MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 plasmid pO157

Total Repeats: 240

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013010	ATGA	2	8	1	8	50 %	25 %	25 %	0 %	254667449
2	NC_013010	ATTT	2	8	112	119	25 %	75 %	0 %	0 %	254667449
3	NC_013010	GTCC	2	8	262	269	0 %	25 %	25 %	50 %	254667449
4	NC_013010	AAAC	2	8	465	472	75 %	0 %	0 %	25 %	254667449
5	NC_013010	CTGC	2	8	778	785	0 %	25 %	25 %	50 %	254667449
6	NC_013010	CAAA	2	8	1465	1472	75 %	0 %	0 %	25 %	254667449
7	NC_013010	GGCA	2	8	2378	2385	25 %	0 %	50 %	25 %	254667449
8	NC_013010	TTAT	2	8	2808	2815	25 %	75 %	0 %	0 %	254667450
9	NC_013010	ACAG	2	8	3169	3176	50 %	0 %	25 %	25 %	254667450
10	NC_013010	TTCT	2	8	3885	3892	0 %	75 %	0 %	25 %	254667451
11	NC_013010	GTAA	2	8	4047	4054	50 %	25 %	25 %	0 %	254667451
12	NC_013010	ACAG	2	8	5369	5376	50 %	0 %	25 %	25 %	254667451
13	NC_013010	TCAG	2	8	6504	6511	25 %	25 %	25 %	25 %	254667452
14	NC_013010	CACT	2	8	7272	7279	25 %	25 %	0 %	50 %	254667453
15	NC_013010	GAGG	2	8	9071	9078	25 %	0 %	75 %	0 %	254667455
16	NC_013010	CAGG	2	8	9274	9281	25 %	0 %	50 %	25 %	254667455
17	NC_013010	CGGA	2	8	9468	9475	25 %	0 %	50 %	25 %	254667456
18	NC_013010	GGGC	2	8	9609	9616	0 %	0 %	75 %	25 %	254667456
19	NC_013010	GCTG	2	8	10012	10019	0 %	25 %	50 %	25 %	254667457
20	NC_013010	TGAA	2	8	10313	10320	50 %	25 %	25 %	0 %	254667457
21	NC_013010	GCAG	2	8	10509	10516	25 %	0 %	50 %	25 %	254667458
22	NC_013010	ATTA	2	8	10640	10647	50 %	50 %	0 %	0 %	254667458
23	NC_013010	GATC	2	8	10765	10772	25 %	25 %	25 %	25 %	254667458
24	NC_013010	TCTG	2	8	10951	10958	0 %	50 %	25 %	25 %	254667458
25	NC_013010	TCAG	2	8	11205	11212	25 %	25 %	25 %	25 %	254667458
26	NC_013010	GGAG	2	8	11229	11236	25 %	0 %	75 %	0 %	254667458
27	NC_013010	GAGG	2	8	11278	11285	25 %	0 %	75 %	0 %	254667458
28	NC_013010	GACA	2	8	11574	11581	50 %	0 %	25 %	25 %	254667459
29	NC_013010	ACCC	2	8	12924	12931	25 %	0 %	0 %	75 %	254667460
30	NC_013010	GGCC	2	8	13242	13249	0 %	0 %	50 %	50 %	254667461
31	NC_013010	ATTC	2	8	13417	13424	25 %	50 %	0 %	25 %	254667461
32	NC_013010	TCTG	2	8	13635	13642	0 %	50 %	25 %	25 %	254667461
33	NC_013010	GGGA	2	8	13676	13683	25 %	0 %	75 %	0 %	254667461
34	NC_013010	AGCT	2	8	13707	13714	25 %	25 %	25 %	25 %	254667461
35	NC_013010	ATGG	2	8	13729	13736	25 %	25 %	50 %	0 %	254667461
36	NC_013010	GGCA	2	8	13740	13747	25 %	0 %	50 %	25 %	254667461
37	NC_013010	TCAG	2	8	13772	13779	25 %	25 %	25 %	25 %	254667461
38	NC_013010	CCCG	2	8	13830	13837	0 %	0 %	25 %	75 %	254667461
39	NC_013010	TCCA	2	8	14070	14077	25 %	25 %	0 %	50 %	254667462
40	NC_013010	GCAG	2	8	15448	15455	25 %	0 %	50 %	25 %	254667464
41	NC_013010	GAAA	2	8	16530	16537	75 %	0 %	25 %	0 %	254667465
42	NC_013010	GAAA	2	8	16781	16788	75 %	0 %	25 %	0 %	254667465
43	NC_013010	TAAA	2	8	16802	16809	75 %	25 %	0 %	0 %	254667466
44	NC_013010	TTCT	2	8	17495	17502	0 %	75 %	0 %	25 %	254667466
45	NC_013010	CTTT	2	8	17713	17720	0 %	75 %	0 %	25 %	254667466
46	NC_013010	GAGC	2	8	17743	17750	25 %	0 %	50 %	25 %	254667466
47	NC_013010	AATG	2	8	18040	18047	50 %	25 %	25 %	0 %	254667466
48	NC_013010	TGCT	2	8	18128	18135	0 %	50 %	25 %	25 %	254667466
49	NC_013010	AGAA	2	8	18423	18430	75 %	0 %	25 %	0 %	254667466
50	NC_013010	AACA	2	8	18562	18569	75 %	0 %	0 %	25 %	254667466
51	NC_013010	TATG	2	8	18756	18763	25 %	50 %	25 %	0 %	254667466
52	NC_013010	TTGC	2	8	19886	19893	0 %	50 %	25 %	25 %	254667467
53	NC_013010	TTGC	2	8	20543	20550	0 %	50 %	25 %	25 %	254667467
54	NC_013010	AATA	2	8	20857	20864	75 %	25 %	0 %	0 %	254667467
55	NC_013010	ATGG	2	8	21019	21026	25 %	25 %	50 %	0 %	254667467
56	NC_013010	TTCT	2	8	22428	22435	0 %	75 %	0 %	25 %	254667468
57	NC_013010	TAAA	2	8	22593	22600	75 %	25 %	0 %	0 %	254667468
58	NC_013010	AGGA	2	8	22662	22669	50 %	0 %	50 %	0 %	254667468
59	NC_013010	ATAC	2	8	22994	23001	50 %	25 %	0 %	25 %	254667468
60	NC_013010	GAAA	2	8	23273	23280	75 %	0 %	25 %	0 %	254667468
61	NC_013010	AAAC	2	8	23480	23487	75 %	0 %	0 %	25 %	254667469
62	NC_013010	CATC	2	8	24229	24236	25 %	25 %	0 %	50 %	254667471
63	NC_013010	AGTG	2	8	24645	24652	25 %	25 %	50 %	0 %	254667472
64	NC_013010	TGGA	2	8	24764	24771	25 %	25 %	50 %	0 %	254667472
65	NC_013010	GTGC	2	8	24805	24812	0 %	25 %	50 %	25 %	254667472
66	NC_013010	CGCC	2	8	24823	24830	0 %	0 %	25 %	75 %	254667472
67	NC_013010	CGGG	2	8	25191	25198	0 %	0 %	75 %	25 %	254667472
68	NC_013010	GACT	2	8	25607	25614	25 %	25 %	25 %	25 %	254667474
69	NC_013010	GAAT	2	8	26233	26240	50 %	25 %	25 %	0 %	254667474
70	NC_013010	CCCA	2	8	26245	26252	25 %	0 %	0 %	75 %	254667474
71	NC_013010	ACTG	2	8	26606	26613	25 %	25 %	25 %	25 %	254667475
72	NC_013010	CAGA	2	8	27162	27169	50 %	0 %	25 %	25 %	254667477
73	NC_013010	CTTC	2	8	27797	27804	0 %	50 %	0 %	50 %	254667478
74	NC_013010	GGCG	2	8	28160	28167	0 %	0 %	75 %	25 %	254667478
75	NC_013010	ATAC	2	8	28383	28390	50 %	25 %	0 %	25 %	254667479
76	NC_013010	CATA	2	8	28400	28407	50 %	25 %	0 %	25 %	254667479
77	NC_013010	TACA	2	8	28420	28427	50 %	25 %	0 %	25 %	254667479
78	NC_013010	CTCC	2	8	28480	28487	0 %	25 %	0 %	75 %	254667479
79	NC_013010	CCAC	2	8	29244	29251	25 %	0 %	0 %	75 %	254667481
80	NC_013010	ATAC	2	8	29424	29431	50 %	25 %	0 %	25 %	254667481
81	NC_013010	GTAA	2	8	29611	29618	50 %	25 %	25 %	0 %	254667481
82	NC_013010	CCAC	2	8	29625	29632	25 %	0 %	0 %	75 %	254667481
83	NC_013010	AGTG	2	8	30871	30878	25 %	25 %	50 %	0 %	254667484
84	NC_013010	CAGC	2	8	31123	31130	25 %	0 %	25 %	50 %	254667484
85	NC_013010	AGGA	2	8	31186	31193	50 %	0 %	50 %	0 %	254667484
86	NC_013010	CCAC	2	8	32340	32347	25 %	0 %	0 %	75 %	254667485
87	NC_013010	GATG	2	8	32547	32554	25 %	25 %	50 %	0 %	254667485
88	NC_013010	GACG	2	8	32561	32568	25 %	0 %	50 %	25 %	254667485
89	NC_013010	GTAA	2	8	32707	32714	50 %	25 %	25 %	0 %	254667485
90	NC_013010	CCAC	2	8	32721	32728	25 %	0 %	0 %	75 %	254667485
91	NC_013010	TTCC	2	8	32886	32893	0 %	50 %	0 %	50 %	254667485
92	NC_013010	ATCA	2	8	33540	33547	50 %	25 %	0 %	25 %	254667487
93	NC_013010	GGCA	2	8	33769	33776	25 %	0 %	50 %	25 %	254667487
94	NC_013010	GAAG	2	8	33794	33801	50 %	0 %	50 %	0 %	254667487
95	NC_013010	TCCA	2	8	33884	33891	25 %	25 %	0 %	50 %	254667487
96	NC_013010	TTCC	2	8	34241	34248	0 %	50 %	0 %	50 %	254667487
97	NC_013010	TGGA	2	8	35804	35811	25 %	25 %	50 %	0 %	254667488
98	NC_013010	ACTG	2	8	36321	36328	25 %	25 %	25 %	25 %	254667489
99	NC_013010	GAAT	2	8	36546	36553	50 %	25 %	25 %	0 %	254667489
100	NC_013010	GCTG	2	8	36573	36580	0 %	25 %	50 %	25 %	254667489
101	NC_013010	GTAT	2	8	37695	37702	25 %	50 %	25 %	0 %	254667490
102	NC_013010	GCTG	2	8	37920	37927	0 %	25 %	50 %	25 %	254667490
103	NC_013010	TTCA	2	8	38333	38340	25 %	50 %	0 %	25 %	254667490
104	NC_013010	TGGC	2	8	38455	38462	0 %	25 %	50 %	25 %	254667490
105	NC_013010	CGGG	2	8	38613	38620	0 %	0 %	75 %	25 %	254667491
106	NC_013010	CCGG	2	8	38727	38734	0 %	0 %	50 %	50 %	254667491
107	NC_013010	TGCG	2	8	39009	39016	0 %	25 %	50 %	25 %	254667492
108	NC_013010	GCAG	2	8	39498	39505	25 %	0 %	50 %	25 %	254667492
109	NC_013010	CAGT	2	8	40641	40648	25 %	25 %	25 %	25 %	254667495
110	NC_013010	GCGG	2	8	41302	41309	0 %	0 %	75 %	25 %	254667496
111	NC_013010	GGCA	2	8	42340	42347	25 %	0 %	50 %	25 %	254667498
112	NC_013010	TGCC	2	8	43140	43147	0 %	25 %	25 %	50 %	254667500
113	NC_013010	GTCA	2	8	43480	43487	25 %	25 %	25 %	25 %	254667502
114	NC_013010	CGCT	2	8	44197	44204	0 %	25 %	25 %	50 %	254667504
115	NC_013010	CCCG	2	8	44309	44316	0 %	0 %	25 %	75 %	254667504
116	NC_013010	GCCA	2	8	45069	45076	25 %	0 %	25 %	50 %	254667504
117	NC_013010	CAGT	2	8	45351	45358	25 %	25 %	25 %	25 %	254667505
118	NC_013010	GTCT	2	8	45784	45791	0 %	50 %	25 %	25 %	254667505
119	NC_013010	CTGT	2	8	46155	46162	0 %	50 %	25 %	25 %	254667506
120	NC_013010	TGCC	2	8	46416	46423	0 %	25 %	25 %	50 %	254667506
121	NC_013010	CAGA	2	8	46899	46906	50 %	0 %	25 %	25 %	254667507
122	NC_013010	ACTA	2	8	47547	47554	50 %	25 %	0 %	25 %	254667509
123	NC_013010	GAAC	2	8	48564	48571	50 %	0 %	25 %	25 %	254667509
124	NC_013010	TCTG	2	8	48932	48939	0 %	50 %	25 %	25 %	254667509
125	NC_013010	GAAG	2	8	49029	49036	50 %	0 %	50 %	0 %	254667509
126	NC_013010	GGAT	2	8	49092	49099	25 %	25 %	50 %	0 %	254667509
127	NC_013010	TCAG	2	8	49130	49137	25 %	25 %	25 %	25 %	254667509
128	NC_013010	CTGG	2	8	49439	49446	0 %	25 %	50 %	25 %	254667509
129	NC_013010	GAGG	2	8	50396	50403	25 %	0 %	75 %	0 %	254667511
130	NC_013010	GTTC	2	8	51482	51489	0 %	50 %	25 %	25 %	254667513
131	NC_013010	TCAG	2	8	51560	51567	25 %	25 %	25 %	25 %	254667513
132	NC_013010	CCGG	2	8	51615	51622	0 %	0 %	50 %	50 %	254667513
133	NC_013010	ATGG	2	8	51756	51763	25 %	25 %	50 %	0 %	254667513
134	NC_013010	TTGA	2	8	52084	52091	25 %	50 %	25 %	0 %	254667513
135	NC_013010	CGGG	2	8	52103	52110	0 %	0 %	75 %	25 %	254667513
136	NC_013010	GCAG	2	8	52272	52279	25 %	0 %	50 %	25 %	254667513
137	NC_013010	GAAG	2	8	52647	52654	50 %	0 %	50 %	0 %	254667513
138	NC_013010	GTGG	2	8	52707	52714	0 %	25 %	75 %	0 %	254667513
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.