MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methylobacterium extorquens DM4 plasmid p2METDI

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012989	GC	3	6	125	130	0 %	0 %	50 %	50 %	254564254
2	NC_012989	GC	3	6	413	418	0 %	0 %	50 %	50 %	254564254
3	NC_012989	AC	3	6	462	467	50 %	0 %	0 %	50 %	254564254
4	NC_012989	TC	3	6	623	628	0 %	50 %	0 %	50 %	254564254
5	NC_012989	GC	3	6	951	956	0 %	0 %	50 %	50 %	254564254
6	NC_012989	CG	4	8	989	996	0 %	0 %	50 %	50 %	254564254
7	NC_012989	CG	3	6	1355	1360	0 %	0 %	50 %	50 %	254564255
8	NC_012989	GC	3	6	1375	1380	0 %	0 %	50 %	50 %	254564255
9	NC_012989	CG	3	6	1530	1535	0 %	0 %	50 %	50 %	254564255
10	NC_012989	GC	3	6	3402	3407	0 %	0 %	50 %	50 %	254564256
11	NC_012989	GC	3	6	5117	5122	0 %	0 %	50 %	50 %	254564258
12	NC_012989	TG	3	6	5448	5453	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012989	CA	3	6	5560	5565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_012989	CG	3	6	5922	5927	0 %	0 %	50 %	50 %	254564259
15	NC_012989	GC	3	6	6053	6058	0 %	0 %	50 %	50 %	254564259
16	NC_012989	GC	3	6	6076	6081	0 %	0 %	50 %	50 %	254564259
17	NC_012989	GC	4	8	6257	6264	0 %	0 %	50 %	50 %	254564259
18	NC_012989	CG	3	6	6533	6538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_012989	GC	3	6	6841	6846	0 %	0 %	50 %	50 %	254564260
20	NC_012989	GC	3	6	6889	6894	0 %	0 %	50 %	50 %	254564260
21	NC_012989	CG	3	6	7126	7131	0 %	0 %	50 %	50 %	254564260
22	NC_012989	CG	3	6	7187	7192	0 %	0 %	50 %	50 %	254564260
23	NC_012989	CG	4	8	7283	7290	0 %	0 %	50 %	50 %	254564260
24	NC_012989	CG	3	6	9245	9250	0 %	0 %	50 %	50 %	254564264
25	NC_012989	GC	4	8	10036	10043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_012989	CG	3	6	10127	10132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012989	GC	3	6	10787	10792	0 %	0 %	50 %	50 %	254564265
28	NC_012989	GT	3	6	11328	11333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012989	CT	3	6	11862	11867	0 %	50 %	0 %	50 %	254564267
30	NC_012989	GC	3	6	11966	11971	0 %	0 %	50 %	50 %	254564267
31	NC_012989	CG	3	6	12200	12205	0 %	0 %	50 %	50 %	254564267
32	NC_012989	GT	3	6	12539	12544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012989	GC	3	6	12680	12685	0 %	0 %	50 %	50 %	254564268
34	NC_012989	CG	4	8	12774	12781	0 %	0 %	50 %	50 %	254564268
35	NC_012989	TC	3	6	13112	13117	0 %	50 %	0 %	50 %	254564268
36	NC_012989	CG	3	6	13561	13566	0 %	0 %	50 %	50 %	254564268
37	NC_012989	GT	3	6	14704	14709	0 %	50 %	50 %	0 %	254564269
38	NC_012989	CG	3	6	14729	14734	0 %	0 %	50 %	50 %	254564269
39	NC_012989	GC	4	8	14767	14774	0 %	0 %	50 %	50 %	254564269
40	NC_012989	GC	3	6	15296	15301	0 %	0 %	50 %	50 %	254564269
41	NC_012989	CG	3	6	15430	15435	0 %	0 %	50 %	50 %	254564269
42	NC_012989	AC	3	6	15813	15818	50 %	0 %	0 %	50 %	254564269
43	NC_012989	GT	3	6	16904	16909	0 %	50 %	50 %	0 %	254564270
44	NC_012989	TC	3	6	17038	17043	0 %	50 %	0 %	50 %	254564270
45	NC_012989	CG	3	6	17173	17178	0 %	0 %	50 %	50 %	254564271
46	NC_012989	GA	3	6	17401	17406	50 %	0 %	50 %	0 %	254564271
47	NC_012989	GA	3	6	17485	17490	50 %	0 %	50 %	0 %	254564271
48	NC_012989	GC	3	6	18121	18126	0 %	0 %	50 %	50 %	254564271
49	NC_012989	CA	3	6	18325	18330	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012989	CG	3	6	19898	19903	0 %	0 %	50 %	50 %	254564273
51	NC_012989	GC	4	8	19999	20006	0 %	0 %	50 %	50 %	254564273
52	NC_012989	GC	3	6	20126	20131	0 %	0 %	50 %	50 %	254564274
53	NC_012989	CG	4	8	20151	20158	0 %	0 %	50 %	50 %	254564274
54	NC_012989	CG	3	6	20274	20279	0 %	0 %	50 %	50 %	254564274
55	NC_012989	GC	3	6	20471	20476	0 %	0 %	50 %	50 %	254564274
56	NC_012989	AG	3	6	20618	20623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012989	CG	3	6	21414	21419	0 %	0 %	50 %	50 %	254564276
58	NC_012989	GC	3	6	21652	21657	0 %	0 %	50 %	50 %	254564276
59	NC_012989	CG	3	6	21896	21901	0 %	0 %	50 %	50 %	254564276
60	NC_012989	CG	3	6	22055	22060	0 %	0 %	50 %	50 %	254564276
61	NC_012989	GC	3	6	22145	22150	0 %	0 %	50 %	50 %	254564276
62	NC_012989	GC	3	6	22567	22572	0 %	0 %	50 %	50 %	254564276
63	NC_012989	GC	3	6	22624	22629	0 %	0 %	50 %	50 %	254564276
64	NC_012989	CG	3	6	22932	22937	0 %	0 %	50 %	50 %	254564276
65	NC_012989	CG	3	6	23165	23170	0 %	0 %	50 %	50 %	254564276
66	NC_012989	GC	4	8	23323	23330	0 %	0 %	50 %	50 %	254564276
67	NC_012989	CG	3	6	23409	23414	0 %	0 %	50 %	50 %	254564276
68	NC_012989	GC	3	6	23607	23612	0 %	0 %	50 %	50 %	254564276
69	NC_012989	GC	3	6	23831	23836	0 %	0 %	50 %	50 %	254564276
70	NC_012989	GC	3	6	24012	24017	0 %	0 %	50 %	50 %	254564276
71	NC_012989	CG	4	8	24231	24238	0 %	0 %	50 %	50 %	254564276
72	NC_012989	TA	3	6	24489	24494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012989	TA	4	8	24534	24541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012989	TA	3	6	24729	24734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012989	TA	3	6	24927	24932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012989	GC	3	6	25938	25943	0 %	0 %	50 %	50 %	254564277
77	NC_012989	CG	3	6	26099	26104	0 %	0 %	50 %	50 %	254564277
78	NC_012989	GC	3	6	26920	26925	0 %	0 %	50 %	50 %	254564279
79	NC_012989	GC	3	6	29020	29025	0 %	0 %	50 %	50 %	254564282
80	NC_012989	GA	3	6	29824	29829	50 %	0 %	50 %	0 %	254564283
81	NC_012989	CG	3	6	30099	30104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_012989	CT	3	6	31881	31886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_012989	TG	4	8	32248	32255	0 %	50 %	50 %	0 %	254564286
84	NC_012989	AC	3	6	32517	32522	50 %	0 %	0 %	50 %	254564286
85	NC_012989	GC	3	6	32844	32849	0 %	0 %	50 %	50 %	254564286
86	NC_012989	GC	3	6	32936	32941	0 %	0 %	50 %	50 %	254564286
87	NC_012989	CG	3	6	33088	33093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_012989	GC	3	6	33164	33169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_012989	CA	3	6	33811	33816	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_012989	CG	3	6	34055	34060	0 %	0 %	50 %	50 %	254564287
91	NC_012989	TC	3	6	34689	34694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_012989	GT	3	6	34958	34963	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012989	GC	3	6	35343	35348	0 %	0 %	50 %	50 %	254564289
94	NC_012989	CG	3	6	36320	36325	0 %	0 %	50 %	50 %	254564290
95	NC_012989	CG	3	6	37392	37397	0 %	0 %	50 %	50 %	254564290
96	NC_012989	GC	4	8	37694	37701	0 %	0 %	50 %	50 %	254564290
97	NC_012989	CG	3	6	38453	38458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_012989	CG	3	6	38486	38491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.