MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Neorickettsia risticii str. Illinois

Total Repeats: 11018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013009	GAA	2	6	106	111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254796401
2	NC_013009	ATA	2	6	142	147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254796401
3	NC_013009	TAG	2	6	281	286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796401
4	NC_013009	CGA	2	6	348	353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254796401
5	NC_013009	AGA	2	6	462	467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254796401
6	NC_013009	CTT	2	6	878	883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796402
7	NC_013009	TAC	2	6	924	929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254796402
8	NC_013009	TCT	2	6	930	935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796402
9	NC_013009	GGT	2	6	1031	1036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254796402
10	NC_013009	TGG	2	6	1148	1153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254796402
11	NC_013009	GGA	2	6	1167	1172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254796402
12	NC_013009	AAC	2	6	1214	1219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254796402
13	NC_013009	AGG	2	6	1224	1229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254796402
14	NC_013009	TGT	2	6	1346	1351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254796402
15	NC_013009	TTC	2	6	1669	1674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796402
16	NC_013009	TGG	2	6	1711	1716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254796402
17	NC_013009	TAA	2	6	1825	1830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254796402
18	NC_013009	TGT	2	6	1848	1853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254796402
19	NC_013009	GAT	2	6	1962	1967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796402
20	NC_013009	GAG	2	6	1986	1991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254796402
21	NC_013009	TAG	2	6	2030	2035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796402
22	NC_013009	GAG	2	6	2087	2092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254796402
23	NC_013009	CTT	2	6	2147	2152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796402
24	NC_013009	GCG	2	6	2246	2251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254796403
25	NC_013009	AAC	2	6	2281	2286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254796403
26	NC_013009	CGT	2	6	2376	2381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254796403
27	NC_013009	TTA	2	6	2514	2519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254796403
28	NC_013009	GTT	2	6	2654	2659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254796403
29	NC_013009	GTT	2	6	2722	2727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254796403
30	NC_013009	AAT	2	6	2787	2792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254796403
31	NC_013009	TAT	2	6	2863	2868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254796403
32	NC_013009	TCT	2	6	2936	2941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796403
33	NC_013009	TCA	2	6	3018	3023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254796403
34	NC_013009	AAC	2	6	3053	3058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254796403
35	NC_013009	TCT	2	6	3149	3154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796403
36	NC_013009	TAT	2	6	3175	3180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254796403
37	NC_013009	GAA	2	6	3206	3211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254796403
38	NC_013009	GAT	2	6	3240	3245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796403
39	NC_013009	TTG	2	6	3263	3268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254796403
40	NC_013009	TGC	2	6	3483	3488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254796403
41	NC_013009	AGT	2	6	3536	3541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796403
42	NC_013009	AGC	2	6	3590	3595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013009	GTA	2	6	3656	3661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796404
44	NC_013009	TGG	2	6	3664	3669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254796404
45	NC_013009	AGG	2	6	3857	3862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254796404
46	NC_013009	GAA	2	6	4158	4163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254796404
47	NC_013009	AAG	2	6	4298	4303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254796404
48	NC_013009	ACT	2	6	4350	4355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254796404
49	NC_013009	TTG	2	6	4425	4430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254796404
50	NC_013009	ATG	2	6	4449	4454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796404
51	NC_013009	TTA	2	6	4545	4550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254796404
52	NC_013009	AAG	2	6	4701	4706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254796404
53	NC_013009	ATT	2	6	4760	4765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254796404
54	NC_013009	ACT	2	6	4935	4940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254796405
55	NC_013009	GCC	2	6	4970	4975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254796405
56	NC_013009	TGA	2	6	5005	5010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796405
57	NC_013009	GTA	2	6	5293	5298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796405
58	NC_013009	GAT	2	6	5477	5482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796405
59	NC_013009	CGT	2	6	5585	5590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254796405
60	NC_013009	GGA	2	6	5664	5669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254796405
61	NC_013009	TCT	2	6	5846	5851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796405
62	NC_013009	GAA	2	6	5858	5863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254796405
63	NC_013009	AAC	2	6	5872	5877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254796405
64	NC_013009	GGC	2	6	5890	5895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254796405
65	NC_013009	ACT	2	6	5951	5956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013009	CCT	2	6	5993	5998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254796406
67	NC_013009	CAA	2	6	6051	6056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254796406
68	NC_013009	CTT	2	6	6077	6082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796406
69	NC_013009	CGA	3	9	6131	6139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254796406
70	NC_013009	TCA	2	6	6141	6146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254796406
71	NC_013009	GTT	2	6	6218	6223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254796406
72	NC_013009	ATC	2	6	6453	6458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254796406
73	NC_013009	CTT	2	6	6461	6466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013009	AAC	2	6	6484	6489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013009	CAC	2	6	6515	6520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_013009	AAG	2	6	6640	6645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254796407
77	NC_013009	TAG	2	6	6789	6794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796407
78	NC_013009	GCT	2	6	6800	6805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254796407
79	NC_013009	TCT	2	6	6806	6811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796407
80	NC_013009	GAA	2	6	6847	6852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254796407
81	NC_013009	GCA	2	6	7193	7198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254796407
82	NC_013009	ACC	2	6	7492	7497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254796407
83	NC_013009	CTC	2	6	7502	7507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254796407
84	NC_013009	ATA	2	6	7521	7526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254796407
85	NC_013009	GAA	2	6	7565	7570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254796407
86	NC_013009	TAA	2	6	7801	7806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254796407
87	NC_013009	TGC	3	9	7883	7891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013009	GCA	2	6	8049	8054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254796408
89	NC_013009	GCA	2	6	8198	8203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013009	TAG	2	6	8225	8230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796409
91	NC_013009	AAG	2	6	8564	8569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254796409
92	NC_013009	AAT	2	6	8711	8716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254796409
93	NC_013009	AGT	2	6	8778	8783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013009	ACC	2	6	8813	8818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_013009	GGC	2	6	8854	8859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013009	GTT	2	6	9024	9029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254796410
97	NC_013009	TGT	2	6	9041	9046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254796410
98	NC_013009	AGC	2	6	9101	9106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254796410
99	NC_013009	TGC	2	6	9130	9135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254796410
100	NC_013009	TTG	2	6	9136	9141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254796410
101	NC_013009	GTC	2	6	9177	9182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254796410
102	NC_013009	ATG	2	6	9183	9188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796410
103	NC_013009	GAT	2	6	9198	9203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796410
104	NC_013009	AAG	2	6	9207	9212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254796410
105	NC_013009	ATG	2	6	9292	9297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796410
106	NC_013009	AGT	2	6	9386	9391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796410
107	NC_013009	TGG	2	6	9406	9411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254796410
108	NC_013009	TCT	2	6	9483	9488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796410
109	NC_013009	AGC	2	6	9584	9589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013009	CTT	2	6	9910	9915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796411
111	NC_013009	GGA	2	6	9927	9932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254796411
112	NC_013009	GCT	2	6	9975	9980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254796411
113	NC_013009	GGT	2	6	9992	9997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254796411
114	NC_013009	TAA	2	6	10043	10048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254796411
115	NC_013009	TCG	2	6	10064	10069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013009	GTT	2	6	10097	10102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013009	ATA	2	6	10153	10158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013009	TAA	2	6	10251	10256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254796412
119	NC_013009	GTG	2	6	10277	10282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254796412
120	NC_013009	TGT	2	6	10390	10395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254796412
121	NC_013009	TGC	2	6	10475	10480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254796413
122	NC_013009	GTT	2	6	10620	10625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254796413
123	NC_013009	CTT	2	6	10803	10808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796413
124	NC_013009	AGG	2	6	10824	10829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254796413
125	NC_013009	TAG	2	6	10894	10899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796413
126	NC_013009	GCA	2	6	11121	11126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254796413
127	NC_013009	CTG	2	6	11137	11142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254796413
128	NC_013009	TCT	2	6	11150	11155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796413
129	NC_013009	GCT	2	6	11229	11234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254796413
130	NC_013009	TGC	2	6	11318	11323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254796413
131	NC_013009	ACT	2	6	11387	11392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254796413
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257	NC_013009	AAG	2	6	22341	22346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_013009	CAA	2	6	22354	22359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_013009	ATA	2	6	22362	22367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_013009	AGA	2	6	22566	22571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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405	NC_013009	TGG	2	6	34420	34425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_013009	ACT	2	6	43248	43253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254796449

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