4670	4675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254804032
63	NC_013016	GCT	2	6	5381	5386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804033
64	NC_013016	CGG	2	6	5441	5446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804033
65	NC_013016	GGC	2	6	5559	5564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804033
66	NC_013016	CGG	2	6	5705	5710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804033
67	NC_013016	CTG	2	6	5721	5726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804033
68	NC_013016	GGC	2	6	5729	5734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804033
69	NC_013016	ACG	2	6	5751	5756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804033
70	NC_013016	GGT	2	6	5786	5791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254804033
71	NC_013016	CGT	2	6	5897	5902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804033
72	NC_013016	CGG	2	6	5951	5956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804033
73	NC_013016	GGT	2	6	5960	5965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254804033
74	NC_013016	GCC	2	6	5976	5981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804033
75	NC_013016	GTG	2	6	5997	6002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254804033
76	NC_013016	GTC	2	6	6102	6107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804033
77	NC_013016	GTG	2	6	6180	6185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254804033
78	NC_013016	GGC	2	6	6356	6361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804033
79	NC_013016	CGA	2	6	6646	6651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804034
80	NC_013016	TGA	2	6	6717	6722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804034
81	NC_013016	GAC	2	6	6764	6769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804034
82	NC_013016	TGC	2	6	6876	6881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804034
83	NC_013016	CAA	2	6	6895	6900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804034
84	NC_013016	GAA	2	6	6907	6912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254804034
85	NC_013016	CTT	2	6	6942	6947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254804034
86	NC_013016	GCA	2	6	7125	7130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804034
87	NC_013016	CCA	2	6	7137	7142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254804034
88	NC_013016	TCG	2	6	7188	7193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804034
89	NC_013016	GCG	2	6	7194	7199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804034
90	NC_013016	TGG	2	6	7266	7271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254804034
91	NC_013016	GGC	2	6	7300	7305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804034
92	NC_013016	GTC	2	6	7337	7342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804034
93	NC_013016	TGA	2	6	7363	7368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804034
94	NC_013016	GGT	2	6	7375	7380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254804034
95	NC_013016	GAT	2	6	7411	7416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804034
96	NC_013016	GCC	2	6	7439	7444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804034
97	NC_013016	GCC	2	6	7466	7471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804034
98	NC_013016	GGC	2	6	7600	7605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804034
99	NC_013016	CGG	3	9	7651	7659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804034
100	NC_013016	CCG	2	6	7817	7822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804035
101	NC_013016	GGC	2	6	7827	7832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804035
102	NC_013016	TGA	2	6	7935	7940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804035
103	NC_013016	GTG	2	6	8168	8173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254804036
104	NC_013016	AGA	2	6	8241	8246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254804036
105	NC_013016	CGG	3	9	8340	8348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804036
106	NC_013016	GCG	2	6	8386	8391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804036
107	NC_013016	ACG	2	6	8397	8402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804036
108	NC_013016	TTC	2	6	8737	8742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254804036
109	NC_013016	TCT	2	6	8750	8755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254804036
110	NC_013016	TGT	2	6	8772	8777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254804036
111	NC_013016	CAG	2	6	8797	8802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804036
112	NC_013016	GCG	3	9	8831	8839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804036
113	NC_013016	GCG	2	6	8862	8867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804036
114	NC_013016	GAT	2	6	9040	9045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804036
115	NC_013016	GTC	2	6	9056	9061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804037
116	NC_013016	GCG	2	6	9118	9123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804037
117	NC_013016	GTT	2	6	9133	9138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254804037
118	NC_013016	ATA	2	6	9169	9174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254804037
119	NC_013016	TCG	2	6	9211	9216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804037
120	NC_013016	CAG	2	6	9222	9227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804037
121	NC_013016	ACG	2	6	9241	9246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804037
122	NC_013016	GTT	3	9	9266	9274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254804037
123	NC_013016	CCG	2	6	9277	9282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804037
124	NC_013016	TTC	2	6	9351	9356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254804037
125	NC_013016	GCG	2	6	9365	9370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804037
126	NC_013016	TTG	2	6	9619	9624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254804037
127	NC_013016	AGG	2	6	9699	9704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254804038
128	NC_013016	GGC	2	6	9719	9724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804038
129	NC_013016	CGA	2	6	9992	9997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804039
130	NC_013016	GGC	2	6	10338	10343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804039
131	NC_013016	GCA	2	6	10534	10539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804040
132	NC_013016	GCC	2	6	10548	10553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804040
133	NC_013016	GAA	2	6	10566	10571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254804040
134	NC_013016	TGC	2	6	10580	10585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804040
135	NC_013016	CGC	2	6	10609	10614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804040
136	NC_013016	CAA	2	6	10643	10648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804040
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138	NC_013016	GAT	2	6	10689	10694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804040
139	NC_013016	GCT	2	6	10742	10747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804040
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151	NC_013016	CAT	2	6	11791	11796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804042
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153	NC_013016	ATC	2	6	11863	11868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804042
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160	NC_013016	AAG	2	6	12044	12049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254804042
161	NC_013016	CCG	2	6	12066	12071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804042
162	NC_013016	CGT	2	6	12126	12131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804042
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240	NC_013016	TTC	2	6	17998	18003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254804046
241	NC_013016	TGA	2	6	18057	18062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804046
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248	NC_013016	CAT	2	6	19369	19374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804049
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250	NC_013016	TTG	2	6	19489	19494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254804049
251	NC_013016	ATT	2	6	19523	19528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254804049
252	NC_013016	CGG	2	6	19653	19658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804049
253	NC_013016	ATT	2	6	19670	19675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254804049
254	NC_013016	AAC	2	6	19683	19688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804049
255	NC_013016	GGC	2	6	19708	19713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804049
256	NC_013016	TTC	2	6	19794	19799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254804049
257	NC_013016	TAA	2	6	19845	19850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254804049
258	NC_013016	TAA	2	6	19852	19857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254804049
259	NC_013016	TGA	2	6	20059	20064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804050
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261	NC_013016	TAT	2	6	20424	20429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254804050
262	NC_013016	TGC	2	6	20491	20496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804050
263	NC_013016	CTG	2	6	20637	20642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804050
264	NC_013016	TGC	2	6	20680	20685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804050
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274	NC_013016	GGC	2	6	21662	21667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804051
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278	NC_013016	CTG	2	6	21968	21973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804052
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284	NC_013016	GGC	2	6	22308	22313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804052
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287	NC_013016	GCA	2	6	22531	22536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804052
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375	NC_013016	CGC	4	12	30896	30907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804064
376	NC_013016	CGG	2	6	30928	30933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804064
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