MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 chromosome

Total Repeats: 78672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013008	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013008	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254791137
3	NC_013008	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254791137
4	NC_013008	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254791137
5	NC_013008	CAC	3	9	225	233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254791137
6	NC_013008	AAC	2	6	347	352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254791137
7	NC_013008	CGG	2	6	371	376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254791138
8	NC_013008	TGG	2	6	493	498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254791138
9	NC_013008	GAT	2	6	500	505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791138
10	NC_013008	CGC	3	9	587	595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791138
11	NC_013008	TCG	2	6	631	636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791138
12	NC_013008	CTG	2	6	813	818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791138
13	NC_013008	CCG	2	6	866	871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791138
14	NC_013008	CCG	2	6	925	930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791138
15	NC_013008	TGG	2	6	949	954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254791138
16	NC_013008	ACT	2	6	976	981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791138
17	NC_013008	CGG	2	6	985	990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254791138
18	NC_013008	TTG	2	6	1016	1021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254791138
19	NC_013008	GTT	2	6	1085	1090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254791138
20	NC_013008	TTC	2	6	1144	1149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254791138
21	NC_013008	TGA	2	6	1250	1255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791138
22	NC_013008	AAT	2	6	1290	1295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254791138
23	NC_013008	GGC	2	6	1346	1351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254791138
24	NC_013008	TGC	2	6	1361	1366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791138
25	NC_013008	GTG	2	6	1389	1394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254791138
26	NC_013008	ATC	2	6	1406	1411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791138
27	NC_013008	AAG	2	6	1501	1506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254791138
28	NC_013008	GGT	2	6	1553	1558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254791138
29	NC_013008	TCT	2	6	1653	1658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254791138
30	NC_013008	GAT	2	6	1689	1694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791138
31	NC_013008	TCA	2	6	1718	1723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791138
32	NC_013008	GCT	2	6	1790	1795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791138
33	NC_013008	GAA	2	6	1826	1831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254791138
34	NC_013008	GAA	2	6	1920	1925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254791138
35	NC_013008	ATC	2	6	1984	1989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791138
36	NC_013008	TTG	2	6	2005	2010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254791138
37	NC_013008	TCG	2	6	2103	2108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791138
38	NC_013008	TAC	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791138
39	NC_013008	TGA	2	6	2231	2236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791138
40	NC_013008	TGA	2	6	2239	2244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791138
41	NC_013008	GAT	2	6	2367	2372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791138
42	NC_013008	TGC	2	6	2464	2469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791138
43	NC_013008	CGA	2	6	2528	2533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254791138
44	NC_013008	TGA	2	6	2564	2569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791138
45	NC_013008	TGA	2	6	2600	2605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791138
46	NC_013008	TAT	2	6	2703	2708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254791138
47	NC_013008	TGC	2	6	2725	2730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791138
48	NC_013008	GCG	2	6	2881	2886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254791139
49	NC_013008	CAA	2	6	2955	2960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254791139
50	NC_013008	GGT	2	6	3123	3128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254791139
51	NC_013008	GCA	2	6	3224	3229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254791139
52	NC_013008	TGG	2	6	3261	3266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254791139
53	NC_013008	TGA	2	6	3275	3280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791139
54	NC_013008	GAA	2	6	3283	3288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254791139
55	NC_013008	CAT	2	6	3294	3299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791139
56	NC_013008	TGA	2	6	3321	3326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791139
57	NC_013008	CGC	2	6	3403	3408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791139
58	NC_013008	TGA	2	6	3491	3496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791139
59	NC_013008	CGG	2	6	3722	3727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254791139
60	NC_013008	TGA	2	6	3879	3884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791140
61	NC_013008	TGA	2	6	3942	3947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791140
62	NC_013008	CGG	2	6	4077	4082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254791140
63	NC_013008	GGC	2	6	4270	4275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254791140
64	NC_013008	TGA	3	9	4341	4349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791140
65	NC_013008	CTA	2	6	4422	4427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791140
66	NC_013008	CGG	2	6	4511	4516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254791140
67	NC_013008	CTG	2	6	4519	4524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791140
68	NC_013008	TGC	2	6	4560	4565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791140
69	NC_013008	AAC	2	6	4669	4674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254791140
70	NC_013008	GTT	2	6	4692	4697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254791140
71	NC_013008	CCG	2	6	4698	4703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791140
72	NC_013008	GCC	2	6	4735	4740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791140
73	NC_013008	GAT	2	6	4744	4749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791140
74	NC_013008	CCG	2	6	4991	4996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791140
75	NC_013008	TGC	2	6	5001	5006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791140
76	NC_013008	TGA	3	9	5018	5026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791140
77	NC_013008	ATC	2	6	5027	5032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791140
78	NC_013008	GAA	2	6	5096	5101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013008	AAC	2	6	5180	5185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013008	CGC	2	6	5186	5191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_013008	TTA	2	6	5379	5384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254791141
82	NC_013008	TGG	2	6	5416	5421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254791141
83	NC_013008	ACA	2	6	5424	5429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254791141
84	NC_013008	CCG	2	6	5467	5472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791141
85	NC_013008	CCG	2	6	5476	5481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791141
86	NC_013008	TCA	2	6	5499	5504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791141
87	NC_013008	ATC	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791141
88	NC_013008	CGG	2	6	5514	5519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254791141
89	NC_013008	CGC	2	6	5674	5679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_013008	GCT	2	6	5705	5710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791142
91	NC_013008	GGA	2	6	5742	5747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254791142
92	NC_013008	TCA	2	6	5752	5757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791142
93	NC_013008	AAG	2	6	5758	5763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254791142
94	NC_013008	AAT	2	6	5817	5822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254791142
95	NC_013008	TCA	2	6	5831	5836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791142
96	NC_013008	TTC	2	6	5884	5889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254791142
97	NC_013008	TTC	2	6	5929	5934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254791142
98	NC_013008	CAC	2	6	5976	5981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254791142
99	NC_013008	TGC	2	6	5994	5999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791142
100	NC_013008	TTG	2	6	6016	6021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254791142
101	NC_013008	TGA	2	6	6023	6028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791142
102	NC_013008	CTG	2	6	6378	6383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791142
103	NC_013008	GTG	2	6	6418	6423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254791142
104	NC_013008	CAT	2	6	6560	6565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791143
105	NC_013008	GCC	2	6	6777	6782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791143
106	NC_013008	GTT	2	6	6831	6836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254791143
107	NC_013008	AGA	2	6	6848	6853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254791143
108	NC_013008	ATC	2	6	7075	7080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791143
109	NC_013008	CGC	2	6	7119	7124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791143
110	NC_013008	CGC	2	6	7221	7226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791143
111	NC_013008	GCC	2	6	7227	7232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791143
112	NC_013008	TTA	2	6	7301	7306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254791143
113	NC_013008	CAG	2	6	7404	7409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254791143
114	NC_013008	AAT	2	6	7425	7430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254791143
115	NC_013008	CGG	2	6	7718	7723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254791143
116	NC_013008	CAA	2	6	7897	7902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254791143
117	NC_013008	TAA	2	6	7952	7957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254791143
118	NC_013008	AAG	2	6	8036	8041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013008	CGG	2	6	8168	8173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013008	CGT	2	6	8188	8193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013008	ATC	2	6	8197	8202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013008	ACC	2	6	8288	8293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254791144
123	NC_013008	CAG	2	6	8435	8440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254791144
124	NC_013008	CAG	2	6	8456	8461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254791144
125	NC_013008	TGC	2	6	8677	8682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791144
126	NC_013008	AAG	2	6	8697	8702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254791144
127	NC_013008	CTG	2	6	8723	8728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791144
128	NC_013008	TTG	2	6	8787	8792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254791144
129	NC_013008	AGA	2	6	8848	8853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254791144
130	NC_013008	TAC	2	6	8888	8893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791144
131	NC_013008	CTG	2	6	8996	9001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791144
132	NC_013008	GCA	2	6	9103	9108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254791144
133	NC_013008	CTG	2	6	9200	9205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791144
134	NC_013008	TGA	2	6	9321	9326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791145
135	NC_013008	GCG	2	6	9372	9377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254791145
136	NC_013008	GAA	2	6	9407	9412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254791145
137	NC_013008	ATC	2	6	9479	9484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791145
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139	NC_013008	CAC	2	6	9535	9540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254791145
140	NC_013008	CGT	2	6	9560	9565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791145
141	NC_013008	TGC	2	6	9865	9870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791145
142	NC_013008	GAT	2	6	10062	10067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791146
143	NC_013008	GCG	2	6	10069	10074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254791146
144	NC_013008	CAG	2	6	10098	10103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254791146
145	NC_013008	GAA	2	6	10167	10172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254791146
146	NC_013008	CAG	2	6	10260	10265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254791146
147	NC_013008	CAG	2	6	10344	10349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254791146
148	NC_013008	GCC	2	6	10371	10376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791146
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150	NC_013008	TGG	2	6	10448	10453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254791146
151	NC_013008	ATC	3	9	10524	10532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_013008	AAT	2	6	10546	10551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013008	ATA	2	6	10587	10592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013008	TGC	2	6	10828	10833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791147
155	NC_013008	AAT	2	6	10892	10897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254791147
156	NC_013008	TCA	2	6	10905	10910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791147
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160	NC_013008	CCA	2	6	11150	11155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254791147
161	NC_013008	GCG	2	6	11191	11196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254791147
162	NC_013008	AGC	2	6	11288	11293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254791147
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164	NC_013008	CTT	2	6	11530	11535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254791148
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166	NC_013008	GAG	2	6	11717	11722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254791148
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168	NC_013008	CTG	2	6	11854	11859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_013008	AGA	2	6	11866	11871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
170	NC_013008	TTA	2	6	11895	11900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_013008	TGA	2	6	12032	12037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791149
172	NC_013008	TAG	2	6	12057	12062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791149
173	NC_013008	ATG	2	6	12148	12153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
174	NC_013008	AAT	2	6	12188	12193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254791150
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178	NC_013008	GCC	2	6	12400	12405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791150
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182	NC_013008	GCT	2	6	12462	12467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791150
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240	NC_013008	TAT	2	6	15727	15732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
241	NC_013008	ATT	2	6	15818	15823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
242	NC_013008	ATT	2	6	15850	15855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_013008	GAC	2	6	15856	15861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
244	NC_013008	ATT	2	6	15869	15874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
245	NC_013008	ACA	2	6	15909	15914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
246	NC_013008	TTC	2	6	16042	16047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
247	NC_013008	ATT	2	6	16067	16072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
248	NC_013008	GAT	2	6	16097	16102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
249	NC_013008	ATT	2	6	16202	16207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254791153
250	NC_013008	GAT	3	9	16231	16239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791153
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253	NC_013008	GCT	2	6	16454	16459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791153
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257	NC_013008	TAT	2	6	16636	16641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254791153
258	NC_013008	CGA	2	6	16642	16647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254791153
259	NC_013008	CAT	2	6	16657	16662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791153
260	NC_013008	ATC	2	6	16664	16669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791153
261	NC_013008	CGC	2	6	16763	16768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791153
262	NC_013008	CTT	2	6	16858	16863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254791153
263	NC_013008	ATC	2	6	17030	17035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791153
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282	NC_013008	AGT	2	6	18451	18456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
283	NC_013008	CAT	2	6	18490	18495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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286	NC_013008	TAT	2	6	18811	18816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_013008	CGG	2	6	19148	19153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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298	NC_013008	AAC	2	6	19683	19688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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302	NC_013008	ATT	2	6	19932	19937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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312	NC_013008	ATT	2	6	20520	20525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
313	NC_013008	TAC	2	6	20531	20536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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385	NC_013008	TTG	2	6	25231	25236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254791158
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499	NC_013008	TCT	2	6	33780	33785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
500	NC_013008	TGC	2	6	33786	33791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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