Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 plasmid pO157
Total Repeats: 65
S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Length | Start | End | A% | T% | G% | C% | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_013010 | GATGG | 2 | 10 | 1418 | 1427 | 20 % | 20 % | 60 % | 0 % | 254667449 |
2 | NC_013010 | GCTGA | 2 | 10 | 1771 | 1780 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 254667449 |
3 | NC_013010 | GTTTT | 2 | 10 | 2998 | 3007 | 0 % | 80 % | 20 % | 0 % | 254667450 |
4 | NC_013010 | GTCAG | 2 | 10 | 6810 | 6819 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 254667452 |
5 | NC_013010 | CCCTT | 2 | 10 | 7741 | 7750 | 0 % | 40 % | 0 % | 60 % | 254667453 |
6 | NC_013010 | GAGGT | 2 | 10 | 9243 | 9252 | 20 % | 20 % | 60 % | 0 % | 254667455 |
7 | NC_013010 | GAGGT | 2 | 10 | 11698 | 11707 | 20 % | 20 % | 60 % | 0 % | 254667459 |
8 | NC_013010 | AGTGG | 2 | 10 | 12658 | 12667 | 20 % | 20 % | 60 % | 0 % | 254667460 |
9 | NC_013010 | CGCTT | 2 | 10 | 12985 | 12994 | 0 % | 40 % | 20 % | 40 % | 254667460 |
10 | NC_013010 | TTTCG | 2 | 10 | 13661 | 13670 | 0 % | 60 % | 20 % | 20 % | 254667461 |
11 | NC_013010 | GGTTA | 2 | 10 | 13686 | 13695 | 20 % | 40 % | 40 % | 0 % | 254667461 |
12 | NC_013010 | TGTTA | 2 | 10 | 20747 | 20756 | 20 % | 60 % | 20 % | 0 % | 254667467 |
13 | NC_013010 | CAGGT | 2 | 10 | 21090 | 21099 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 254667467 |
14 | NC_013010 | AGAAC | 2 | 10 | 21798 | 21807 | 60 % | 0 % | 20 % | 20 % | 254667467 |
15 | NC_013010 | TCTCT | 2 | 10 | 22175 | 22184 | 0 % | 60 % | 0 % | 40 % | 254667468 |
16 | NC_013010 | CAGAA | 2 | 10 | 22562 | 22571 | 60 % | 0 % | 20 % | 20 % | 254667468 |
17 | NC_013010 | AATGG | 2 | 10 | 23519 | 23528 | 40 % | 20 % | 40 % | 0 % | 254667469 |
18 | NC_013010 | CACAC | 2 | 10 | 25020 | 25029 | 40 % | 0 % | 0 % | 60 % | 254667472 |
19 | NC_013010 | CAGCT | 2 | 10 | 25399 | 25408 | 20 % | 20 % | 20 % | 40 % | 254667473 |
20 | NC_013010 | CAGCA | 2 | 10 | 28507 | 28516 | 40 % | 0 % | 20 % | 40 % | 254667479 |
21 | NC_013010 | GGCGT | 2 | 10 | 37881 | 37890 | 0 % | 20 % | 60 % | 20 % | 254667490 |
22 | NC_013010 | CGCGG | 2 | 10 | 38685 | 38694 | 0 % | 0 % | 60 % | 40 % | 254667491 |
23 | NC_013010 | ACGGG | 2 | 10 | 38737 | 38746 | 20 % | 0 % | 60 % | 20 % | 254667491 |
24 | NC_013010 | GCTGG | 2 | 10 | 39383 | 39392 | 0 % | 20 % | 60 % | 20 % | 254667492 |
25 | NC_013010 | CCGCC | 2 | 10 | 41056 | 41065 | 0 % | 0 % | 20 % | 80 % | 254667495 |
26 | NC_013010 | GGCAC | 2 | 10 | 41526 | 41535 | 20 % | 0 % | 40 % | 40 % | 254667496 |
27 | NC_013010 | ACCGT | 2 | 10 | 41816 | 41825 | 20 % | 20 % | 20 % | 40 % | 254667497 |
28 | NC_013010 | TGTAC | 2 | 10 | 42051 | 42060 | 20 % | 40 % | 20 % | 20 % | 254667498 |
29 | NC_013010 | GGAAG | 2 | 10 | 42727 | 42736 | 40 % | 0 % | 60 % | 0 % | 254667500 |
30 | NC_013010 | GGCGG | 2 | 10 | 42917 | 42926 | 0 % | 0 % | 80 % | 20 % | 254667500 |
31 | NC_013010 | CCGGG | 2 | 10 | 44139 | 44148 | 0 % | 0 % | 60 % | 40 % | 254667504 |
32 | NC_013010 | GGCGG | 2 | 10 | 46204 | 46213 | 0 % | 0 % | 80 % | 20 % | 254667506 |
33 | NC_013010 | AAGTG | 2 | 10 | 48261 | 48270 | 40 % | 20 % | 40 % | 0 % | 254667509 |
34 | NC_013010 | ACTGA | 2 | 10 | 49573 | 49582 | 40 % | 20 % | 20 % | 20 % | 254667510 |
35 | NC_013010 | TTACG | 2 | 10 | 52489 | 52498 | 20 % | 40 % | 20 % | 20 % | 254667513 |
36 | NC_013010 | TCTAC | 2 | 10 | 55974 | 55983 | 20 % | 40 % | 0 % | 40 % | 254667518 |
37 | NC_013010 | GACTT | 2 | 10 | 56830 | 56839 | 20 % | 40 % | 20 % | 20 % | 254667518 |
38 | NC_013010 | ATCAG | 2 | 10 | 57062 | 57071 | 40 % | 20 % | 20 % | 20 % | 254667518 |
39 | NC_013010 | AAACG | 2 | 10 | 58806 | 58815 | 60 % | 0 % | 20 % | 20 % | 254667518 |
40 | NC_013010 | TGCAT | 2 | 10 | 59732 | 59741 | 20 % | 40 % | 20 % | 20 % | 254667518 |
41 | NC_013010 | GAAAG | 2 | 10 | 59888 | 59897 | 60 % | 0 % | 40 % | 0 % | 254667518 |
42 | NC_013010 | AAAAT | 2 | 10 | 60580 | 60589 | 80 % | 20 % | 0 % | 0 % | 254667518 |
43 | NC_013010 | CATTC | 2 | 10 | 60768 | 60777 | 20 % | 40 % | 0 % | 40 % | 254667518 |
44 | NC_013010 | AATTA | 2 | 10 | 61328 | 61337 | 60 % | 40 % | 0 % | 0 % | 254667518 |
45 | NC_013010 | ATATT | 2 | 10 | 62647 | 62656 | 40 % | 60 % | 0 % | 0 % | 254667518 |
46 | NC_013010 | GATGT | 2 | 10 | 62740 | 62749 | 20 % | 40 % | 40 % | 0 % | 254667518 |
47 | NC_013010 | TTTAT | 2 | 10 | 62972 | 62981 | 20 % | 80 % | 0 % | 0 % | 254667518 |
48 | NC_013010 | TAAAT | 2 | 10 | 63413 | 63422 | 60 % | 40 % | 0 % | 0 % | 254667518 |
49 | NC_013010 | AGAAA | 2 | 10 | 63425 | 63434 | 80 % | 0 % | 20 % | 0 % | 254667518 |
50 | NC_013010 | ATTGT | 2 | 10 | 64299 | 64308 | 20 % | 60 % | 20 % | 0 % | 254667518 |
51 | NC_013010 | TGATT | 2 | 10 | 64649 | 64658 | 20 % | 60 % | 20 % | 0 % | 254667518 |
52 | NC_013010 | CGCCC | 2 | 10 | 66217 | 66226 | 0 % | 0 % | 20 % | 80 % | 254667521 |
53 | NC_013010 | ACCGG | 2 | 10 | 66486 | 66495 | 20 % | 0 % | 40 % | 40 % | 254667521 |
54 | NC_013010 | ACCTG | 2 | 10 | 67095 | 67104 | 20 % | 20 % | 20 % | 40 % | 254667521 |
55 | NC_013010 | CTGGT | 2 | 10 | 67433 | 67442 | 0 % | 40 % | 40 % | 20 % | 254667522 |
56 | NC_013010 | GAACG | 2 | 10 | 67884 | 67893 | 40 % | 0 % | 40 % | 20 % | 254667522 |
57 | NC_013010 | CCGGG | 2 | 10 | 70593 | 70602 | 0 % | 0 % | 60 % | 40 % | 254667526 |
58 | NC_013010 | GCCCC | 2 | 10 | 73518 | 73527 | 0 % | 0 % | 20 % | 80 % | 254667532 |
59 | NC_013010 | GGGTT | 2 | 10 | 74045 | 74054 | 0 % | 40 % | 60 % | 0 % | 254667533 |
60 | NC_013010 | GAAGA | 2 | 10 | 77039 | 77048 | 60 % | 0 % | 40 % | 0 % | 254667540 |
61 | NC_013010 | GTCTT | 2 | 10 | 81466 | 81475 | 0 % | 60 % | 20 % | 20 % | 254667544 |
62 | NC_013010 | AAAAC | 2 | 10 | 82190 | 82199 | 80 % | 0 % | 0 % | 20 % | 254667544 |
63 | NC_013010 | ATGCG | 2 | 10 | 83089 | 83098 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 254667544 |
64 | NC_013010 | TGGTA | 2 | 10 | 88090 | 88099 | 20 % | 40 % | 40 % | 0 % | 254667551 |
65 | NC_013010 | GTTCC | 2 | 10 | 89929 | 89938 | 0 % | 40 % | 20 % | 40 % | 254667552 |