MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Neorickettsia risticii str. Illinois

Total Repeats: 370

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013009	CAGC	2	8	8180	8187	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013009	GTCC	2	8	9653	9660	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013009	TAGT	2	8	10198	10205	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013009	AGTA	2	8	14995	15002	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013009	TGTT	2	8	17170	17177	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013009	CGTG	2	8	18826	18833	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013009	CGTA	2	8	18848	18855	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013009	GGGA	2	8	18917	18924	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013009	TCAT	2	8	23654	23661	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013009	GCTC	2	8	26387	26394	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013009	AGTA	2	8	28459	28466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013009	GAAA	2	8	29698	29705	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013009	CTTT	2	8	30045	30052	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013009	ATCT	2	8	35245	35252	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013009	CGGT	2	8	36312	36319	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013009	AGTA	2	8	36337	36344	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013009	GAAC	2	8	36419	36426	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013009	AGGG	2	8	37360	37367	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013009	AGCT	2	8	37600	37607	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013009	GTTG	2	8	38348	38355	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013009	ATTA	2	8	38499	38506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013009	TCTA	2	8	40455	40462	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013009	AACA	2	8	41223	41230	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013009	TAAG	2	8	43996	44003	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013009	TGAA	2	8	44063	44070	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013009	TGGC	2	8	44592	44599	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013009	CAAA	2	8	49992	49999	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013009	GGTT	2	8	57642	57649	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013009	CAAA	2	8	58667	58674	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013009	GGCC	2	8	61263	61270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013009	GTAT	2	8	63050	63057	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013009	CAAT	2	8	65231	65238	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013009	TTTC	2	8	65370	65377	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013009	TTAT	2	8	65486	65493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013009	TGCC	2	8	66379	66386	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013009	TGTA	2	8	66507	66514	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013009	GTTT	2	8	67619	67626	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013009	GTAG	2	8	67647	67654	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013009	TTCC	2	8	67900	67907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013009	TTTG	2	8	68013	68020	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013009	TCTT	2	8	69796	69803	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013009	AAGA	2	8	70771	70778	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013009	ACTA	2	8	71550	71557	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013009	TGAG	2	8	71652	71659	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013009	TATT	2	8	72951	72958	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013009	TGCT	2	8	73007	73014	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013009	CAGA	2	8	73109	73116	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013009	ATTC	2	8	73251	73258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013009	ACGA	2	8	73587	73594	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013009	GTGC	2	8	73804	73811	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013009	AAAT	2	8	74996	75003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013009	TATT	2	8	75150	75157	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013009	TTTG	2	8	75168	75175	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013009	TCAT	2	8	75240	75247	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013009	GACG	2	8	77947	77954	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013009	TATT	2	8	78075	78082	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013009	TAAC	2	8	78212	78219	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013009	AAGA	2	8	80054	80061	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013009	TATT	3	12	80305	80316	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013009	CATA	2	8	81055	81062	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013009	TGCG	2	8	81716	81723	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_013009	GTTT	2	8	84414	84421	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013009	CTGT	2	8	86226	86233	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_013009	AAAC	2	8	88447	88454	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_013009	GTTT	2	8	88488	88495	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013009	ATTG	2	8	88540	88547	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013009	GGTT	2	8	89811	89818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013009	CTGT	2	8	89822	89829	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013009	ATTT	2	8	89873	89880	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013009	ATTA	2	8	89932	89939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013009	GGTT	2	8	92219	92226	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013009	CTGT	2	8	92230	92237	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_013009	ATTT	2	8	92281	92288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013009	TAAA	2	8	92949	92956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013009	CAGT	2	8	93228	93235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013009	GACG	2	8	94199	94206	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013009	TCGT	2	8	94316	94323	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_013009	AATG	2	8	94431	94438	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013009	TACA	2	8	96146	96153	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013009	AAAC	2	8	96169	96176	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_013009	TTGT	2	8	96209	96216	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013009	AGGT	2	8	96432	96439	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013009	TAAA	2	8	96967	96974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013009	ATTT	2	8	98166	98173	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013009	ATTT	2	8	99346	99353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013009	CTTT	2	8	102030	102037	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013009	AAAG	2	8	102348	102355	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013009	ATTA	2	8	103226	103233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013009	GGGA	2	8	103335	103342	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013009	TTGG	2	8	105709	105716	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013009	GAAG	2	8	105754	105761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013009	ATGC	2	8	105852	105859	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013009	TGAT	2	8	108431	108438	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013009	CTTG	2	8	108638	108645	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_013009	ATTG	2	8	108729	108736	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013009	TAAA	2	8	115776	115783	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013009	AGCA	2	8	117821	117828	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013009	TACT	2	8	119012	119019	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_013009	TGAA	2	8	121959	121966	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013009	AATA	2	8	124621	124628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013009	ATTG	2	8	124748	124755	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013009	TAGA	2	8	125599	125606	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013009	ACTC	2	8	125657	125664	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013009	CTAC	2	8	125683	125690	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013009	AGAA	2	8	126940	126947	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013009	GGTG	2	8	127047	127054	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013009	TAAC	2	8	128086	128093	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_013009	TTTG	2	8	128215	128222	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013009	GTTT	2	8	128289	128296	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013009	TGTT	2	8	134335	134342	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013009	CTTT	2	8	135712	135719	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_013009	GTTT	2	8	135741	135748	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013009	TAAT	2	8	140583	140590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013009	CTTG	2	8	149384	149391	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013009	TCCT	2	8	152076	152083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013009	GAAA	2	8	154837	154844	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013009	GGAT	2	8	155053	155060	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013009	TTCG	2	8	156402	156409	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_013009	CATG	2	8	160395	160402	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_013009	ATTT	2	8	167580	167587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013009	TATG	2	8	169183	169190	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013009	ACTT	2	8	170836	170843	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_013009	GATA	2	8	172585	172592	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013009	AGTA	2	8	181345	181352	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013009	TTTG	2	8	181477	181484	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013009	TGTT	2	8	184337	184344	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013009	ATTA	2	8	187663	187670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013009	TAAC	2	8	191056	191063	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013009	CATC	2	8	196336	196343	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_013009	TTGC	2	8	196371	196378	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013009	AATA	2	8	204723	204730	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013009	TCCA	2	8	218674	218681	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_013009	CCTT	2	8	222671	222678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_013009	GTCT	2	8	238068	238075	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_013009	TAAA	2	8	252625	252632	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013009	TGAT	2	8	259213	259220	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013009	TTCT	2	8	259237	259244	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_013009	CATG	2	8	265344	265351	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_013009	ATTT	2	8	273730	273737	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013009	AGTA	2	8	275421	275428	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013009	TGAC	2	8	279254	279261	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_013009	TGGA	2	8	280331	280338	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013009	GTTT	2	8	284685	284692	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013009	GCAA	2	8	284755	284762	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_013009	ATTT	2	8	285050	285057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013009	GGCA	2	8	287684	287691	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013009	AGGT	2	8	291070	291077	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013009	CAGA	2	8	293272	293279	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_013009	TGCT	2	8	294035	294042	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_013009	ATGC	2	8	294300	294307	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_013009	TATC	2	8	294316	294323	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_013009	ATTG	2	8	301216	301223	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013009	GGTA	2	8	301288	301295	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_013009	CTTT	2	8	306892	306899	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.