MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methylobacterium extorquens DM4 plasmid p2METDI

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012989	CACC	2	8	494	501	25 %	0 %	0 %	75 %	254564254
2	NC_012989	CGAT	2	8	574	581	25 %	25 %	25 %	25 %	254564254
3	NC_012989	CGAT	2	8	1037	1044	25 %	25 %	25 %	25 %	254564255
4	NC_012989	CGAC	2	8	1150	1157	25 %	0 %	25 %	50 %	254564255
5	NC_012989	GATC	2	8	1762	1769	25 %	25 %	25 %	25 %	254564255
6	NC_012989	CGAT	2	8	1809	1816	25 %	25 %	25 %	25 %	254564255
7	NC_012989	TGTT	2	8	2261	2268	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012989	ACGG	2	8	2622	2629	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_012989	TGCT	2	8	2653	2660	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_012989	CATC	2	8	2944	2951	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_012989	AACG	2	8	3039	3046	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_012989	CATG	2	8	3056	3063	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012989	GGCC	2	8	3548	3555	0 %	0 %	50 %	50 %	254564256
14	NC_012989	GCTC	2	8	3615	3622	0 %	25 %	25 %	50 %	254564256
15	NC_012989	AGCA	2	8	3805	3812	50 %	0 %	25 %	25 %	254564256
16	NC_012989	GAGC	2	8	4053	4060	25 %	0 %	50 %	25 %	254564256
17	NC_012989	CGTG	2	8	4098	4105	0 %	25 %	50 %	25 %	254564256
18	NC_012989	ACGG	2	8	4221	4228	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_012989	CTTG	2	8	4806	4813	0 %	50 %	25 %	25 %	254564258
20	NC_012989	TGCT	2	8	5109	5116	0 %	50 %	25 %	25 %	254564258
21	NC_012989	AGGA	2	8	5131	5138	50 %	0 %	50 %	0 %	254564258
22	NC_012989	CCGG	2	8	5221	5228	0 %	0 %	50 %	50 %	254564258
23	NC_012989	CGCA	2	8	5705	5712	25 %	0 %	25 %	50 %	254564259
24	NC_012989	CGGG	2	8	6542	6549	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_012989	CGTT	2	8	6608	6615	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012989	ACGC	2	8	6744	6751	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012989	GCTG	2	8	6803	6810	0 %	25 %	50 %	25 %	254564260
28	NC_012989	CTCC	2	8	6937	6944	0 %	25 %	0 %	75 %	254564260
29	NC_012989	GGCC	2	8	7422	7429	0 %	0 %	50 %	50 %	254564261
30	NC_012989	TGCC	2	8	7536	7543	0 %	25 %	25 %	50 %	254564261
31	NC_012989	CCAC	2	8	7779	7786	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_012989	CGGC	2	8	7793	7800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012989	CAGG	2	8	8139	8146	25 %	0 %	50 %	25 %	254564262
34	NC_012989	TCGA	2	8	8321	8328	25 %	25 %	25 %	25 %	254564262
35	NC_012989	CTGC	2	8	8441	8448	0 %	25 %	25 %	50 %	254564262
36	NC_012989	GACC	2	8	9424	9431	25 %	0 %	25 %	50 %	254564264
37	NC_012989	CGGT	2	8	9612	9619	0 %	25 %	50 %	25 %	254564264
38	NC_012989	AAGG	2	8	9999	10006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012989	CCCG	2	8	10605	10612	0 %	0 %	25 %	75 %	254564265
40	NC_012989	GGAA	2	8	10901	10908	50 %	0 %	50 %	0 %	254564265
41	NC_012989	CCCG	2	8	11399	11406	0 %	0 %	25 %	75 %	254564267
42	NC_012989	CGGC	2	8	11466	11473	0 %	0 %	50 %	50 %	254564267
43	NC_012989	CAGC	2	8	11619	11626	25 %	0 %	25 %	50 %	254564267
44	NC_012989	CAGC	2	8	12111	12118	25 %	0 %	25 %	50 %	254564267
45	NC_012989	GGCT	2	8	12146	12153	0 %	25 %	50 %	25 %	254564267
46	NC_012989	CCGG	2	8	12293	12300	0 %	0 %	50 %	50 %	254564267
47	NC_012989	GGTA	2	8	12467	12474	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012989	CGGA	2	8	12766	12773	25 %	0 %	50 %	25 %	254564268
49	NC_012989	GCCG	2	8	13046	13053	0 %	0 %	50 %	50 %	254564268
50	NC_012989	GCTG	2	8	13523	13530	0 %	25 %	50 %	25 %	254564268
51	NC_012989	CCTG	2	8	13573	13580	0 %	25 %	25 %	50 %	254564268
52	NC_012989	GCCC	2	8	14320	14327	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_012989	CCCA	2	8	14356	14363	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_012989	CCTG	2	8	14957	14964	0 %	25 %	25 %	50 %	254564269
55	NC_012989	GCCA	2	8	14970	14977	25 %	0 %	25 %	50 %	254564269
56	NC_012989	ACGG	2	8	15131	15138	25 %	0 %	50 %	25 %	254564269
57	NC_012989	CGGG	2	8	15609	15616	0 %	0 %	75 %	25 %	254564269
58	NC_012989	GCGG	2	8	15663	15670	0 %	0 %	75 %	25 %	254564269
59	NC_012989	TGCC	2	8	15749	15756	0 %	25 %	25 %	50 %	254564269
60	NC_012989	GCCC	2	8	16149	16156	0 %	0 %	25 %	75 %	254564270
61	NC_012989	TTGA	2	8	16896	16903	25 %	50 %	25 %	0 %	254564270
62	NC_012989	TTGG	2	8	17603	17610	0 %	50 %	50 %	0 %	254564271
63	NC_012989	GGCT	2	8	17796	17803	0 %	25 %	50 %	25 %	254564271
64	NC_012989	GTTG	2	8	18230	18237	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012989	ACCG	2	8	18528	18535	25 %	0 %	25 %	50 %	254564272
66	NC_012989	GCGG	2	8	19922	19929	0 %	0 %	75 %	25 %	254564273
67	NC_012989	GGGT	2	8	20218	20225	0 %	25 %	75 %	0 %	254564274
68	NC_012989	AGGC	2	8	21186	21193	25 %	0 %	50 %	25 %	254564276
69	NC_012989	GCCC	2	8	21198	21205	0 %	0 %	25 %	75 %	254564276
70	NC_012989	CGGC	2	8	21714	21721	0 %	0 %	50 %	50 %	254564276
71	NC_012989	GCCG	2	8	21763	21770	0 %	0 %	50 %	50 %	254564276
72	NC_012989	GAGC	2	8	21940	21947	25 %	0 %	50 %	25 %	254564276
73	NC_012989	GGCC	2	8	22318	22325	0 %	0 %	50 %	50 %	254564276
74	NC_012989	GCAG	2	8	22345	22352	25 %	0 %	50 %	25 %	254564276
75	NC_012989	CGGC	2	8	22552	22559	0 %	0 %	50 %	50 %	254564276
76	NC_012989	GGCG	2	8	23023	23030	0 %	0 %	75 %	25 %	254564276
77	NC_012989	GGAG	2	8	23110	23117	25 %	0 %	75 %	0 %	254564276
78	NC_012989	GTTG	2	8	23236	23243	0 %	50 %	50 %	0 %	254564276
79	NC_012989	CTGG	2	8	23304	23311	0 %	25 %	50 %	25 %	254564276
80	NC_012989	GGAG	2	8	23377	23384	25 %	0 %	75 %	0 %	254564276
81	NC_012989	ACCG	2	8	23801	23808	25 %	0 %	25 %	50 %	254564276
82	NC_012989	TGCG	2	8	24174	24181	0 %	25 %	50 %	25 %	254564276
83	NC_012989	GAAT	2	8	24480	24487	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012989	TCCC	2	8	24988	24995	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_012989	GACG	2	8	25661	25668	25 %	0 %	50 %	25 %	254564277
86	NC_012989	CCTG	2	8	25838	25845	0 %	25 %	25 %	50 %	254564277
87	NC_012989	GCCC	2	8	26812	26819	0 %	0 %	25 %	75 %	254564279
88	NC_012989	CCCG	2	8	26953	26960	0 %	0 %	25 %	75 %	254564279
89	NC_012989	GGAT	2	8	27627	27634	25 %	25 %	50 %	0 %	254564279
90	NC_012989	CGGC	2	8	27891	27898	0 %	0 %	50 %	50 %	254564280
91	NC_012989	GCGG	2	8	27929	27936	0 %	0 %	75 %	25 %	254564280
92	NC_012989	CCGG	2	8	28222	28229	0 %	0 %	50 %	50 %	254564281
93	NC_012989	GCCG	2	8	28460	28467	0 %	0 %	50 %	50 %	254564281
94	NC_012989	GCTG	2	8	28612	28619	0 %	25 %	50 %	25 %	254564281
95	NC_012989	GCCG	2	8	28983	28990	0 %	0 %	50 %	50 %	254564282
96	NC_012989	CGTT	2	8	29288	29295	0 %	50 %	25 %	25 %	254564283
97	NC_012989	GCCG	2	8	29702	29709	0 %	0 %	50 %	50 %	254564283
98	NC_012989	ATCG	2	8	29887	29894	25 %	25 %	25 %	25 %	254564283
99	NC_012989	CATG	2	8	30022	30029	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_012989	CGTC	2	8	30228	30235	0 %	25 %	25 %	50 %	254564284
101	NC_012989	CATG	2	8	30668	30675	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_012989	CCGG	2	8	30742	30749	0 %	0 %	50 %	50 %	254564285
103	NC_012989	TTCC	2	8	30842	30849	0 %	50 %	0 %	50 %	254564285
104	NC_012989	ACGA	2	8	30971	30978	50 %	0 %	25 %	25 %	254564285
105	NC_012989	CGAG	2	8	31226	31233	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_012989	TGCG	2	8	31535	31542	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_012989	CGTG	2	8	31610	31617	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_012989	GCAG	2	8	31673	31680	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_012989	GGTC	2	8	32404	32411	0 %	25 %	50 %	25 %	254564286
110	NC_012989	GTCG	2	8	32594	32601	0 %	25 %	50 %	25 %	254564286
111	NC_012989	GTGG	2	8	32711	32718	0 %	25 %	75 %	0 %	254564286
112	NC_012989	GGCT	2	8	32727	32734	0 %	25 %	50 %	25 %	254564286
113	NC_012989	GTCC	2	8	33456	33463	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_012989	CGGA	2	8	33632	33639	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_012989	TTTG	2	8	33860	33867	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012989	CTGA	2	8	34073	34080	25 %	25 %	25 %	25 %	254564287
117	NC_012989	CATT	2	8	34640	34647	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_012989	GCCA	2	8	34745	34752	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_012989	CCGC	2	8	35103	35110	0 %	0 %	25 %	75 %	254564289
120	NC_012989	CAGC	2	8	35154	35161	25 %	0 %	25 %	50 %	254564289
121	NC_012989	GATG	2	8	35304	35311	25 %	25 %	50 %	0 %	254564289
122	NC_012989	CCCA	2	8	35599	35606	25 %	0 %	0 %	75 %	254564289
123	NC_012989	GCGA	2	8	35862	35869	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_012989	GATG	2	8	36146	36153	25 %	25 %	50 %	0 %	254564290
125	NC_012989	CGGG	2	8	36258	36265	0 %	0 %	75 %	25 %	254564290
126	NC_012989	GCCA	2	8	36452	36459	25 %	0 %	25 %	50 %	254564290
127	NC_012989	CGAC	2	8	37202	37209	25 %	0 %	25 %	50 %	254564290
128	NC_012989	CGCT	2	8	37857	37864	0 %	25 %	25 %	50 %	254564290
129	NC_012989	CGAG	2	8	37874	37881	25 %	0 %	50 %	25 %	254564290
130	NC_012989	GCTG	3	12	38141	38152	0 %	25 %	50 %	25 %	254564290
131	NC_012989	TGAA	2	8	38201	38208	50 %	25 %	25 %	0 %	254564290
132	NC_012989	CCGG	2	8	38236	38243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.