MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium extorquens DM4 plasmid p2METDI

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012989	GGGGC	2	10	885	894	0 %	0 %	80 %	20 %	254564254
2	NC_012989	CTGGA	2	10	2060	2069	20 %	20 %	40 %	20 %	254564255
3	NC_012989	GGCGC	2	10	3282	3291	0 %	0 %	60 %	40 %	254564256
4	NC_012989	GCACG	2	10	3296	3305	20 %	0 %	40 %	40 %	254564256
5	NC_012989	CGTAC	2	10	3670	3679	20 %	20 %	20 %	40 %	254564256
6	NC_012989	GCCGA	2	10	6156	6165	20 %	0 %	40 %	40 %	254564259
7	NC_012989	GGTTC	2	10	6428	6437	0 %	40 %	40 %	20 %	254564259
8	NC_012989	GACCG	2	10	7665	7674	20 %	0 %	40 %	40 %	254564261
9	NC_012989	GGTCC	2	10	8252	8261	0 %	20 %	40 %	40 %	254564262
10	NC_012989	GCTTG	2	10	8404	8413	0 %	40 %	40 %	20 %	254564262
11	NC_012989	GCCCA	2	10	9344	9353	20 %	0 %	20 %	60 %	254564264
12	NC_012989	CAGGG	2	10	10816	10825	20 %	0 %	60 %	20 %	254564265
13	NC_012989	CGGCT	2	10	11925	11934	0 %	20 %	40 %	40 %	254564267
14	NC_012989	GGTTC	2	10	12893	12902	0 %	40 %	40 %	20 %	254564268
15	NC_012989	ACCGC	2	10	14914	14923	20 %	0 %	20 %	60 %	254564269
16	NC_012989	TGGCT	2	10	15868	15877	0 %	40 %	40 %	20 %	254564269
17	NC_012989	TACGA	2	10	16506	16515	40 %	20 %	20 %	20 %	254564270
18	NC_012989	GGTCG	2	10	16614	16623	0 %	20 %	60 %	20 %	254564270
19	NC_012989	AGCCC	2	10	18445	18454	20 %	0 %	20 %	60 %	254564272
20	NC_012989	GGCGC	2	10	19285	19294	0 %	0 %	60 %	40 %	254564273
21	NC_012989	CCGTC	2	10	20807	20816	0 %	20 %	20 %	60 %	254564275
22	NC_012989	GGGGA	2	10	23205	23214	20 %	0 %	80 %	0 %	254564276
23	NC_012989	GGAGC	2	10	23276	23285	20 %	0 %	60 %	20 %	254564276
24	NC_012989	CGGTC	2	10	24018	24027	0 %	20 %	40 %	40 %	254564276
25	NC_012989	CGGCG	2	10	26351	26360	0 %	0 %	60 %	40 %	254564278
26	NC_012989	ACCAG	2	10	26821	26830	40 %	0 %	20 %	40 %	254564279
27	NC_012989	ACGTC	2	10	27241	27250	20 %	20 %	20 %	40 %	254564279
28	NC_012989	GGCAA	2	10	28305	28314	40 %	0 %	40 %	20 %	254564281
29	NC_012989	CGGCG	2	10	28511	28520	0 %	0 %	60 %	40 %	254564281
30	NC_012989	CCGGC	2	10	29000	29009	0 %	0 %	40 %	60 %	254564282
31	NC_012989	CGGCA	2	10	29474	29483	20 %	0 %	40 %	40 %	254564283
32	NC_012989	ACCGG	2	10	29836	29845	20 %	0 %	40 %	40 %	254564283
33	NC_012989	TCGGC	2	10	32044	32053	0 %	20 %	40 %	40 %	254564286
34	NC_012989	TGGTC	2	10	32056	32065	0 %	40 %	40 %	20 %	254564286
35	NC_012989	GCGGT	2	10	32534	32543	0 %	20 %	60 %	20 %	254564286
36	NC_012989	GGCTG	2	10	36480	36489	0 %	20 %	60 %	20 %	254564290

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.