MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Methylobacterium extorquens DM4 plasmid p1METDI

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012987	CTTCGA	2	12	157	168	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	254558119
2	NC_012987	ACCGGC	2	12	514	525	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	254558120
3	NC_012987	GGCCGG	2	12	3036	3047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254558123
4	NC_012987	GCTACC	2	12	5390	5401	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	254558124
5	NC_012987	GATCGA	2	12	8773	8784	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	254558126
6	NC_012987	AACCGC	2	12	9576	9587	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_012987	TCACAA	2	12	10540	10551	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	254558127
8	NC_012987	GGCGCT	2	12	12257	12268	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012987	TGAGCG	2	12	14341	14352	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	254558129
10	NC_012987	CCGGCA	2	12	14686	14697	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	254558130
11	NC_012987	CGCCTG	2	12	15429	15440	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_012987	CCTGCC	2	12	15584	15595	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_012987	CCTGCG	2	12	15939	15950	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_012987	CACCGG	2	12	19630	19641	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	254558132
15	NC_012987	AGACCG	2	12	21829	21840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012987	TCGGCG	2	12	22933	22944	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	254558133
17	NC_012987	AGCGCG	2	12	24654	24665	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	254558134
18	NC_012987	GGAGGC	2	12	30904	30915	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	254558138
19	NC_012987	ACCGCC	2	12	31241	31252	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	254558138
20	NC_012987	CTGACG	2	12	32721	32732	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012987	GCGGCT	2	12	37097	37108	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	254558141
22	NC_012987	AGGCCG	2	12	37979	37990	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	254558141
23	NC_012987	GCCTCG	2	12	38108	38119	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	254558141
24	NC_012987	GCCCGC	2	12	39426	39437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254558143
25	NC_012987	ATTTTT	2	12	42321	42332	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012987	CGGATC	2	12	42575	42586	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012987	GTCGAT	2	12	44886	44897	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_012987	ACCAGA	2	12	47193	47204	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012987	GGATGC	2	12	49203	49214	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	254558146
30	NC_012987	GGTGCT	2	12	49269	49280	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	254558146
31	NC_012987	GCCACG	2	12	49400	49411	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	254558146
32	NC_012987	GGCGAA	2	12	51493	51504	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	254558147
33	NC_012987	GCGCTC	2	12	52353	52364	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	254558148
34	NC_012987	GTTTTA	2	12	54273	54284	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012987	GCAAGC	2	12	55726	55737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012987	CGAGCG	2	12	56008	56019	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012987	TCGAAC	2	12	62671	62682	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	254558151
38	NC_012987	TGCGCA	2	12	62704	62715	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	254558151
39	NC_012987	GTTCGA	2	12	62999	63010	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_012987	ACTGGG	2	12	63619	63630	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	254558152
41	NC_012987	CCCCGC	2	12	63998	64009	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	254558152
42	NC_012987	TCGGCC	2	12	66704	66715	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	254558155
43	NC_012987	CCGACG	2	12	67438	67449	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	254558156
44	NC_012987	CGAGGG	2	12	71424	71435	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	254558160
45	NC_012987	TGCCGG	2	12	71460	71471	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	254558160
46	NC_012987	CCGACG	2	12	72628	72639	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	254558161
47	NC_012987	GCCGCT	2	12	76035	76046	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012987	GCACCG	2	12	77868	77879	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	254558164
49	NC_012987	CAGGCG	2	12	79002	79013	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	254558165
50	NC_012987	TGGAGA	2	12	79817	79828	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012987	CTCGGC	2	12	84249	84260	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	254558169
52	NC_012987	CTTCTG	2	12	84854	84865	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	254558169
53	NC_012987	CGGCCT	2	12	85723	85734	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	254558170
54	NC_012987	CCAGCC	2	12	87375	87386	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_012987	GAGGCC	2	12	89585	89596	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012987	GAACGT	2	12	90360	90371	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	254558171
57	NC_012987	CGGAGT	2	12	102666	102677	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_012987	CTCGGG	2	12	103041	103052	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	254558187
59	NC_012987	CCGCCC	2	12	103233	103244	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	254558187
60	NC_012987	CCGAGC	2	12	103741	103752	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	254558187
61	NC_012987	GCCCGC	2	12	106968	106979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254558192
62	NC_012987	GTCGCT	2	12	107153	107164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254558192
63	NC_012987	TACGGC	2	12	107280	107291	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	254558192
64	NC_012987	GTCGGG	2	12	108594	108605	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_012987	CGCCCG	2	12	108858	108869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254558193
66	NC_012987	GCCACG	2	12	109490	109501	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	254558193
67	NC_012987	TTCCCG	2	12	110834	110845	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	254558193
68	NC_012987	GTCGAG	2	12	110963	110974	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	254558193
69	NC_012987	CCGACG	2	12	111405	111416	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	254558193
70	NC_012987	TCACGG	2	12	112329	112340	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	254558193
71	NC_012987	CGCCCT	2	12	112438	112449	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	254558193
72	NC_012987	CGGCGC	2	12	112855	112866	0 %	0 %	50 %	50 %	254558193
73	NC_012987	CCGAGA	2	12	115140	115151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254558195
74	NC_012987	CGGGGC	2	12	115536	115547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254558196
75	NC_012987	AGGATC	2	12	118081	118092	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	254558200
76	NC_012987	CCGGAG	2	12	118522	118533	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	254558200
77	NC_012987	AGTTCG	2	12	120538	120549	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	254558203
78	NC_012987	GCTGGT	2	12	121538	121549	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	254558203
79	NC_012987	AGGCCC	2	12	122788	122799	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	254558203
80	NC_012987	CCTTCG	2	12	125699	125710	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	254558206
81	NC_012987	TCGATC	2	12	130164	130175	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	254558208
82	NC_012987	GTGTTG	2	12	131306	131317	0 %	50 %	50 %	0 %	254558211
83	NC_012987	GATCGC	2	12	131446	131457	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	254558211
84	NC_012987	TCGCGG	2	12	131906	131917	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	254558211
85	NC_012987	CCGGGG	2	12	131937	131948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254558211
86	NC_012987	GCATCG	2	12	133338	133349	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	254558212
87	NC_012987	CTCGCC	2	12	135937	135948	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	254558216
88	NC_012987	CTACGG	2	12	137230	137241	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	254558218
89	NC_012987	TACGGC	2	12	137261	137272	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	254558218
90	NC_012987	GGCTAT	2	12	137318	137329	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	254558218

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.