MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 plasmid pO157

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013010	GATGG	2	10	1418	1427	20 %	20 %	60 %	0 %	254667449
2	NC_013010	GCTGA	2	10	1771	1780	20 %	20 %	40 %	20 %	254667449
3	NC_013010	GTTTT	2	10	2998	3007	0 %	80 %	20 %	0 %	254667450
4	NC_013010	GTCAG	2	10	6810	6819	20 %	20 %	40 %	20 %	254667452
5	NC_013010	CCCTT	2	10	7741	7750	0 %	40 %	0 %	60 %	254667453
6	NC_013010	GAGGT	2	10	9243	9252	20 %	20 %	60 %	0 %	254667455
7	NC_013010	GAGGT	2	10	11698	11707	20 %	20 %	60 %	0 %	254667459
8	NC_013010	AGTGG	2	10	12658	12667	20 %	20 %	60 %	0 %	254667460
9	NC_013010	CGCTT	2	10	12985	12994	0 %	40 %	20 %	40 %	254667460
10	NC_013010	TTTCG	2	10	13661	13670	0 %	60 %	20 %	20 %	254667461
11	NC_013010	GGTTA	2	10	13686	13695	20 %	40 %	40 %	0 %	254667461
12	NC_013010	TATAA	2	10	16081	16090	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013010	TGTTA	2	10	20747	20756	20 %	60 %	20 %	0 %	254667467
14	NC_013010	CAGGT	2	10	21090	21099	20 %	20 %	40 %	20 %	254667467
15	NC_013010	AGAAC	2	10	21798	21807	60 %	0 %	20 %	20 %	254667467
16	NC_013010	TCTCT	2	10	22175	22184	0 %	60 %	0 %	40 %	254667468
17	NC_013010	CAGAA	2	10	22562	22571	60 %	0 %	20 %	20 %	254667468
18	NC_013010	AATGG	2	10	23519	23528	40 %	20 %	40 %	0 %	254667469
19	NC_013010	CACAC	2	10	25020	25029	40 %	0 %	0 %	60 %	254667472
20	NC_013010	ACATA	2	10	25283	25292	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_013010	CAGCT	2	10	25399	25408	20 %	20 %	20 %	40 %	254667473
22	NC_013010	CAGCA	2	10	28507	28516	40 %	0 %	20 %	40 %	254667479
23	NC_013010	GGCGT	2	10	37881	37890	0 %	20 %	60 %	20 %	254667490
24	NC_013010	CGCGG	2	10	38685	38694	0 %	0 %	60 %	40 %	254667491
25	NC_013010	ACGGG	2	10	38737	38746	20 %	0 %	60 %	20 %	254667491
26	NC_013010	GCTGG	2	10	39383	39392	0 %	20 %	60 %	20 %	254667492
27	NC_013010	CCGCC	2	10	41056	41065	0 %	0 %	20 %	80 %	254667495
28	NC_013010	GGCAC	2	10	41526	41535	20 %	0 %	40 %	40 %	254667496
29	NC_013010	ACCGT	2	10	41816	41825	20 %	20 %	20 %	40 %	254667497
30	NC_013010	TGTAC	2	10	42051	42060	20 %	40 %	20 %	20 %	254667498
31	NC_013010	GGAAG	2	10	42727	42736	40 %	0 %	60 %	0 %	254667500
32	NC_013010	GGCGG	2	10	42917	42926	0 %	0 %	80 %	20 %	254667500
33	NC_013010	CCGGG	2	10	44139	44148	0 %	0 %	60 %	40 %	254667504
34	NC_013010	GGCGG	2	10	46204	46213	0 %	0 %	80 %	20 %	254667506
35	NC_013010	AAGTG	2	10	48261	48270	40 %	20 %	40 %	0 %	254667509
36	NC_013010	CCGCC	2	10	49525	49534	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
37	NC_013010	ACTGA	2	10	49573	49582	40 %	20 %	20 %	20 %	254667510
38	NC_013010	TTACG	2	10	52489	52498	20 %	40 %	20 %	20 %	254667513
39	NC_013010	AAGGT	2	10	54177	54186	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013010	TCTAC	2	10	55974	55983	20 %	40 %	0 %	40 %	254667518
41	NC_013010	GACTT	2	10	56830	56839	20 %	40 %	20 %	20 %	254667518
42	NC_013010	ATCAG	2	10	57062	57071	40 %	20 %	20 %	20 %	254667518
43	NC_013010	AAACG	2	10	58806	58815	60 %	0 %	20 %	20 %	254667518
44	NC_013010	TGCAT	2	10	59732	59741	20 %	40 %	20 %	20 %	254667518
45	NC_013010	GAAAG	2	10	59888	59897	60 %	0 %	40 %	0 %	254667518
46	NC_013010	AAAAT	2	10	60580	60589	80 %	20 %	0 %	0 %	254667518
47	NC_013010	CATTC	2	10	60768	60777	20 %	40 %	0 %	40 %	254667518
48	NC_013010	AATTA	2	10	61328	61337	60 %	40 %	0 %	0 %	254667518
49	NC_013010	ATATT	2	10	62647	62656	40 %	60 %	0 %	0 %	254667518
50	NC_013010	GATGT	2	10	62740	62749	20 %	40 %	40 %	0 %	254667518
51	NC_013010	TTTAT	2	10	62972	62981	20 %	80 %	0 %	0 %	254667518
52	NC_013010	TAAAT	2	10	63413	63422	60 %	40 %	0 %	0 %	254667518
53	NC_013010	AGAAA	2	10	63425	63434	80 %	0 %	20 %	0 %	254667518
54	NC_013010	ATTGT	2	10	64299	64308	20 %	60 %	20 %	0 %	254667518
55	NC_013010	TGATT	2	10	64649	64658	20 %	60 %	20 %	0 %	254667518
56	NC_013010	CGCCC	2	10	66217	66226	0 %	0 %	20 %	80 %	254667521
57	NC_013010	ACCGG	2	10	66486	66495	20 %	0 %	40 %	40 %	254667521
58	NC_013010	ACCTG	2	10	67095	67104	20 %	20 %	20 %	40 %	254667521
59	NC_013010	CTGGT	2	10	67433	67442	0 %	40 %	40 %	20 %	254667522
60	NC_013010	GAACG	2	10	67884	67893	40 %	0 %	40 %	20 %	254667522
61	NC_013010	CCGGG	2	10	70593	70602	0 %	0 %	60 %	40 %	254667526
62	NC_013010	CCTGT	2	10	73362	73371	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_013010	GCCCC	2	10	73518	73527	0 %	0 %	20 %	80 %	254667532
64	NC_013010	GGGTT	2	10	74045	74054	0 %	40 %	60 %	0 %	254667533
65	NC_013010	GAAGA	2	10	77039	77048	60 %	0 %	40 %	0 %	254667540
66	NC_013010	GTCTT	2	10	81466	81475	0 %	60 %	20 %	20 %	254667544
67	NC_013010	AAAAC	2	10	82190	82199	80 %	0 %	0 %	20 %	254667544
68	NC_013010	ATGCG	2	10	83089	83098	20 %	20 %	40 %	20 %	254667544
69	NC_013010	TGGTA	2	10	88090	88099	20 %	40 %	40 %	0 %	254667551
70	NC_013010	GTTCC	2	10	89929	89938	0 %	40 %	20 %	40 %	254667552
71	NC_013010	GTTTT	2	10	94272	94281	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.