MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methylobacterium extorquens DM4

Total Repeats: 6125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012988	CCGGC	3	15	1011	1025	0 %	0 %	40 %	60 %	254558654
2	NC_012988	GCCCG	2	10	1114	1123	0 %	0 %	40 %	60 %	254558654
3	NC_012988	TCGCC	2	10	1140	1149	0 %	20 %	20 %	60 %	254558654
4	NC_012988	ACCAC	2	10	2109	2118	40 %	0 %	0 %	60 %	254558654
5	NC_012988	CGCGG	2	10	4111	4120	0 %	0 %	60 %	40 %	254558656
6	NC_012988	GGCCG	2	10	4795	4804	0 %	0 %	60 %	40 %	254558656
7	NC_012988	TTCCG	2	10	5566	5575	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_012988	CGCGC	2	10	5625	5634	0 %	0 %	40 %	60 %	254558659
9	NC_012988	ACCCG	2	10	6256	6265	20 %	0 %	20 %	60 %	254558659
10	NC_012988	GCCCT	2	10	6378	6387	0 %	20 %	20 %	60 %	254558659
11	NC_012988	GGCGA	2	10	6762	6771	20 %	0 %	60 %	20 %	254558659
12	NC_012988	GACGG	2	10	6822	6831	20 %	0 %	60 %	20 %	254558659
13	NC_012988	GCCGA	2	10	7146	7155	20 %	0 %	40 %	40 %	254558659
14	NC_012988	TCCAA	2	10	7640	7649	40 %	20 %	0 %	40 %	254558660
15	NC_012988	CGGTC	2	10	11437	11446	0 %	20 %	40 %	40 %	254558663
16	NC_012988	GGCGC	2	10	11645	11654	0 %	0 %	60 %	40 %	254558663
17	NC_012988	GATCG	2	10	12645	12654	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_012988	GCCAC	2	10	14366	14375	20 %	0 %	20 %	60 %	254558664
19	NC_012988	TCTGA	2	10	15204	15213	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_012988	TCTGC	2	10	15739	15748	0 %	40 %	20 %	40 %	254558667
21	NC_012988	GGGCC	2	10	15838	15847	0 %	0 %	60 %	40 %	254558667
22	NC_012988	GCCGG	2	10	17003	17012	0 %	0 %	60 %	40 %	254558668
23	NC_012988	AAGCG	2	10	17781	17790	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_012988	CGCCC	2	10	18084	18093	0 %	0 %	20 %	80 %	254558669
25	NC_012988	GCGCC	2	10	18558	18567	0 %	0 %	40 %	60 %	254558669
26	NC_012988	GGCAT	2	10	18812	18821	20 %	20 %	40 %	20 %	254558669
27	NC_012988	CCGGC	2	10	19565	19574	0 %	0 %	40 %	60 %	254558670
28	NC_012988	GACGA	2	10	20855	20864	40 %	0 %	40 %	20 %	254558670
29	NC_012988	GCTCG	2	10	23003	23012	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_012988	CGCTC	2	10	23067	23076	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_012988	CCGCG	2	10	24129	24138	0 %	0 %	40 %	60 %	254558672
32	NC_012988	CCGCG	2	10	25283	25292	0 %	0 %	40 %	60 %	254558673
33	NC_012988	CGCCC	2	10	26548	26557	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
34	NC_012988	CGCGG	2	10	28400	28409	0 %	0 %	60 %	40 %	254558675
35	NC_012988	GCAGA	2	10	30298	30307	40 %	0 %	40 %	20 %	254558678
36	NC_012988	TGCGC	2	10	32468	32477	0 %	20 %	40 %	40 %	254558681
37	NC_012988	GCGAG	2	10	32524	32533	20 %	0 %	60 %	20 %	254558681
38	NC_012988	GCGGT	2	10	33570	33579	0 %	20 %	60 %	20 %	254558682
39	NC_012988	GTCGC	2	10	34776	34785	0 %	20 %	40 %	40 %	254558682
40	NC_012988	GGCCG	2	10	34919	34928	0 %	0 %	60 %	40 %	254558682
41	NC_012988	ACCGC	2	10	35058	35067	20 %	0 %	20 %	60 %	254558682
42	NC_012988	CAGGA	2	10	35554	35563	40 %	0 %	40 %	20 %	254558683
43	NC_012988	CGCGC	2	10	37002	37011	0 %	0 %	40 %	60 %	254558685
44	NC_012988	GGCCG	2	10	37133	37142	0 %	0 %	60 %	40 %	254558685
45	NC_012988	CCGGC	2	10	37500	37509	0 %	0 %	40 %	60 %	254558686
46	NC_012988	TCGCT	2	10	37510	37519	0 %	40 %	20 %	40 %	254558686
47	NC_012988	GCGCC	2	10	37558	37567	0 %	0 %	40 %	60 %	254558686
48	NC_012988	GCCGT	2	10	37680	37689	0 %	20 %	40 %	40 %	254558686
49	NC_012988	TGACC	2	10	37880	37889	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_012988	CTCGG	2	10	38265	38274	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_012988	TGACC	2	10	38647	38656	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_012988	ATGGC	2	10	40357	40366	20 %	20 %	40 %	20 %	254558690
53	NC_012988	TGGCT	2	10	41911	41920	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_012988	TTGGC	2	10	42100	42109	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_012988	CGCAC	2	10	42190	42199	20 %	0 %	20 %	60 %	254558692
56	NC_012988	GCCAT	2	10	42485	42494	20 %	20 %	20 %	40 %	254558692
57	NC_012988	CAGGG	2	10	43979	43988	20 %	0 %	60 %	20 %	254558695
58	NC_012988	AGGAT	2	10	44752	44761	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012988	ATGGG	2	10	44806	44815	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012988	CCTGC	2	10	45587	45596	0 %	20 %	20 %	60 %	254558696
61	NC_012988	CCGAG	2	10	46741	46750	20 %	0 %	40 %	40 %	254558697
62	NC_012988	GACCG	2	10	49956	49965	20 %	0 %	40 %	40 %	254558700
63	NC_012988	CCGGC	2	10	50021	50030	0 %	0 %	40 %	60 %	254558700
64	NC_012988	TTGGC	2	10	50221	50230	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_012988	GCGCC	2	10	51038	51047	0 %	0 %	40 %	60 %	254558702
66	NC_012988	GGCGC	2	10	56086	56095	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_012988	GCCAC	2	10	56308	56317	20 %	0 %	20 %	60 %	254558708
68	NC_012988	CGGCG	2	10	58985	58994	0 %	0 %	60 %	40 %	254558710
69	NC_012988	TGACC	2	10	59846	59855	20 %	20 %	20 %	40 %	254558710
70	NC_012988	GAGTT	2	10	60766	60775	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012988	TGATC	2	10	61304	61313	20 %	40 %	20 %	20 %	254558711
72	NC_012988	AGGCC	2	10	62965	62974	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_012988	CGTGC	2	10	63204	63213	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_012988	GCGCC	2	10	63352	63361	0 %	0 %	40 %	60 %	254558713
75	NC_012988	CGACC	2	10	63859	63868	20 %	0 %	20 %	60 %	254558713
76	NC_012988	CCGTT	2	10	64359	64368	0 %	40 %	20 %	40 %	254558714
77	NC_012988	GGCCG	2	10	66528	66537	0 %	0 %	60 %	40 %	254558715
78	NC_012988	CCGCG	2	10	69107	69116	0 %	0 %	40 %	60 %	254558719
79	NC_012988	CGCGC	2	10	70140	70149	0 %	0 %	40 %	60 %	254558719
80	NC_012988	TCGCG	2	10	70299	70308	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_012988	TCGGT	2	10	70448	70457	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_012988	CGCGC	2	10	72382	72391	0 %	0 %	40 %	60 %	254558721
83	NC_012988	GGCCG	2	10	73502	73511	0 %	0 %	60 %	40 %	254558723
84	NC_012988	AAGCG	2	10	74375	74384	40 %	0 %	40 %	20 %	254558724
85	NC_012988	GGCGG	2	10	74647	74656	0 %	0 %	80 %	20 %	254558725
86	NC_012988	GCAAC	2	10	75087	75096	40 %	0 %	20 %	40 %	254558725
87	NC_012988	GAGCC	2	10	75402	75411	20 %	0 %	40 %	40 %	254558725
88	NC_012988	GGCGC	2	10	75636	75645	0 %	0 %	60 %	40 %	254558726
89	NC_012988	ACCGA	2	10	76899	76908	40 %	0 %	20 %	40 %	254558727
90	NC_012988	CGCTC	2	10	77083	77092	0 %	20 %	20 %	60 %	254558727
91	NC_012988	GGCCG	2	10	79940	79949	0 %	0 %	60 %	40 %	254558729
92	NC_012988	CCGGC	2	10	80327	80336	0 %	0 %	40 %	60 %	254558729
93	NC_012988	ACGCG	2	10	80601	80610	20 %	0 %	40 %	40 %	254558729
94	NC_012988	CCGTC	2	10	80914	80923	0 %	20 %	20 %	60 %	254558730
95	NC_012988	CCGCG	2	10	81490	81499	0 %	0 %	40 %	60 %	254558730
96	NC_012988	ACGCC	2	10	81942	81951	20 %	0 %	20 %	60 %	254558730
97	NC_012988	CACCG	2	10	84926	84935	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
98	NC_012988	TCGAC	2	10	86073	86082	20 %	20 %	20 %	40 %	254558734
99	NC_012988	CCAAG	2	10	86696	86705	40 %	0 %	20 %	40 %	254558735
100	NC_012988	GGCGC	2	10	89513	89522	0 %	0 %	60 %	40 %	254558736
101	NC_012988	CGATC	2	10	91654	91663	20 %	20 %	20 %	40 %	254558738
102	NC_012988	CGCGG	2	10	92024	92033	0 %	0 %	60 %	40 %	254558739
103	NC_012988	CGGGC	2	10	92636	92645	0 %	0 %	60 %	40 %	254558739
104	NC_012988	CGGCC	2	10	93234	93243	0 %	0 %	40 %	60 %	254558739
105	NC_012988	CGCCA	2	10	93688	93697	20 %	0 %	20 %	60 %	254558739
106	NC_012988	CCGCA	2	10	95399	95408	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
107	NC_012988	TCGGC	2	10	95589	95598	0 %	20 %	40 %	40 %	254558741
108	NC_012988	GCGCG	2	10	96235	96244	0 %	0 %	60 %	40 %	254558741
109	NC_012988	CGGCG	2	10	96542	96551	0 %	0 %	60 %	40 %	254558741
110	NC_012988	GCTGC	2	10	98246	98255	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_012988	GCCGC	2	10	99321	99330	0 %	0 %	40 %	60 %	254558743
112	NC_012988	GCCGG	2	10	100145	100154	0 %	0 %	60 %	40 %	254558744
113	NC_012988	GCGCG	2	10	100265	100274	0 %	0 %	60 %	40 %	254558744
114	NC_012988	CAGCG	2	10	100975	100984	20 %	0 %	40 %	40 %	254558744
115	NC_012988	GCCGA	2	10	101513	101522	20 %	0 %	40 %	40 %	254558744
116	NC_012988	CCGAT	2	10	102386	102395	20 %	20 %	20 %	40 %	254558745
117	NC_012988	CCCGC	2	10	104504	104513	0 %	0 %	20 %	80 %	254558747
118	NC_012988	CGTGG	2	10	105324	105333	0 %	20 %	60 %	20 %	254558748
119	NC_012988	GCGCG	2	10	105372	105381	0 %	0 %	60 %	40 %	254558748
120	NC_012988	GCCGG	2	10	106127	106136	0 %	0 %	60 %	40 %	254558749
121	NC_012988	GCCCT	2	10	106666	106675	0 %	20 %	20 %	60 %	254558750
122	NC_012988	ATCGC	2	10	108966	108975	20 %	20 %	20 %	40 %	254558751
123	NC_012988	GGCAG	2	10	110562	110571	20 %	0 %	60 %	20 %	254558754
124	NC_012988	CGGCG	2	10	113268	113277	0 %	0 %	60 %	40 %	254558757
125	NC_012988	TGCGG	2	10	115667	115676	0 %	20 %	60 %	20 %	254558761
126	NC_012988	CGAGG	2	10	116417	116426	20 %	0 %	60 %	20 %	254558762
127	NC_012988	TCGTC	2	10	117424	117433	0 %	40 %	20 %	40 %	254558763
128	NC_012988	CTCGC	2	10	117599	117608	0 %	20 %	20 %	60 %	254558763
129	NC_012988	CCGAC	2	10	118293	118302	20 %	0 %	20 %	60 %	254558763
130	NC_012988	GGCCG	2	10	119528	119537	0 %	0 %	60 %	40 %	254558765
131	NC_012988	CCGAC	2	10	120762	120771	20 %	0 %	20 %	60 %	254558765
132	NC_012988	GCCCA	2	10	122009	122018	20 %	0 %	20 %	60 %	254558765
133	NC_012988	GAACG	2	10	122940	122949	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_012988	GCGAG	2	10	124120	124129	20 %	0 %	60 %	20 %	254558768
135	NC_012988	CACGC	2	10	124717	124726	20 %	0 %	20 %	60 %	254558768
136	NC_012988	AACCG	2	10	124739	124748	40 %	0 %	20 %	40 %	254558768
137	NC_012988	TGGTG	2	10	125264	125273	0 %	40 %	60 %	0 %	254558769
138	NC_012988	GAGAG	2	10	127457	127466	40 %	0 %	60 %	0 %	254558771
139	NC_012988	GCGCA	2	10	127801	127810	20 %	0 %	40 %	40 %	254558772
140	NC_012988	GCTCC	2	10	128205	128214	0 %	20 %	20 %	60 %	254558772
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142	NC_012988	GGATC	2	10	129508	129517	20 %	20 %	40 %	20 %	254558773
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154	NC_012988	AGCTT	2	10	138993	139002	20 %	40 %	20 %	20 %	254558782
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158	NC_012988	GGTCA	2	10	141551	141560	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
159	NC_012988	ACGCC	2	10	142680	142689	20 %	0 %	20 %	60 %	254558787
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179	NC_012988	GGTAC	2	10	157492	157501	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
180	NC_012988	TGGTC	2	10	158031	158040	0 %	40 %	40 %	20 %	254558797
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238	NC_012988	AGCGC	2	10	205701	205710	20 %	0 %	40 %	40 %	254558840
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242	NC_012988	CGAGG	2	10	208548	208557	20 %	0 %	60 %	20 %	254558841
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245	NC_012988	TCCGT	2	10	209545	209554	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
246	NC_012988	GCGGA	2	10	210321	210330	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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249	NC_012988	GCGAA	2	10	213726	213735	40 %	0 %	40 %	20 %	254558847
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251	NC_012988	CGGGA	2	10	216012	216021	20 %	0 %	60 %	20 %	254558850
252	NC_012988	ACCGA	2	10	216133	216142	40 %	0 %	20 %	40 %	254558850
253	NC_012988	ACGCG	2	10	217570	217579	20 %	0 %	40 %	40 %	254558851
254	NC_012988	CGGCT	2	10	218046	218055	0 %	20 %	40 %	40 %	254558851
255	NC_012988	CACGC	2	10	218164	218173	20 %	0 %	20 %	60 %	254558851
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257	NC_012988	TCGAT	2	10	219430	219439	20 %	40 %	20 %	20 %	254558851
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261	NC_012988	CACGG	2	10	222907	222916	20 %	0 %	40 %	40 %	254558856
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263	NC_012988	CGCTG	2	10	226216	226225	0 %	20 %	40 %	40 %	254558858
264	NC_012988	TCTCC	2	10	229234	229243	0 %	40 %	0 %	60 %	254558860
265	NC_012988	CCCTC	2	10	230272	230281	0 %	20 %	0 %	80 %	254558862
266	NC_012988	CCCGC	2	10	232362	232371	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
267	NC_012988	AGCCG	2	10	233853	233862	20 %	0 %	40 %	40 %	254558866
268	NC_012988	TGCGC	2	10	235269	235278	0 %	20 %	40 %	40 %	254558868
269	NC_012988	GGCGC	2	10	235814	235823	0 %	0 %	60 %	40 %	254558868
270	NC_012988	CGACC	2	10	236882	236891	20 %	0 %	20 %	60 %	254558870
271	NC_012988	GCTGC	2	10	237505	237514	0 %	20 %	40 %	40 %	254558871
272	NC_012988	CGCGC	2	10	237568	237577	0 %	0 %	40 %	60 %	254558871
273	NC_012988	CGGCT	2	10	237956	237965	0 %	20 %	40 %	40 %	254558871
274	NC_012988	CCGCG	2	10	239812	239821	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
275	NC_012988	TTCCG	2	10	240238	240247	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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277	NC_012988	CCGCG	2	10	244730	244739	0 %	0 %	40 %	60 %	254558881
278	NC_012988	GATGC	2	10	244851	244860	20 %	20 %	40 %	20 %	254558882
279	NC_012988	CTGTC	2	10	245090	245099	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
280	NC_012988	TACCG	2	10	248178	248187	20 %	20 %	20 %	40 %	254558886
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282	NC_012988	GCGCC	2	10	250588	250597	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
283	NC_012988	CGAGC	2	10	251479	251488	20 %	0 %	40 %	40 %	254558888
284	NC_012988	CGGCC	2	10	253950	253959	0 %	0 %	40 %	60 %	254558889
285	NC_012988	CCAGC	2	10	257107	257116	20 %	0 %	20 %	60 %	254558892
286	NC_012988	TGCCA	2	10	257143	257152	20 %	20 %	20 %	40 %	254558892
287	NC_012988	ACCGG	2	10	257226	257235	20 %	0 %	40 %	40 %	254558892
288	NC_012988	CGCTT	2	10	257880	257889	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
289	NC_012988	CGAAG	2	10	260881	260890	40 %	0 %	40 %	20 %	254558898
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291	NC_012988	GCCTC	2	10	263719	263728	0 %	20 %	20 %	60 %	254558902
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293	NC_012988	GGCAT	2	10	265769	265778	20 %	20 %	40 %	20 %	254558905
294	NC_012988	GAACC	2	10	266627	266636	40 %	0 %	20 %	40 %	254558906
295	NC_012988	TGCAG	2	10	267171	267180	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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298	NC_012988	CGGAC	2	10	271322	271331	20 %	0 %	40 %	40 %	254558916
299	NC_012988	TTCGG	2	10	271764	271773	0 %	40 %	40 %	20 %	254558916
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301	NC_012988	TTTGA	2	10	274128	274137	20 %	60 %	20 %	0 %	254558917
302	NC_012988	TGCCT	2	10	274241	274250	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
303	NC_012988	CTCGG	2	10	276477	276486	0 %	20 %	40 %	40 %	254558918
304	NC_012988	CGCAG	2	10	278746	278755	20 %	0 %	40 %	40 %	254558920
305	NC_012988	CGCCT	2	10	280048	280057	0 %	20 %	20 %	60 %	254558922
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325	NC_012988	CCGTG	2	10	301860	301869	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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332	NC_012988	TGAAC	2	10	307139	307148	40 %	20 %	20 %	20 %	254558954
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340	NC_012988	GCCGC	2	10	317213	317222	0 %	0 %	40 %	60 %	254558961
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343	NC_012988	CAATA	2	10	320477	320486	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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384	NC_012988	GCACG	2	10	360010	360019	20 %	0 %	40 %	40 %	254559010
385	NC_012988	GGCGC	2	10	361301	361310	0 %	0 %	60 %	40 %	254559011
386	NC_012988	TCCGG	2	10	362989	362998	0 %	20 %	40 %	40 %	254559012
387	NC_012988	CCGGC	2	10	364236	364245	0 %	0 %	40 %	60 %	254559012
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391	NC_012988	GCGAG	2	10	368118	368127	20 %	0 %	60 %	20 %	254559015
392	NC_012988	TGGCA	2	10	371253	371262	20 %	20 %	40 %	20 %	254559019
393	NC_012988	AGGCG	2	10	372451	372460	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
394	NC_012988	CCCGA	2	10	374572	374581	20 %	0 %	20 %	60 %	254559023
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397	NC_012988	CGGCC	2	10	376899	376908	0 %	0 %	40 %	60 %	254559023
398	NC_012988	GCACC	2	10	378147	378156	20 %	0 %	20 %	60 %	254559024
399	NC_012988	CGGTG	2	10	381043	381052	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
400	NC_012988	GACCT	2	10	381341	381350	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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402	NC_012988	CGGGG	2	10	384662	384671	0 %	0 %	80 %	20 %	254559031
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