MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 plasmid pO157

Total Repeats: 204

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013010	GA	3	6	7	12	50 %	0 %	50 %	0 %	254667449
2	NC_013010	AC	3	6	1707	1712	50 %	0 %	0 %	50 %	254667449
3	NC_013010	CA	3	6	2289	2294	50 %	0 %	0 %	50 %	254667449
4	NC_013010	TA	3	6	2675	2680	50 %	50 %	0 %	0 %	254667449
5	NC_013010	GC	3	6	2956	2961	0 %	0 %	50 %	50 %	254667450
6	NC_013010	GC	3	6	6556	6561	0 %	0 %	50 %	50 %	254667452
7	NC_013010	GC	3	6	6693	6698	0 %	0 %	50 %	50 %	254667452
8	NC_013010	CG	3	6	7303	7308	0 %	0 %	50 %	50 %	254667453
9	NC_013010	CG	3	6	7921	7926	0 %	0 %	50 %	50 %	254667453
10	NC_013010	CA	3	6	8216	8221	50 %	0 %	0 %	50 %	254667453
11	NC_013010	AG	3	6	9877	9882	50 %	0 %	50 %	0 %	254667457
12	NC_013010	GC	3	6	10206	10211	0 %	0 %	50 %	50 %	254667457
13	NC_013010	TG	3	6	13058	13063	0 %	50 %	50 %	0 %	254667461
14	NC_013010	AG	3	6	13581	13586	50 %	0 %	50 %	0 %	254667461
15	NC_013010	TA	3	6	14313	14318	50 %	50 %	0 %	0 %	254667462
16	NC_013010	TC	3	6	15340	15345	0 %	50 %	0 %	50 %	254667464
17	NC_013010	AG	3	6	15830	15835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013010	AT	3	6	16124	16129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013010	GA	3	6	16157	16162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013010	TA	3	6	16229	16234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013010	CT	3	6	16408	16413	0 %	50 %	0 %	50 %	254667465
22	NC_013010	AT	3	6	16481	16486	50 %	50 %	0 %	0 %	254667465
23	NC_013010	TA	3	6	16582	16587	50 %	50 %	0 %	0 %	254667465
24	NC_013010	TC	3	6	17187	17192	0 %	50 %	0 %	50 %	254667466
25	NC_013010	AT	3	6	17619	17624	50 %	50 %	0 %	0 %	254667466
26	NC_013010	CT	3	6	18117	18122	0 %	50 %	0 %	50 %	254667466
27	NC_013010	AT	3	6	18258	18263	50 %	50 %	0 %	0 %	254667466
28	NC_013010	AT	3	6	18450	18455	50 %	50 %	0 %	0 %	254667466
29	NC_013010	TA	3	6	18739	18744	50 %	50 %	0 %	0 %	254667466
30	NC_013010	AT	3	6	18959	18964	50 %	50 %	0 %	0 %	254667466
31	NC_013010	TA	3	6	19042	19047	50 %	50 %	0 %	0 %	254667466
32	NC_013010	AG	3	6	19391	19396	50 %	0 %	50 %	0 %	254667466
33	NC_013010	GA	3	6	19553	19558	50 %	0 %	50 %	0 %	254667466
34	NC_013010	TA	3	6	19603	19608	50 %	50 %	0 %	0 %	254667466
35	NC_013010	TA	3	6	19730	19735	50 %	50 %	0 %	0 %	254667466
36	NC_013010	CA	3	6	19758	19763	50 %	0 %	0 %	50 %	254667466
37	NC_013010	CA	4	8	19949	19956	50 %	0 %	0 %	50 %	254667467
38	NC_013010	TA	3	6	20090	20095	50 %	50 %	0 %	0 %	254667467
39	NC_013010	TC	3	6	20487	20492	0 %	50 %	0 %	50 %	254667467
40	NC_013010	GA	3	6	20586	20591	50 %	0 %	50 %	0 %	254667467
41	NC_013010	GA	3	6	21048	21053	50 %	0 %	50 %	0 %	254667467
42	NC_013010	TA	3	6	21395	21400	50 %	50 %	0 %	0 %	254667467
43	NC_013010	CA	3	6	21822	21827	50 %	0 %	0 %	50 %	254667467
44	NC_013010	CA	3	6	21895	21900	50 %	0 %	0 %	50 %	254667467
45	NC_013010	CA	3	6	22043	22048	50 %	0 %	0 %	50 %	254667468
46	NC_013010	GA	3	6	22063	22068	50 %	0 %	50 %	0 %	254667468
47	NC_013010	TA	3	6	23405	23410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013010	AT	3	6	23646	23651	50 %	50 %	0 %	0 %	254667469
49	NC_013010	AT	3	6	23778	23783	50 %	50 %	0 %	0 %	254667470
50	NC_013010	AT	3	6	23911	23916	50 %	50 %	0 %	0 %	254667470
51	NC_013010	TA	3	6	24035	24040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013010	TA	3	6	25257	25262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013010	TA	3	6	25305	25310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013010	CT	3	6	25867	25872	0 %	50 %	0 %	50 %	254667474
55	NC_013010	CA	3	6	26165	26170	50 %	0 %	0 %	50 %	254667474
56	NC_013010	GT	3	6	26587	26592	0 %	50 %	50 %	0 %	254667475
57	NC_013010	TC	4	8	27544	27551	0 %	50 %	0 %	50 %	254667477
58	NC_013010	CG	3	6	27894	27899	0 %	0 %	50 %	50 %	254667478
59	NC_013010	CG	3	6	28043	28048	0 %	0 %	50 %	50 %	254667478
60	NC_013010	CG	3	6	28173	28178	0 %	0 %	50 %	50 %	254667478
61	NC_013010	GC	3	6	28793	28798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013010	AT	3	6	28818	28823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013010	GC	3	6	29761	29766	0 %	0 %	50 %	50 %	254667481
64	NC_013010	TC	4	8	29865	29872	0 %	50 %	0 %	50 %	254667481
65	NC_013010	CA	3	6	30202	30207	50 %	0 %	0 %	50 %	254667482
66	NC_013010	AG	4	8	30425	30432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013010	CT	3	6	31103	31108	0 %	50 %	0 %	50 %	254667484
68	NC_013010	TA	3	6	31937	31942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013010	AC	3	6	31951	31956	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013010	TC	4	8	32961	32968	0 %	50 %	0 %	50 %	254667485
71	NC_013010	CA	3	6	33499	33504	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013010	TC	3	6	33611	33616	0 %	50 %	0 %	50 %	254667487
73	NC_013010	TC	3	6	34063	34068	0 %	50 %	0 %	50 %	254667487
74	NC_013010	GT	3	6	34554	34559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013010	GC	3	6	35589	35594	0 %	0 %	50 %	50 %	254667488
76	NC_013010	GC	3	6	36133	36138	0 %	0 %	50 %	50 %	254667489
77	NC_013010	TC	3	6	37086	37091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013010	GT	3	6	37519	37524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013010	AC	3	6	37928	37933	50 %	0 %	0 %	50 %	254667490
80	NC_013010	TG	3	6	38116	38121	0 %	50 %	50 %	0 %	254667490
81	NC_013010	TG	3	6	38133	38138	0 %	50 %	50 %	0 %	254667490
82	NC_013010	CA	3	6	39464	39469	50 %	0 %	0 %	50 %	254667492
83	NC_013010	TG	3	6	39516	39521	0 %	50 %	50 %	0 %	254667492
84	NC_013010	TG	3	6	39727	39732	0 %	50 %	50 %	0 %	254667493
85	NC_013010	GC	3	6	40060	40065	0 %	0 %	50 %	50 %	254667494
86	NC_013010	CA	3	6	40320	40325	50 %	0 %	0 %	50 %	254667494
87	NC_013010	TC	3	6	41625	41630	0 %	50 %	0 %	50 %	254667497
88	NC_013010	CG	3	6	42694	42699	0 %	0 %	50 %	50 %	254667500
89	NC_013010	CA	3	6	43154	43159	50 %	0 %	0 %	50 %	254667500
90	NC_013010	GT	3	6	43292	43297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013010	CG	3	6	43998	44003	0 %	0 %	50 %	50 %	254667504
92	NC_013010	GA	3	6	44173	44178	50 %	0 %	50 %	0 %	254667504
93	NC_013010	GC	3	6	45381	45386	0 %	0 %	50 %	50 %	254667505
94	NC_013010	TG	3	6	45572	45577	0 %	50 %	50 %	0 %	254667505
95	NC_013010	CG	3	6	45964	45969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013010	GC	3	6	46969	46974	0 %	0 %	50 %	50 %	254667507
97	NC_013010	GA	3	6	47244	47249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013010	AG	3	6	47488	47493	50 %	0 %	50 %	0 %	254667508
99	NC_013010	CG	3	6	48171	48176	0 %	0 %	50 %	50 %	254667509
100	NC_013010	GT	4	8	48727	48734	0 %	50 %	50 %	0 %	254667509
101	NC_013010	TG	3	6	49448	49453	0 %	50 %	50 %	0 %	254667509
102	NC_013010	AC	3	6	49663	49668	50 %	0 %	0 %	50 %	254667510
103	NC_013010	TG	3	6	50873	50878	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013010	CT	3	6	51008	51013	0 %	50 %	0 %	50 %	254667512
105	NC_013010	GT	4	8	51020	51027	0 %	50 %	50 %	0 %	254667512
106	NC_013010	GT	3	6	51033	51038	0 %	50 %	50 %	0 %	254667512
107	NC_013010	AT	3	6	51318	51323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013010	GT	3	6	51833	51838	0 %	50 %	50 %	0 %	254667513
109	NC_013010	AT	3	6	52304	52309	50 %	50 %	0 %	0 %	254667513
110	NC_013010	GC	4	8	52443	52450	0 %	0 %	50 %	50 %	254667513
111	NC_013010	TG	3	6	52939	52944	0 %	50 %	50 %	0 %	254667513
112	NC_013010	AT	3	6	53208	53213	50 %	50 %	0 %	0 %	254667513
113	NC_013010	AT	3	6	53404	53409	50 %	50 %	0 %	0 %	254667514
114	NC_013010	AT	3	6	54285	54290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013010	AG	3	6	54920	54925	50 %	0 %	50 %	0 %	254667516
116	NC_013010	GA	3	6	55306	55311	50 %	0 %	50 %	0 %	254667516
117	NC_013010	TA	3	6	55511	55516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013010	AG	3	6	55679	55684	50 %	0 %	50 %	0 %	254667518
119	NC_013010	AT	3	6	56444	56449	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
120	NC_013010	GA	3	6	56969	56974	50 %	0 %	50 %	0 %	254667518
121	NC_013010	AT	3	6	57082	57087	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
122	NC_013010	AT	3	6	57697	57702	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
123	NC_013010	TA	3	6	58443	58448	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
124	NC_013010	AT	3	6	58577	58582	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
125	NC_013010	AG	3	6	58586	58591	50 %	0 %	50 %	0 %	254667518
126	NC_013010	TA	3	6	58610	58615	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
127	NC_013010	AT	3	6	58784	58789	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
128	NC_013010	AT	3	6	58867	58872	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
129	NC_013010	AT	3	6	59101	59106	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
130	NC_013010	TA	4	8	59408	59415	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
131	NC_013010	GA	3	6	59457	59462	50 %	0 %	50 %	0 %	254667518
132	NC_013010	AT	3	6	60441	60446	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
133	NC_013010	TA	3	6	60627	60632	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
134	NC_013010	TA	3	6	61207	61212	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
135	NC_013010	GT	3	6	61269	61274	0 %	50 %	50 %	0 %	254667518
136	NC_013010	CA	3	6	61406	61411	50 %	0 %	0 %	50 %	254667518
137	NC_013010	AT	4	8	61418	61425	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
138	NC_013010	GA	3	6	61709	61714	50 %	0 %	50 %	0 %	254667518
139	NC_013010	AG	3	6	61791	61796	50 %	0 %	50 %	0 %	254667518
140	NC_013010	TA	3	6	62552	62557	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
141	NC_013010	AT	5	10	62616	62625	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
142	NC_013010	AG	3	6	62709	62714	50 %	0 %	50 %	0 %	254667518
143	NC_013010	AT	3	6	63342	63347	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
144	NC_013010	AT	4	8	64057	64064	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
145	NC_013010	AT	3	6	64104	64109	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.