MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 chromosome

Total Repeats: 242

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013008	GAAAAT	2	12	10630	10641	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013008	AAATTA	2	12	18777	18788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013008	AAAGGA	2	12	18852	18863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013008	TTTCAC	2	12	19616	19627	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013008	TAAAAA	2	12	63348	63359	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013008	AAGGGA	2	12	88917	88928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013008	CGCCAT	2	12	152249	152260	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013008	TCTCCC	2	12	168847	168858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_013008	TCACCC	2	12	168898	168909	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_013008	GTAGTG	2	12	203705	203716	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013008	TTATAT	2	12	288504	288515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013008	TGTAAC	2	12	312829	312840	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013008	CGCTAT	2	12	314806	314817	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013008	GATTTT	2	12	317651	317662	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013008	ATTATC	2	12	357272	357283	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_013008	TTTTCT	2	12	368013	368024	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013008	CTATTT	2	12	369049	369060	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_013008	AATTTC	2	12	374738	374749	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_013008	TTTATT	2	12	406038	406049	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013008	ATGAAA	2	12	448893	448904	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013008	TACCAA	2	12	456734	456745	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013008	GATGGT	2	12	457503	457514	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013008	GCAACT	2	12	457545	457556	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013008	TAACGG	2	12	458187	458198	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_013008	AACAAT	2	12	472224	472235	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_013008	AATAAA	2	12	473805	473816	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013008	ATTACG	2	12	474697	474708	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_013008	AAAATA	2	12	474955	474966	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013008	TATTGA	2	12	477377	477388	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013008	TTTTCA	2	12	543720	543731	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_013008	CAGGCG	2	12	562395	562406	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013008	CGGTGG	2	12	605339	605350	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_013008	CAACAC	2	12	605613	605624	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013008	CGGCAA	2	12	606456	606467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013008	TGCAAA	2	12	699177	699188	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013008	ATCATT	2	12	762770	762781	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013008	ATTTTT	2	12	793164	793175	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013008	CGCTGG	2	12	793255	793266	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013008	AATCAG	2	12	851664	851675	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_013008	TTTTCT	2	12	883777	883788	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_013008	TTGTGT	2	12	897036	897047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013008	TTAAAT	2	12	904018	904029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013008	TCGCTG	2	12	904177	904188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013008	TTGTAC	2	12	905053	905064	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_013008	GTGATG	2	12	906029	906040	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013008	CATTAT	2	12	906646	906657	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_013008	AATATT	2	12	948083	948094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013008	CAGAAA	2	12	962388	962399	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_013008	TTCGAT	2	12	990238	990249	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_013008	GCCAGC	2	12	991624	991635	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013008	TAACCG	2	12	1058909	1058920	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013008	AAATAA	2	12	1089204	1089215	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013008	CTGGAA	2	12	1098767	1098778	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_013008	AAAGAT	2	12	1121563	1121574	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013008	TGTCCA	2	12	1142196	1142207	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013008	TAAGGA	2	12	1164463	1164474	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013008	ATAATG	2	12	1165877	1165888	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013008	GATATG	2	12	1182009	1182020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013008	TCAAAA	2	12	1235893	1235904	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_013008	AATGAT	2	12	1247937	1247948	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013008	GATGGC	2	12	1248327	1248338	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013008	GAATGA	2	12	1287332	1287343	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013008	TCCATG	2	12	1289801	1289812	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013008	CAAAGC	2	12	1291908	1291919	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013008	TGTTAA	2	12	1331346	1331357	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013008	ACTTCA	2	12	1333577	1333588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013008	ATTCAA	2	12	1361189	1361200	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_013008	ATTTTT	2	12	1372385	1372396	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013008	CTGGGA	2	12	1379989	1380000	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_013008	CAAAAA	2	12	1424237	1424248	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_013008	GCATTA	2	12	1493920	1493931	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_013008	CTTTTT	2	12	1511810	1511821	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_013008	ATTTTA	2	12	1528839	1528850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013008	TTTCTG	2	12	1563321	1563332	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_013008	CTGTCA	2	12	1566352	1566363	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013008	AATATG	2	12	1596399	1596410	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013008	GAAGTT	2	12	1599457	1599468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013008	ACGCTT	2	12	1617292	1617303	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013008	ACTCGA	2	12	1617312	1617323	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013008	CAGGCT	2	12	1617446	1617457	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013008	CTTATT	2	12	1657940	1657951	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_013008	CGGGGG	2	12	1672053	1672064	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_013008	CTGATC	2	12	1674313	1674324	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013008	GTTTTT	2	12	1690107	1690118	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013008	CTTCAT	2	12	1733587	1733598	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013008	GTTTTT	2	12	1747985	1747996	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013008	AAAAAT	2	12	1758279	1758290	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013008	AAAGTT	2	12	1782262	1782273	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013008	CTATAA	2	12	1831189	1831200	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_013008	CGCTCA	2	12	1934373	1934384	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013008	ACGATC	2	12	1934869	1934880	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013008	CCGGAC	2	12	1959722	1959733	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013008	TTTTAT	2	12	1963716	1963727	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013008	ATTTTC	2	12	1967492	1967503	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_013008	AAAAAC	2	12	1990580	1990591	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_013008	CCAGCG	2	12	1999453	1999464	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013008	TTCATA	2	12	2002161	2002172	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_013008	ACCGTT	2	12	2005447	2005458	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013008	TGGTTA	2	12	2014276	2014287	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013008	TTTCTG	2	12	2054197	2054208	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_013008	CAAAAA	2	12	2068597	2068608	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_013008	TTAAAT	2	12	2070396	2070407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013008	CCGGAA	2	12	2095491	2095502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013008	CAGCCA	2	12	2095905	2095916	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013008	TGACCG	2	12	2119607	2119618	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013008	AATAAA	2	12	2138184	2138195	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013008	CCGGAA	2	12	2143400	2143411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013008	ATACTT	2	12	2246121	2246132	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_013008	AAAATA	2	12	2259778	2259789	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013008	TGTTTT	2	12	2260411	2260422	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013008	AAGACT	2	12	2260671	2260682	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_013008	TATTAC	2	12	2378791	2378802	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_013008	TTTCTT	2	12	2397030	2397041	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_013008	AGGATG	2	12	2436854	2436865	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013008	AACGGT	2	12	2469145	2469156	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_013008	AATTCA	2	12	2493070	2493081	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_013008	TCTTAT	2	12	2529323	2529334	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_013008	ATATTT	2	12	2564992	2565003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013008	TGTCAG	2	12	2579705	2579716	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_013008	CTGCTC	2	12	2582852	2582863	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013008	CTGATA	2	12	2646901	2646912	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_013008	AATAAA	2	12	2689196	2689207	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013008	CGATAC	2	12	2703092	2703103	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_013008	TTTTGT	2	12	2762128	2762139	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013008	GTTTAG	2	12	2782990	2783001	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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130	NC_013008	CCTTAC	2	12	2880367	2880378	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_013008	CCTTAC	2	12	2880976	2880987	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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242	NC_013008	AGTAAA	2	12	5517104	5517115	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.